HOOFDSTUK 3 : ENZYMES
1. What are enzymes and how do they operate
1.1. Enzymology Has a Rich History
Bv sucrose : conversie van sucrose naar CO2 en H2O in bijzijn van zuurstof is heel exergonisch
(ΔG<0), het zorgt voor energie dat een organisme nodig heeft
MAAR een zak suiker kan wel jarenlang in de kast staan
1.2. Nearly All Enzymes Are Proteins and They Are Classified by the
Reactions They Catalyse
Met uitzondering van enkele RNA moleculen, zijn alle enzymes proteïnen dus catalytic
activity is afhankelijk van de primaire, secundaire, tertiaire en quaternaire structuur als
een enzym gedenatureerd/gedissocieerd in subunits is de catalytic activity verdwenen
Enzymen binden substraten met hoge stereospecifiteit en voeren een chemische reactie uit
waarbij deze omgezet worden in producten
De substraat binding site is de plaats waar de chemische reactie zal plaatsvinden en is gekend
als de active site
De meeste enzymen hebben een cofactor (of coenzyme) nodig voor de activiteit
In afwezigheid van de cofactor wordt het enzym apo-enzyme genoemd , in aanwezigheid
holo-enzyme
Cofactor = anorganisch ion of coenzyme nodig voor de enzym activiteit
Coenzyme = organische cofactor nodig voor de actie van bepaalde enzymes (vaak als
vitamine component)
Meeste water oplosbare vitaminen gedragen zich als cofactoren (vetoplosbare niet)
Enzymes eindigen op -ase (bv ribonuclease)
Enzymen worden geclassificeerd volgens de reacties die ze kataliseren
1.3. Enzymes Are Highly Specific Catalysts That Affect Reactions
Rates, Not Reaction ΔG
Zonder enzymes/katlyse kunnen biochemische reacties niet doorgaan in goede tijdlijn en zou
leven niet kunnen bestaan
Het enzym blijft hetzelfde nadat de reactie heeft plaatsgevonden
, een simpele enzymatische reactie waarbij één substraat geconverteerd wordt in een product
Het is exergonisch maar dat betekent niet dat de conversie van S in P op een waarneembare
tijd gebeurd de snelheid van de reactie is afhankelijk van de hoogte van de energie barrier
Het hoogste punt is de transitie toestand verschil in Gibss vrije energie tussen substraat en
transition state = activation energy
Hogere activatie energie tragere reactie
Enzymes katalyseren reactie door het stabiliseren van de transition state en dus het verlagen
van de Gibss vrije energie verlagen activatie energie en dus sneller
De ES en EP complexen kunnen gezien worden als reaction intermediates
De overall reaction rate wordt bepaald door de stap met de hoogste activatie energie of
traagste snelheidsconcstante (rate-limiting step)
1. What are enzymes and how do they operate
1.1. Enzymology Has a Rich History
Bv sucrose : conversie van sucrose naar CO2 en H2O in bijzijn van zuurstof is heel exergonisch
(ΔG<0), het zorgt voor energie dat een organisme nodig heeft
MAAR een zak suiker kan wel jarenlang in de kast staan
1.2. Nearly All Enzymes Are Proteins and They Are Classified by the
Reactions They Catalyse
Met uitzondering van enkele RNA moleculen, zijn alle enzymes proteïnen dus catalytic
activity is afhankelijk van de primaire, secundaire, tertiaire en quaternaire structuur als
een enzym gedenatureerd/gedissocieerd in subunits is de catalytic activity verdwenen
Enzymen binden substraten met hoge stereospecifiteit en voeren een chemische reactie uit
waarbij deze omgezet worden in producten
De substraat binding site is de plaats waar de chemische reactie zal plaatsvinden en is gekend
als de active site
De meeste enzymen hebben een cofactor (of coenzyme) nodig voor de activiteit
In afwezigheid van de cofactor wordt het enzym apo-enzyme genoemd , in aanwezigheid
holo-enzyme
Cofactor = anorganisch ion of coenzyme nodig voor de enzym activiteit
Coenzyme = organische cofactor nodig voor de actie van bepaalde enzymes (vaak als
vitamine component)
Meeste water oplosbare vitaminen gedragen zich als cofactoren (vetoplosbare niet)
Enzymes eindigen op -ase (bv ribonuclease)
Enzymen worden geclassificeerd volgens de reacties die ze kataliseren
1.3. Enzymes Are Highly Specific Catalysts That Affect Reactions
Rates, Not Reaction ΔG
Zonder enzymes/katlyse kunnen biochemische reacties niet doorgaan in goede tijdlijn en zou
leven niet kunnen bestaan
Het enzym blijft hetzelfde nadat de reactie heeft plaatsgevonden
, een simpele enzymatische reactie waarbij één substraat geconverteerd wordt in een product
Het is exergonisch maar dat betekent niet dat de conversie van S in P op een waarneembare
tijd gebeurd de snelheid van de reactie is afhankelijk van de hoogte van de energie barrier
Het hoogste punt is de transitie toestand verschil in Gibss vrije energie tussen substraat en
transition state = activation energy
Hogere activatie energie tragere reactie
Enzymes katalyseren reactie door het stabiliseren van de transition state en dus het verlagen
van de Gibss vrije energie verlagen activatie energie en dus sneller
De ES en EP complexen kunnen gezien worden als reaction intermediates
De overall reaction rate wordt bepaald door de stap met de hoogste activatie energie of
traagste snelheidsconcstante (rate-limiting step)
