moleculaire biologie: hoofdstuk 4 transcriptie
1) RNA
RNA is afschrift van DNA, heeft andere kenmerken
▪ nucleotide-basen: ACG, U ipv T
▪ geen deoxyribose maar een ribose
▪ op 2’ en 3’ een OH (2’ is verschil met DNA)
▪ enkelstrengig en korter dan DNA
▪ door de OH op 2’ is RNA heel onstabiel
▪ kan soms dubbelstrengig worden door hybridisatie
complexe 3D-structuren
1.1 welk RNA codeert voor DNA?
hypothese: ribosomaal RNA
experiment: op E. Coli
1. E. Coli groeien in medium met N14 en C12 = normale situatie
ribosomen in CaCl op bepaalde hoogte
2. E. Coli in medium met N15 en C13 = niet radioactief maar hogere densiteit
ribosomen liggen lager in proefbuis dan normaal (= hogere densiteit)
3. E. Coli van proefje 2 in medium met N14 en C12
er zijn nieuwe en oude ribosomen aanwezig in proefbuis
4. E. coli van proefje 2 in medium met N14 en C12 + bacteriofagen
maken enkel nog bacteriofaageiwitten
hypothese = nieuwe ribosomen die radioactief en lichter zijn (hoger in proefbuis)
echte situatie = geen nieuwe ribosomen gemaakt maar bestaande ribosomen
associeerden met oude ribosomen
→ messenger RNA is het coderende RNA voor DNA
transcriptie = RNA maken op basis van DNA
translatie = tot expressie komen tot vorming eiwitten
extra: RNA hybridiseren met DNA → delen mRNA
van virus zal hybridiseren met delen van DNA
, moleculaire biologie: hoofdstuk 4 transcriptie
2) transcriptie
2.1 maken van RNA
▪ ribosomaal RNA = rRNA
▪ messenger RNA = mRNA
▪ transfer RNA = tRNA
→ enzym: RNA-polymerase gebruiken rNTP’s als substraat om RNA te maken
▪ rNTP = ribose (2’OH) nucleotide trifosfaten
om polymeren te maken (op zelfde manier als dNTP’s)
α-fosfaat wordt verbonden met 3’-OH uiteinde
▪ template is DNA maar hebben geen 3’-OH uiteindes
nodig om te starten
▪ prokaryoten hebben één soort RNA-polymerase
o 2 α-subeenheden die basisstructuur vormen
o β-subeenheid voor rNTP herkenning en binding
o β’- subeenheid die polymerisatie kan uitvoeren
▪ eukaryoten hebben RNA-pol1, 2 en 3
o 1: transcriptie van rRNA genen
o 2: transcriptie van mRNA genen (eiwitcoderende)
o 3: transcriptie van tRNA en snRNA genen
2.2 RNA-synthese
op basis van DNA wordt een RNA-streng gemaakt
1. anti parallelle DNA-streng denatureert de streng
2. RNA-polymerase maakt kopie op basis van onderste streng:
schuift altijd van links naar rechts, aan 3’OH wordt het RNA verlengd
3. aan ander uiteinde wordt RNA van DNA losgemaakt en DNA weer aan elkaar gehangen
1) RNA
RNA is afschrift van DNA, heeft andere kenmerken
▪ nucleotide-basen: ACG, U ipv T
▪ geen deoxyribose maar een ribose
▪ op 2’ en 3’ een OH (2’ is verschil met DNA)
▪ enkelstrengig en korter dan DNA
▪ door de OH op 2’ is RNA heel onstabiel
▪ kan soms dubbelstrengig worden door hybridisatie
complexe 3D-structuren
1.1 welk RNA codeert voor DNA?
hypothese: ribosomaal RNA
experiment: op E. Coli
1. E. Coli groeien in medium met N14 en C12 = normale situatie
ribosomen in CaCl op bepaalde hoogte
2. E. Coli in medium met N15 en C13 = niet radioactief maar hogere densiteit
ribosomen liggen lager in proefbuis dan normaal (= hogere densiteit)
3. E. Coli van proefje 2 in medium met N14 en C12
er zijn nieuwe en oude ribosomen aanwezig in proefbuis
4. E. coli van proefje 2 in medium met N14 en C12 + bacteriofagen
maken enkel nog bacteriofaageiwitten
hypothese = nieuwe ribosomen die radioactief en lichter zijn (hoger in proefbuis)
echte situatie = geen nieuwe ribosomen gemaakt maar bestaande ribosomen
associeerden met oude ribosomen
→ messenger RNA is het coderende RNA voor DNA
transcriptie = RNA maken op basis van DNA
translatie = tot expressie komen tot vorming eiwitten
extra: RNA hybridiseren met DNA → delen mRNA
van virus zal hybridiseren met delen van DNA
, moleculaire biologie: hoofdstuk 4 transcriptie
2) transcriptie
2.1 maken van RNA
▪ ribosomaal RNA = rRNA
▪ messenger RNA = mRNA
▪ transfer RNA = tRNA
→ enzym: RNA-polymerase gebruiken rNTP’s als substraat om RNA te maken
▪ rNTP = ribose (2’OH) nucleotide trifosfaten
om polymeren te maken (op zelfde manier als dNTP’s)
α-fosfaat wordt verbonden met 3’-OH uiteinde
▪ template is DNA maar hebben geen 3’-OH uiteindes
nodig om te starten
▪ prokaryoten hebben één soort RNA-polymerase
o 2 α-subeenheden die basisstructuur vormen
o β-subeenheid voor rNTP herkenning en binding
o β’- subeenheid die polymerisatie kan uitvoeren
▪ eukaryoten hebben RNA-pol1, 2 en 3
o 1: transcriptie van rRNA genen
o 2: transcriptie van mRNA genen (eiwitcoderende)
o 3: transcriptie van tRNA en snRNA genen
2.2 RNA-synthese
op basis van DNA wordt een RNA-streng gemaakt
1. anti parallelle DNA-streng denatureert de streng
2. RNA-polymerase maakt kopie op basis van onderste streng:
schuift altijd van links naar rechts, aan 3’OH wordt het RNA verlengd
3. aan ander uiteinde wordt RNA van DNA losgemaakt en DNA weer aan elkaar gehangen
