• Wrong document? Swap it for free
  • Written by students who passed
  • Immediately available after payment
  • Read online or as PDF
Sell
Where do you study
Your language
Document preview thumbnail
Preview 3 out of 35 pages
Summary

Volledige samenvatting Toegepaste Biostatistiek KU Leuven (BKULE09Y3A), prof. Vercauteren, incl. regressie, ANOVA, logistieke regressie en survival analysis

Document preview thumbnail
Preview 3 out of 35 pages

Volledige samenvatting van de hoorcolleges Toegepaste Biostatistiek (BKULE09Y3A) van prof. Vercauteren, KU Leuven, Biomedische Wetenschappen. 35 pagina's met figuren uit de PowerPoints, uitgewerkte voorbeelden met R output en aanduidingen van wat op het examen gevraagd wordt. Behandelt enkelvoudige en meervoudige lineaire regressie (kleinste kwadraten, F-test, t-test, R², intervallen, residuele plots, Cook's distance), Pearson en Spearman correlatie en de Fisher Z-test, one-way ANOVA (fixed en random effects, lineaire contrasten, Bonferroni, Scheffé), Kruskal-Wallis, two-way ANOVA en ANCOVA, epidemiologische studiedesigns, risk ratio en odds ratio, confounding en Mantel-Haenszel, logistieke regressie met sensitiviteit, specificiteit en ROC-curve, longitudinale data-analyse, de chi-kwadraattest, incidence rate ratio en survival analysis (hazard rates, Kaplan-Meier, censoring).

Content preview

1 Regressie en correlatie
Correlatie = nagaan of er een verband is tussen variabelen. Regressie = met predictor
variabele(n) een andere variabele voorspellen, wat ook toelaat om het verband nog
dieper na te gaan (kwantificeren van effect).

1.1 Enkelvoudige lineaire regressie (1 x en 1 y)
= 1 variabele waarmee we de andere willen voorspellen.

Voorbeeld = esteriol niveau (x) gemeten bij zwangere vrouwen proberen
correleren/verband zoeken met het geboortegewicht (y) van de baby’s. Door de
puntenwolk fitten we een rechte (als x stijgt zal y ook stijgen) y = α + βx om y te
proberen voorspellen in functie van x.

Deze rechte fitten gebeurd via bepaalde regels zie later zodat dit correct gebeurd. X is de
onafhankelijke variabele, y is de afhankelijk variabele (y hangt af van x), alfa is de
plaats op de y-as waar de rechte doorgaat (intercept) en bèta de richtingscoëfficiënt.




De echte geboortegewichten zullen in de praktijk afwijken van je voorspelde waarde, bij
1 predictor (x) kunnen dus verschillende responsen (y) zijn. We gaan de rechte zodanig
fitten dat deze responsen/afwijkingen/error ‘s (bv. 3 kg voorspeld en 3,2 in echt =>
error van 200 gram) rond de rechte afwijken volgens een normaal verdeling met
gemiddelde 0 (top gauss curve) -> de meest verwachte respons ligt op de gefitte rechte
(dus de voorspelde waarde) = top van de gauss curve. Idealiter is er geen afwijking, wat
wilt zeggen dat e (foutterm) = 0 voor alle waarnemingen. Daarnaast moet de
spreiding/variantie (σ2) van de foutentermen overal gelijk zijn (de breedte van elke
gauss curve) = homoscedasticiteit.

y = α + βx + e -> hoe vindt je alfa en bèta bij het opstellen van een regressielijn?

1.1.1 Regressielijn fitten – Method of Least Squares (kleinste kwadraten)


Gemeten waarde (xi,yi) en voorspelde waarde (xi,
ŷi) hebben een afwijking di (= foutterm e). We
willen een perfecte rechte, dus de som van de Di’s
zo klein mogelijk. Deze fouttermen kunnen +
(boven rechte) of – zijn, waardoor ze bij optellen
elkaar te niet kunnen doen. Daarom nemen we de
gekwadrateerde som (eerst kwadraat nemen en dan
optellen) van de eerste (i = 1) tot nde fout.

De least squares line is de regressielijn waarbij de
gekwadrateerde som het kleinst is.

,Om de alfa en bèta te bepalen van de regressielijn met de kleinst di som moeten er
zaken berekend worden (zie formularium):




EXAMEN = krijgt 3 observaties -> schrijf de vgl van de regressielijn op




Interpretatie resultaten (examen): als esteriol niveau 0 is, is het geboortegewicht
21,52 ofwel 2 kilo 152 g. Richtingscoëfficiënt = snelheid van stijgen of dalen in grafiek ->
y = birthweight(in hg) and x = estriol level (in mg/24hr)

- Als we 1 mg/dag meer esteriol produceren, neemt geboortegewicht gemiddeld
met 0,61 g toe (positief dus toename).
- What is the predicted birthweight if a pregnant woman has an estriol level of 10
mg/24h? = 2760g
- For what estriol level would the predicted birthweight be 4.5 kg (45hg) =
39mg/24hr

1.1.2 Significantie richtingscoëfficiënt nagaan

Is dit de juiste rechte? Als we het experiment opnieuw doen, krijgen we dan geen andere
rechte (bv. dalend)? Is de coëfficiënt dus statistisch significant verschillend van 0? Dit
getal zegt niets over p-waarde! We moeten een hypothese test uitvoeren:

H0: β = 0 (geen effect van x op y) H1: β ≠ 0 (statistisch significant effect x op y)

Teststatistiek zal onder de nulhypothese (als deze dus waar is) een bepaalde verdeling
volgen (bv. F-verdeling). Daarnaast kan je de p-waarde nagaan = kans dat onze 0,608
zich voordoet onder de veronderstelling dat H0 waar is. Als deze kans heel klein is
(< 0,05), dan geloven we dit niet! Dus verwerpen we H0.

Regressielijn bevat altijd punt (x̄ , ȳ ) dus waar x̄
is ligt ȳ

Sample point (xi,yi) = eender welk gemeten punt

Residual component = yi – ŷi -> gemeten min
voorspelde waarde

Regression component = ŷi - ȳ -> voorspelde
min gemiddelde

Total component = yi - ȳ

, Door ANOVA te doen kan je ook aan deze zaken
komen + F-test statistiek (zie R studio)

We weten nu hoe we de 3 zaken berekenen voor 1 punt, als we dit willen berekenen voor
alle punten:

Residual sum of squares/Res SS: Regression sum of squares/Reg SS:




Total sum of squares/TotalSS/Lyy: Total SS = Reg SS + Res SS

 wilt dat Res SS zo klein mogelijk is (= zo weinig
mogelijk fouten) en Reg SS zo groot mogelijk om een significante
regressie lijn te hebben
 Teststatistiek: RegSS/ResSS -> P-waarde, als RegSS groot is kan je H0 wss
verwerpen




1.1.3 F-test voor enkelvoudige lineaire regressie

Vertelt hoe goed rechte fit door datawolk (significant of niet, kunnen we iets doen met
ons model?). Zoals daarnet vermeld gaan we RegSS / ResSS uitvoeren. Maar eerst:

- Regression mean square (Reg MS) = Reg SS / k (aantal x-variabelen)

- Residual mean square (Res MS) = Res SS / (n-k-1) (# vrijheidsgraden – aantal x-
variabelen – 1)

 Reg MS / Res MS = F-teststatistiek




Als de F test niet significant
is, is het model in principe
niet bruikbaar voor
voorspelling of verklaring.




(zie formularium)

Examen: zie daarnet 3 rijtjes -> bereken Lxx, Lyy, Lxy om f-waarde te bekomen en zo
uw hypothesetest uit te voeren (ook tekenen zie hieronder!!)

1) Kritieke waarde (F, zie formularium) zoeken

F k, n-k-1, 1-a  F 1;29;0,95 (opzoeken in tabel) = 4,17 (getal wat overeenkomt met het 95 ste
percentiel, dus opp. tussen 0 en dit getal is 95 procent)

Table of contents

  1. 01 1 Regressie en correlatie 1
    1. 1.1 Enkelvoudige lineaire regressie (1 x en 1 y) 1
    2. 1.2 Meervoudige regressie (meerdere x’en en 1 y) 9
    3. 1.3 Correlatie coëfficiënt 12
    4. 1.4 Niet-parameterische Spearman correlatie coëfficiënt 14
  2. 02 2 Multisample inference 15
    1. 2.1 One-way ANOVA – fixed effects model 15
    2. 2.2 Relatie tussen One-way ANOVA en meervoudige regressie 20
    3. 2.3 Two-way ANOVA 21
  3. 03 3 Design and Analysis Techniques for Epidemiologic Studies 24
    1. 3.1.1 Opmaken 2x2 tabel 25
    2. 3.2 Confounding 25
    3. 3.3 Meervoudige logistieke regressie 27
    4. 3.4 Longitudinale data analyse 30
  4. 04 4 Hypothese testing: Person-Time data 32
    1. 4.1 Chi-kwadraat test 32
    2. 4.2 Measure of effect for person-time data 33
    3. 4.3 Survival analysis 34

Document information

Study
Uploaded on
July 7, 2025
Number of pages
35
Written in
2024/2025
Type
Summary
$17.25

Wrong document? Swap it for free Within 14 days of purchase and before downloading, you can choose a different document. You can simply spend the amount again.
Written by students who passed
Immediately available after payment
Read online or as PDF

Seller avatar
Reputation scores are based on the amount of documents a seller has sold for a fee and the reviews they have received for those documents. There are three levels: Bronze, Silver and Gold. The better the reputation, the more your can rely on the quality of the sellers work.
robindhaeyer
5.0
(1)
Sold
29
Followers
2
Items
15
Last sold
1 day ago



Why students choose Stuvia

Created by fellow students, verified by reviews

Quality you can trust: written by students who passed their tests and reviewed by others who've used these notes.

Didn't get what you expected? Choose another document

No worries! You can instantly pick a different document that better fits what you're looking for.

Pay as you like, start learning right away

No subscription, no commitments. Pay the way you're used to via credit card and download your PDF document instantly.

Student with book image

“Bought, downloaded, and aced it. It really can be that simple.”

Alisha Student

Working on your references?

Create accurate citations in APA, MLA and Harvard with our free citation generator.

Working on your references?

Frequently asked questions