H0: Inleidende microbiologische
begrippen
Inleiding
-
- 3 domeinen
o Archaea
o Bacteria
o Eukarya: protisten, fungi, planten, dieren
Indeling / detectie micro-organismen
Obv groei op selectieve media
- Versch selectieve media zijn ontwikkeld om bepaalde, vaak ongewenste, bacteriën te
kwantificeren
- Totaal kiemgetal bepaald op niet selectief medium, kunnen geïncubeerd worden op versch
temperaturen om zo psychrofiel / mesofiel kiemgetal te bepalen
- # bacteriën uitgedrukt in kolonievormende eenheden (kve)
Obv celwand
- Gram neg: veel pathogenen (E. coli, Salmonella), vaak multiresistent tegen antibiotica, ziek
maken door infectie
- Gram pos: vb Listeria (grote peptidoglycaan laag → kan veel beter tegen extreme
omstandigheden), ziek maken door toxines aan te maken
1
,Obv vorm
Obv sporenvorming
Obv beweeglijkheid
- Obv microscopie: duurt lang → meer en meer ook kijken naar DNA
2
,Obv DNA / genoom informatie
-
o In voeding niet snel gedaan want dit kan ook op dode bacteriën & als bacteriën in
voeding dood zijn boeit het niet meer veel
o Wel meer opkomend
o Tot op stamniveau / individueel niveau bacterie kunnen bepalen
- 16S rRNA gen amplicon sequencing
o Aanwezig in alle bacteriën
o Geconserveerde & hypervariabele regio’s
o Niet heel specifiek want niet hele genoom gesequenced
o
-
3
, Nuttige en schadelijke micro-organismen
Nuttige Bedervers Pathogenen
• Opruiming afval & • Ongewenste • Ziekteverschijnselen
omzetting naar verandering bij mens
anorganische
verbindingen
• Fermentatie
(gewenste
verandering)
• Soms bewust
toegevoegd, soms
spontaan aanwezig
• Gisten: S. cerevisiae, … • Gr-: Pseudomonas, • Gr-: Salmonella,
• Melkzuurbacteriën Shewanella, … Campylobacter, E. coli,
(Gr+): • Gr+: Shigella, Yersinia
Lactobacillaceae, melkzuurbacteriën, enterocolitica, …
Streptococcus, … Clostrisium, … • Gr+: Listeria
• Schimmels: Penicillium • Gisten: Candida, monocytogenes,
roqueforti, … Saccharomyces, … Staphylococcus
• Schimmels: Penicillium, aureus, …
Aspergillus, … • Virussen: norovirus
4
begrippen
Inleiding
-
- 3 domeinen
o Archaea
o Bacteria
o Eukarya: protisten, fungi, planten, dieren
Indeling / detectie micro-organismen
Obv groei op selectieve media
- Versch selectieve media zijn ontwikkeld om bepaalde, vaak ongewenste, bacteriën te
kwantificeren
- Totaal kiemgetal bepaald op niet selectief medium, kunnen geïncubeerd worden op versch
temperaturen om zo psychrofiel / mesofiel kiemgetal te bepalen
- # bacteriën uitgedrukt in kolonievormende eenheden (kve)
Obv celwand
- Gram neg: veel pathogenen (E. coli, Salmonella), vaak multiresistent tegen antibiotica, ziek
maken door infectie
- Gram pos: vb Listeria (grote peptidoglycaan laag → kan veel beter tegen extreme
omstandigheden), ziek maken door toxines aan te maken
1
,Obv vorm
Obv sporenvorming
Obv beweeglijkheid
- Obv microscopie: duurt lang → meer en meer ook kijken naar DNA
2
,Obv DNA / genoom informatie
-
o In voeding niet snel gedaan want dit kan ook op dode bacteriën & als bacteriën in
voeding dood zijn boeit het niet meer veel
o Wel meer opkomend
o Tot op stamniveau / individueel niveau bacterie kunnen bepalen
- 16S rRNA gen amplicon sequencing
o Aanwezig in alle bacteriën
o Geconserveerde & hypervariabele regio’s
o Niet heel specifiek want niet hele genoom gesequenced
o
-
3
, Nuttige en schadelijke micro-organismen
Nuttige Bedervers Pathogenen
• Opruiming afval & • Ongewenste • Ziekteverschijnselen
omzetting naar verandering bij mens
anorganische
verbindingen
• Fermentatie
(gewenste
verandering)
• Soms bewust
toegevoegd, soms
spontaan aanwezig
• Gisten: S. cerevisiae, … • Gr-: Pseudomonas, • Gr-: Salmonella,
• Melkzuurbacteriën Shewanella, … Campylobacter, E. coli,
(Gr+): • Gr+: Shigella, Yersinia
Lactobacillaceae, melkzuurbacteriën, enterocolitica, …
Streptococcus, … Clostrisium, … • Gr+: Listeria
• Schimmels: Penicillium • Gisten: Candida, monocytogenes,
roqueforti, … Saccharomyces, … Staphylococcus
• Schimmels: Penicillium, aureus, …
Aspergillus, … • Virussen: norovirus
4
