Moleculaire Biologie
Hoorcollege 1 – Cellulaire biochemie 1 – Gertjan Kramer, p49-161, 811 – 842
Het gen is nooit defect, het hee/ een andere func3e à de eiwi5en zijn defect
4 essen3ële macromoleculen à energie opslag
- Polysachariden (zetmeel en cellulose)
- Eiwi5en (aminozuren) à processen
- Nucleine zuren (DNA) à geheugen
- Membranen à bijeenhouden
Lipiden zijn geen macromoleculen want de staartlengte kan niet oneindig doorgaan
Suikers à polysacharide
Fa5y acids à membranen
Aminozuren à eiwi5en
Nucleo3des à nucleine zuren
Doorbovenop:
- Metabole intermediaire (ATP, GTP)
- Energie and redox coenzymen
ATP
Scheikunde
Belangrijke chemische groepen:
• Methyl (-CH3)
• Hydroxyl (-OH)
• Carboxyl (-COOH)
• Carbonyl (C=O)
• Phosphoryl (PO32-)
• Amino (NH2)
Atoom kern bestaat uit protonen en neutronen, de wolk eromheen elektronen
In cysteine en Methionine kunnen een disulfidebrug vormen (S-brug) à dit zorgt ervoor dat je eiwit niet
zomaar uit elkaar valt
Niet alle mogelijkheden van een keten van aminozuren is mogelijk
Je kan selecteren aan de hand van zuurheid (pH)
Onder een bepaalde pH van stoffen wordt de stof geladen en kan het
zijn lading uitvoeten
,Macro’molecule’ 2: Lipide bilaag: Amfipa3sche zelforganisa3e (hydrofiel+hydrofoob) houdt de (hydrofiele)
moleculen in de cel
Het vormt een barrière à het water kan er niet zomaar doorheen
Door middel van een sterbinding worden er vetzuren gebonden die de hydrofobe staart vormt
Welk van de onderstaande categorieën biomoleculen zijn fats en oils? Triacylglycerols
Verzadigd vetzuur à geen dubbele bindingen (slecht voor je)
Verzadigde staart zorgt ervoor dat bij kamertemperatuur de olie/ve5en vast is (boter)
Steroid kan door het celmembraan
heen en bindt aan een receptor op de
kern
Moleculen lopen van 5’ naar 3’
Waar komt de energie vandaan in die bindingen à zijn
nega3ef geladen en -& - willen juist van elkaar af, maar door
die fosfaat blijven ze bij elkaar Gibbs-energie
Het geheugen van DNA komt door complementariteit (2 strengen in tegenovergestelde), dit komt door H-
bruggen
,Verschil DNA en RNA
- DNA nucleo3den beva5en 1 OH groep minder dan RNA
- RNA moleculen beva5en nooit T nucleo3den
- RNA hee/ geen volledig complementaire RNA streng
Macromoleculen 4: Poly-suiker
Koolhydraten: Cn(H2O)m
Met Alfaamylase kan je de binding verbreken (hydrolyse)
Alfabinding staan allebei naar benenden en vormen ook Beta
de binding naar beneden
Bij het breken van een binding wordt er (ne5o) energie gevormd Alfa
Bij polymerisa3e hebben we energie nodig
• Polymerisa3on of sugars, fa5y acids, amino acids and nucleo3des is not a spontaneous process
• Requires energy (ATP) and a catalyst (polymerase)
Zwakke en sterke interac-es
Sterke interac3es:
• Twee atoomkernen delen een electron (covalente binding, bv C-C)
• Enzym nodig voor maken en breken
400 kJ/mol
, Zwakke interac3es (geen energie nodig, breken of vanzelf of bij bepaalde condi3es):
• Geen enzym nodig voor maken en breken (behalve chaperonins voor hulp bij de, juiste, vouwing!)
• Vier types
o Electrosta3sch (tegenovergestelde ladingen: + & - bij elkaar; 12 kJ/mol)
o Waterstolruggen (ladingscheiding, want de moleculen trekken niet hard genoeg aan een
atoom, waardoor er een andere binding kan worden gevormd; 4 kJ/mol)
§ Of iets oplost in water à kan het molecuul interac3e aangaan met water
§ Vormen een stroperige structuur à door H-bruggen vloeibaar
§ Bindingen zijn het sterkst als ze recht naast elkaar liggen
o Van der Waals (kleine interac3es die bij een bepaalde afstand op3maal zijn; 0.4 kJ/mol)
o Hydrofobe interac3e
Interac3es tussen macromoleculen
Wat zou je gebruiken voor nucleïnezuur complementariteit? Zwak
Wat voor eiwitstructuur? Zwak en sterk maar omkeerbaar
Wat voor membraan structuur? Zwak om water en zuursto/ransport mogelijk te houden; sterk in
noodgevallen
Wat voor membraan structuur? Zwak om water en zuursto/ransport en laterale beweging van
membraaneiwi5en mogelijk te houden; sterk in noodgevallen
Binnen een macromolecuul: sterke (permanente) interac3es: allemaal -
Hoorcollege 1 – Cellulaire biochemie 1 – Gertjan Kramer, p49-161, 811 – 842
Het gen is nooit defect, het hee/ een andere func3e à de eiwi5en zijn defect
4 essen3ële macromoleculen à energie opslag
- Polysachariden (zetmeel en cellulose)
- Eiwi5en (aminozuren) à processen
- Nucleine zuren (DNA) à geheugen
- Membranen à bijeenhouden
Lipiden zijn geen macromoleculen want de staartlengte kan niet oneindig doorgaan
Suikers à polysacharide
Fa5y acids à membranen
Aminozuren à eiwi5en
Nucleo3des à nucleine zuren
Doorbovenop:
- Metabole intermediaire (ATP, GTP)
- Energie and redox coenzymen
ATP
Scheikunde
Belangrijke chemische groepen:
• Methyl (-CH3)
• Hydroxyl (-OH)
• Carboxyl (-COOH)
• Carbonyl (C=O)
• Phosphoryl (PO32-)
• Amino (NH2)
Atoom kern bestaat uit protonen en neutronen, de wolk eromheen elektronen
In cysteine en Methionine kunnen een disulfidebrug vormen (S-brug) à dit zorgt ervoor dat je eiwit niet
zomaar uit elkaar valt
Niet alle mogelijkheden van een keten van aminozuren is mogelijk
Je kan selecteren aan de hand van zuurheid (pH)
Onder een bepaalde pH van stoffen wordt de stof geladen en kan het
zijn lading uitvoeten
,Macro’molecule’ 2: Lipide bilaag: Amfipa3sche zelforganisa3e (hydrofiel+hydrofoob) houdt de (hydrofiele)
moleculen in de cel
Het vormt een barrière à het water kan er niet zomaar doorheen
Door middel van een sterbinding worden er vetzuren gebonden die de hydrofobe staart vormt
Welk van de onderstaande categorieën biomoleculen zijn fats en oils? Triacylglycerols
Verzadigd vetzuur à geen dubbele bindingen (slecht voor je)
Verzadigde staart zorgt ervoor dat bij kamertemperatuur de olie/ve5en vast is (boter)
Steroid kan door het celmembraan
heen en bindt aan een receptor op de
kern
Moleculen lopen van 5’ naar 3’
Waar komt de energie vandaan in die bindingen à zijn
nega3ef geladen en -& - willen juist van elkaar af, maar door
die fosfaat blijven ze bij elkaar Gibbs-energie
Het geheugen van DNA komt door complementariteit (2 strengen in tegenovergestelde), dit komt door H-
bruggen
,Verschil DNA en RNA
- DNA nucleo3den beva5en 1 OH groep minder dan RNA
- RNA moleculen beva5en nooit T nucleo3den
- RNA hee/ geen volledig complementaire RNA streng
Macromoleculen 4: Poly-suiker
Koolhydraten: Cn(H2O)m
Met Alfaamylase kan je de binding verbreken (hydrolyse)
Alfabinding staan allebei naar benenden en vormen ook Beta
de binding naar beneden
Bij het breken van een binding wordt er (ne5o) energie gevormd Alfa
Bij polymerisa3e hebben we energie nodig
• Polymerisa3on of sugars, fa5y acids, amino acids and nucleo3des is not a spontaneous process
• Requires energy (ATP) and a catalyst (polymerase)
Zwakke en sterke interac-es
Sterke interac3es:
• Twee atoomkernen delen een electron (covalente binding, bv C-C)
• Enzym nodig voor maken en breken
400 kJ/mol
, Zwakke interac3es (geen energie nodig, breken of vanzelf of bij bepaalde condi3es):
• Geen enzym nodig voor maken en breken (behalve chaperonins voor hulp bij de, juiste, vouwing!)
• Vier types
o Electrosta3sch (tegenovergestelde ladingen: + & - bij elkaar; 12 kJ/mol)
o Waterstolruggen (ladingscheiding, want de moleculen trekken niet hard genoeg aan een
atoom, waardoor er een andere binding kan worden gevormd; 4 kJ/mol)
§ Of iets oplost in water à kan het molecuul interac3e aangaan met water
§ Vormen een stroperige structuur à door H-bruggen vloeibaar
§ Bindingen zijn het sterkst als ze recht naast elkaar liggen
o Van der Waals (kleine interac3es die bij een bepaalde afstand op3maal zijn; 0.4 kJ/mol)
o Hydrofobe interac3e
Interac3es tussen macromoleculen
Wat zou je gebruiken voor nucleïnezuur complementariteit? Zwak
Wat voor eiwitstructuur? Zwak en sterk maar omkeerbaar
Wat voor membraan structuur? Zwak om water en zuursto/ransport mogelijk te houden; sterk in
noodgevallen
Wat voor membraan structuur? Zwak om water en zuursto/ransport en laterale beweging van
membraaneiwi5en mogelijk te houden; sterk in noodgevallen
Binnen een macromolecuul: sterke (permanente) interac3es: allemaal -
