Chapitre 1 : Les microorganismes dans l’environnement.
Environnement = aussi aliment
I) Microorganismes et structures des milieux naturels.
Les milieux naturels correspondent aux sols, lacs, rivières et océans…
En milieux naturel il y a deux réactions principales :
1 : CO2 + composé inorganique → Matière organique (MO)
2 : Matière organique → décomposition par des organismes pour avoir de nouveau la
réaction inverse.
Par exemple la photosynthèse
Les deux activités combinées sont réalisées par des organismes supérieurs associés à des
microorganismes.
Les consommateurs supérieurs comme les Hommes dépendent des deux réactions.
Les photoautotrophes et chimiohétérotrophes font la réaction 1.
Schéma : rôle écologique des microorganismes.
Le CO2 est capté pour fabriquer de la matière organique, cela nécessite l’intervention de
microorganismes et d’organismes on parle alors de producteurs primaires. La dégradation se
fait en plusieurs étapes, les champignons et les bactéries commencent la dégradation et
donne du CO2. Mais ils ne dégradent qu’une partie, l’autre partie est partiellement dégradée
par les consommateurs primaires, le reste est envoyé aux consommateurs secondaires…
Dans chaque étape de dégradation il y a fabrication de CO2.
II) Répartition et biomasse.
, Plus de matière organique signifie plus de microorganismes.
Organismes Nombre / g sol sec Biomasse (g/m3)
BACTERIES 108
Azotobacter chroococcum 160
Pseudomonas fluorescent 160
ACTINOMYCENES 105 à 106 n.d.
CHAMPIGNONS 105
Saccharomyces cereviae 200
ALGUES 104 à 105 32
Chlorella vulgaris
PROTOZOAIRES 104 38
Tableau : organisme du sol et leur biomasse.
Retenir ordre de grandeur des bactéries, champignons, algues…
Remarque : cela reste une moyenne entre les différents sols.
Quels paramètres influencent le nombre de microorganismes présent dans un échantillon ?
Biomasse des organismes du sol (Kg/Ha) dans une prairie à fertilité élevée (valeurs estimées)
Bactéries 3 000
Champignons 4 000
Protozoaires 380
Nématodes 120
Vers de terre 1 320
Invertébrés divers 480
Profondeur Profondeur
Dénombrement 103
3 - 8 cm 135 – 145 cm
Bactéries aérobies 7 800 1
Bactéries anaérobies 1 950 1
Actinomycètes 2 080 1
Champignons 119 3
Algues 25
Toutes les bactéries ne sont pas exposées de la même manière au niveau d’un site ou d’un
échantillon.
Explication de la répartition des microorganismes dans le sol :
Lumière (Photosynthèse importante pour les algues : besoin de lumière, absentes en
profondeur).
Oxygène : dans les premiers cm du sol on constate la présence plus importante de
bactéries aérobies.
Environnement = aussi aliment
I) Microorganismes et structures des milieux naturels.
Les milieux naturels correspondent aux sols, lacs, rivières et océans…
En milieux naturel il y a deux réactions principales :
1 : CO2 + composé inorganique → Matière organique (MO)
2 : Matière organique → décomposition par des organismes pour avoir de nouveau la
réaction inverse.
Par exemple la photosynthèse
Les deux activités combinées sont réalisées par des organismes supérieurs associés à des
microorganismes.
Les consommateurs supérieurs comme les Hommes dépendent des deux réactions.
Les photoautotrophes et chimiohétérotrophes font la réaction 1.
Schéma : rôle écologique des microorganismes.
Le CO2 est capté pour fabriquer de la matière organique, cela nécessite l’intervention de
microorganismes et d’organismes on parle alors de producteurs primaires. La dégradation se
fait en plusieurs étapes, les champignons et les bactéries commencent la dégradation et
donne du CO2. Mais ils ne dégradent qu’une partie, l’autre partie est partiellement dégradée
par les consommateurs primaires, le reste est envoyé aux consommateurs secondaires…
Dans chaque étape de dégradation il y a fabrication de CO2.
II) Répartition et biomasse.
, Plus de matière organique signifie plus de microorganismes.
Organismes Nombre / g sol sec Biomasse (g/m3)
BACTERIES 108
Azotobacter chroococcum 160
Pseudomonas fluorescent 160
ACTINOMYCENES 105 à 106 n.d.
CHAMPIGNONS 105
Saccharomyces cereviae 200
ALGUES 104 à 105 32
Chlorella vulgaris
PROTOZOAIRES 104 38
Tableau : organisme du sol et leur biomasse.
Retenir ordre de grandeur des bactéries, champignons, algues…
Remarque : cela reste une moyenne entre les différents sols.
Quels paramètres influencent le nombre de microorganismes présent dans un échantillon ?
Biomasse des organismes du sol (Kg/Ha) dans une prairie à fertilité élevée (valeurs estimées)
Bactéries 3 000
Champignons 4 000
Protozoaires 380
Nématodes 120
Vers de terre 1 320
Invertébrés divers 480
Profondeur Profondeur
Dénombrement 103
3 - 8 cm 135 – 145 cm
Bactéries aérobies 7 800 1
Bactéries anaérobies 1 950 1
Actinomycètes 2 080 1
Champignons 119 3
Algues 25
Toutes les bactéries ne sont pas exposées de la même manière au niveau d’un site ou d’un
échantillon.
Explication de la répartition des microorganismes dans le sol :
Lumière (Photosynthèse importante pour les algues : besoin de lumière, absentes en
profondeur).
Oxygène : dans les premiers cm du sol on constate la présence plus importante de
bactéries aérobies.
