Samenvatting Biostatistiek practicum 2: nota’s video

BIOSTATISTIEK
VIDEO’S PRACTICUM 2
Academiejaar 2018-2019




Bronnen:
Deze samenvatting is gebaseerd op de instructievideo’s van prof. Dr. E. Fransen

,VIDEO 1 – ONGEPAARDE STUDENT T-TEST
Algem:
- = 1 van de meer ‘standaard’ hypothesetesten
- Gaat na of er een significant verschil is tussen de gemiddelde, van 2 groepen
o Vb. “Zijn mannen gemiddeld gezien groter dan vrouwen?”
- 2 variabelen:
o 1 categorische variabele van 2 niveaus hier: geslacht
o 1 continue variabele hier: lengte
- Voorwaarde:
o Data = ongepaard
o Je mag parametrisch testen (data waarop je test gaat uitvoeren is normaal verdeeld)
- H0 = “er is geen verschil tussen de gemiddelden van beide groepen”
o Heeft p-waarde waarmee je kan nagaan of je H0 moet verwerpen:
 Stel p-waarde < 0,05 -> betekend dat er WEL een verschil is tussen
gemiddelde van beide groepen
- Deze test: beetje speciaal, want heeft 2 varianten
o 1 voor gelijke varantie
o 1 voor ongelijke variantie
- Keuze tussen deze 2 varianten aan de hand van de Levene’s test!

Levene’s test:
- Test met als doel om na te gaan of de varianties van de groepen gelijk zijn of niet
- Dit is ook een hypothesetest, dus heeft ook eigen nulhypothese:
H0 = “er is geen verschil tussen de varianties”
o Heeft ook p-waarde waarmee je de H0 kan aanvaarden of verwerpen:
 p < 0,05 -> ongelijke varianties in de groepen
 P > 0,05 -> geljke varianties in de groepen
- Outcome van de Levene’s test bepaalt welke van de 2 p-waarde je moet bekijken:
o Er is een p-waarde voor gelijke & een p-waarde voor ongelijke variantie
o Door middel van de levene’s test weet je welke je moet kiezen

Beslissingsboom:
- Eerst altijd Quality control
- Verschillende stappen:
o Onderzoekvraag gaat over een verschil tussen 2 groepen
 => “verschil onafh. metingen (ongepaard)”
o Vraag: “1 continue + 1 categorische?”
 => JA!
o Vraag: “Mag je parametrisch testen?”
 => JA! (Ongepaarde student t-test = een parametrische test!)
o Vraag: “>2 groepen?”
 => NEEN! (Want exact 2 groepen)
- We komen uit bij de ongepaarde student t-test
- Vergeet niet daarna de gelijkheid van varianties na te gaan om te weten welke variant van de
ongepaarde student t-test je moet gebruiken




1

, SPSS
- Test is te vinden onder:
o Analyze > compare means > independent sample t-test
- Vb. in video: met de data set ‘indepTtest.sav’
o 2 variabelen
 Value = continue variabele (die je wilt bestuderen)
 Group = categoriche variabele (gecodeerd als 1 & 2)
- Normaal: eerst quality control doen & nagaan of je parametrisch mag werken
o Zie aparte instructievideo!
o Hier: al in orde
- Via analyze naar de t-test -> je krijgt kader met:
o Test variable(s) -> continue variabele (in vb. : “value”)
o Grouping variable -> categorische variabele (in vb. : “group”)
 Hierachter: (? ?)
 Je moet specifieren tussen welke groepen je wilt vergelijken
 Bij ons Vb.: slechts 2 groepen dus makkelijk
 ‘Define groups’ -> group 1: “1” invullen & group 2: “2” invullen
 Dan: ‘continue’
 Bij ‘options’ of ‘bootstrap’ moet je niet zijn!
 ‘OK’ klikken
o Je krijgt 2 kaders/tabellen (= output)
 1 met group statistics -> = niet zo interessant
 1 met eigenlijke test zelf -> hier: meest relevante info
- Output/resultaat:
o Zoals gezegd: 2 varianten
 ‘Equal variances assumed’
 ‘Equal variances not asumed’
o Kijken bij ‘sig. (2-tailed)’ -> 2 p-waarden (hier toevallig hetzelfde)
 1 voor gelijke varianties
 1 voor ongelijke varianties
o Juiste kiezen: ‘Levene’s test’ (ook in kader/tabel!)
 H0 was: geen verschil in varianties
 Heeft ook p-waarde (= ‘Sig’)
 Hier: p-waarde = 1, dus geen verschil in variantie
 Kijk dus naar gelijke variantie (equal variances)
 De p-waarde bij ‘equal variances assumed’ is de correte p-waarde




2