Hoorcollege Genoominstabiliteit
Aniek Janssen UMC
Instabiliteit = continuous changes to the genome
terwijl normaal wil je dat het DNA stabiel is en niet verandert
Chromosomale instability
- Anauploidy = abnormale hoeveelheid chromosomen
- Op chromosomal niveau
- Extra chromosoom erbij
- Chromosoom minder
Nucleotide instability
Anauploidy = abnormale hoeveelheid chromosomen
extra oncogenen
verlies tumor suppressor genen
Functie eiwit veranderd
Aneuploidy is caused by chromosome missegregations
Misalignment chromosome ongelijke verdeling chromosome
Aanwezige metabolieten in de cel kunnen carcinogen zijn
- Formaldehyde
Roet bevat carcinogenen betere bescherming
Chromium zat in verf
DNA schades aan 1 kant van de streng:
1: Mismatch repair
- Na DNA replicatie, wanneer een verkeerde base is
geincopereerd kan niet baseparen
EXO1 = knipt DNA base gaat weg
2: Base exision repair
- Subtielere verandering; gemethyleerde base
3: Nucleotide exision repair
Thymine dimeer = Covalente binding tussen de T basen
Detecteren van dsDNA breuk: NHEJ, HR
NHEJ kan leiden tot korte inserties of deleties
- Snel
- Niet nauwkeurig
Hoorcollege deel 2
Aniek Janssen UMC
Instabiliteit = continuous changes to the genome
terwijl normaal wil je dat het DNA stabiel is en niet verandert
Chromosomale instability
- Anauploidy = abnormale hoeveelheid chromosomen
- Op chromosomal niveau
- Extra chromosoom erbij
- Chromosoom minder
Nucleotide instability
Anauploidy = abnormale hoeveelheid chromosomen
extra oncogenen
verlies tumor suppressor genen
Functie eiwit veranderd
Aneuploidy is caused by chromosome missegregations
Misalignment chromosome ongelijke verdeling chromosome
Aanwezige metabolieten in de cel kunnen carcinogen zijn
- Formaldehyde
Roet bevat carcinogenen betere bescherming
Chromium zat in verf
DNA schades aan 1 kant van de streng:
1: Mismatch repair
- Na DNA replicatie, wanneer een verkeerde base is
geincopereerd kan niet baseparen
EXO1 = knipt DNA base gaat weg
2: Base exision repair
- Subtielere verandering; gemethyleerde base
3: Nucleotide exision repair
Thymine dimeer = Covalente binding tussen de T basen
Detecteren van dsDNA breuk: NHEJ, HR
NHEJ kan leiden tot korte inserties of deleties
- Snel
- Niet nauwkeurig
Hoorcollege deel 2