1. Aan de hand van een gegeven figuur de full-sib selectie bij kruisbevruchters
uitleggen.
2. AFLP genotypering uitleggen (figuur!), waarvoor kan dit gebruikt worden?
3. Backcrossing: Wat is het? Hoe doe je het? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe
kunnen moleculaire merkers helpen?
4. Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp
van de figuur in de cursus. De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij
hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.
5. Brassicaceae type zelf incompatibiliteit. Moleculair/genetisch/cellulair
mechanisme
6. CGMS uitleggen via schema, vergelijk met CMS
7. CO-interferentie bij linkage mapping
8. Dominantie epistasie
9. Family selection: leg uit.
10. Geef het Solonaceae type zelf incompatibiliteit, moleculair en cellulair. Is
dit gametofytisch of sporofytisch? is dit self recognition based of non-self? Wat
zijn de complicaties in veredeling voor gewassen met dit soort ZI.
11. Geef uitleg bij afbeelding van bulk bij zelfbevruchters. Waarom is de bulk
methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming?
12. Hoe kunnen kwantitatieve trait loci (QTL) worden gebruikt in
plantenveredeling voor het verbeteren van een specifieke eigenschap? Leg uit
hoe QTL-mapping werkt via Bulked Segregant Analysis (BSA). Wat houdt BSA in
en waarom moet de aanpak van QTL-mapping worden aangepast afhankelijk
van het fenotypische kenmerk? Bespreek de voor- en nadelen van Simple QTL
en SPA (Selective Phenotyping Approach) mapping. Hoe kun je met behulp van
een merker, gelinkt aan een QTL op een genenkaart, gericht selecteren in een
veredelingsprogramma?
13. Hoe kunnen merkers worden ingezet om de ploïdiegraad van planten te
bepalen, en speelt het hierbij een rol of de plant een zelfbevruchter of
kruisbevruchter is? Zijn merkers even efficiënt bij het onderscheiden van
alloploïden en autoploïden? Welke van deze ploïdieën resulteert in meer
genetische diversiteit bij zelfbevruchtende planten: allotetraploïdie of
autotetraploïdie? Wat is het belang van crossing-over in plantenveredeling, en
hoe beïnvloeden allotetraploïdie en autotetraploïdie dit proces?
14. Hoe worden merkers gebruikt voor verwantschapsonderzoek en de
identificatie van cultivars? Welke soorten merkers worden toegepast voor
verwantschapstesten en het opstellen van genenkaarten? Bespreek de voor- en
nadelen van deze merkers. Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie
aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? Welke moleculaire
merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan?
15. Hoe wordt een F1-hybride ontwikkeld, en wat zijn de stappen in het
proces? Bespreek het gebruik van een 3-lijnsysteem in detail, inclusief het
biologische fenomeen waarop dit is gebaseerd, en vergelijk dit met een 2-
lijnsysteem. Wat is de rol van F1-steriliteit en waarom is genotype-omgeving-
interactie (GxE) hierbij belangrijk? Leg het mechanisme van zaadlethaliteit door
een triploïde blokkade uit, inclusief de biochemische werking. Waarom vormt dit
uitleggen.
2. AFLP genotypering uitleggen (figuur!), waarvoor kan dit gebruikt worden?
3. Backcrossing: Wat is het? Hoe doe je het? Waarvoor wordt het gebruikt? Hoe
kunnen moleculaire merkers helpen?
4. Bespreek de aanmaak van hybride cultivars aan de hand van CMS met behulp
van de figuur in de cursus. De keuze van de ouderlijnen en inteeltlijnen bij
hybride cultivars kan voor problemen zorgen. Bespreek.
5. Brassicaceae type zelf incompatibiliteit. Moleculair/genetisch/cellulair
mechanisme
6. CGMS uitleggen via schema, vergelijk met CMS
7. CO-interferentie bij linkage mapping
8. Dominantie epistasie
9. Family selection: leg uit.
10. Geef het Solonaceae type zelf incompatibiliteit, moleculair en cellulair. Is
dit gametofytisch of sporofytisch? is dit self recognition based of non-self? Wat
zijn de complicaties in veredeling voor gewassen met dit soort ZI.
11. Geef uitleg bij afbeelding van bulk bij zelfbevruchters. Waarom is de bulk
methode hiervoor meer geschikt dan de enkel-zaad afstamming?
12. Hoe kunnen kwantitatieve trait loci (QTL) worden gebruikt in
plantenveredeling voor het verbeteren van een specifieke eigenschap? Leg uit
hoe QTL-mapping werkt via Bulked Segregant Analysis (BSA). Wat houdt BSA in
en waarom moet de aanpak van QTL-mapping worden aangepast afhankelijk
van het fenotypische kenmerk? Bespreek de voor- en nadelen van Simple QTL
en SPA (Selective Phenotyping Approach) mapping. Hoe kun je met behulp van
een merker, gelinkt aan een QTL op een genenkaart, gericht selecteren in een
veredelingsprogramma?
13. Hoe kunnen merkers worden ingezet om de ploïdiegraad van planten te
bepalen, en speelt het hierbij een rol of de plant een zelfbevruchter of
kruisbevruchter is? Zijn merkers even efficiënt bij het onderscheiden van
alloploïden en autoploïden? Welke van deze ploïdieën resulteert in meer
genetische diversiteit bij zelfbevruchtende planten: allotetraploïdie of
autotetraploïdie? Wat is het belang van crossing-over in plantenveredeling, en
hoe beïnvloeden allotetraploïdie en autotetraploïdie dit proces?
14. Hoe worden merkers gebruikt voor verwantschapsonderzoek en de
identificatie van cultivars? Welke soorten merkers worden toegepast voor
verwantschapstesten en het opstellen van genenkaarten? Bespreek de voor- en
nadelen van deze merkers. Moleculaire merkers kunnen helpen om een collectie
aan te maken voor veredeling, welke zou je gebruiken? Welke moleculaire
merkers kan je gebruiken om raszuiverheid na te gaan?
15. Hoe wordt een F1-hybride ontwikkeld, en wat zijn de stappen in het
proces? Bespreek het gebruik van een 3-lijnsysteem in detail, inclusief het
biologische fenomeen waarop dit is gebaseerd, en vergelijk dit met een 2-
lijnsysteem. Wat is de rol van F1-steriliteit en waarom is genotype-omgeving-
interactie (GxE) hierbij belangrijk? Leg het mechanisme van zaadlethaliteit door
een triploïde blokkade uit, inclusief de biochemische werking. Waarom vormt dit
