Samenvatting Microbiology (3de bachelor Biologie)

Samenvatting Microbiology
HC 1: Introductie
Organisatie microbiele cel
Nucleoid  genetisch materiaal
Membraan  barriere
Celwand  versterkt structuur
Prokaryoten
Bacteria
Archaea
Eukaryoten
Fungi
Gisten
Protisten
Algen
Genoom
Hierdoor: adaptatie mogelijk
Prokaryoten: circulair
Eukaryoten: lineair
Grootte: afhankelijk van lifestyle
 vrijlevend: groot genoom
 pathogeen/symbiont: klein
Microben: kunnen beweeglijk zijn, doen aan differentiatie (vorming spore), communiceren…
Microbiele cel
Katalyst  omzetting ADP + Pi in ATP  genereert suikers, AZ…
Diversiteit van microben door
Hoeveelheid nutrienten
Het milieu: pH, temp
 extremofielen

,Microbiele evolutie
Gevonden door ribosomaal RNA
Zo ook: vinden LUCA (last universal common ancestor)
Positieve impact van microorganismen
N fixing
Regeneratie van nutrienten
Maken biofuels
Genetic engineering  productie antibiotica
Fermentatie  kaas
Negatieve impact
Ziektes in planten en dieren
Voedselbederving
Ferdinand Cohn
Ontdekte bacteriele endosporen
Louis Pasteur
Spontane generatie
Nonsteriele vloeistof in fles  opwarmen nek  sterilisatie van vloeistof 
microorganismen blijven in nek zitten  blijft steriel
Fles kantelen  vloeistof en microorg raken  niet meer steriel
Robert Koch
Link tussen microben en ziektes
Koch’s postulates: zieke rat: heeft pathogeen (gezonde rat niet)  pathogeen wordt
gegroeid in cultuur  pathogeen w gegeven aan gezonde rat  zieke rat 
opnieuw isolatie van pathogeen  hetzelfde als bij oorspronkelijk zieke rat




HC 2: Celstructuur en functie in Bacteria en Archaea
Cel Morfologie
Cel Morfologie

,Vormen
Coccus (rond)
Rod (cilinder)
Spirilllum (spiraal)
Spirochetes
Morfologie bepaald door krachten
Optimalizatie nutrient opname
Zwembeweging
Glijdbeweging

Celgrootte
Maximale grootte organisme?
Kleiber’s wet
Groter  minder nutrient opname  metabolisme overleeft niet
Voordelen klein organisme
Hogere S/V
Hogere opname nutrienten  snellere groei
Minimale grootte?
Essentiele celcomponenten moeten passen (DNA, proteinen)

Cytoplasma membraan en transport
Cytoplasma membraan
Wat?
Dun
Barriere
Selectief permeabel
Samenstelling
Fosfolipide bilayer
Proteinen voor transport
Kationen vormt bindingen
Sterolen voor stabilizatie

, Hopanoiden (zoals sterolen)
Proteinen
Integraal
Perifeer
Archaeal membraan
Ether link (ester in bacteria, euk)
Staart: isoprenen (vetzuren in bacteria, euk)
Fosfolipiden: mix bi en monolayers

Functies cytoplasmamembraan
Functies membraan
Barriere: nutrienten binnen, waste buiten
Verankert proteinen
Behoudt E
Permeabiliteit
Kleiner molecule  makkelijker door
Minder lading  makkelijker door
Meestal: transporter nodig
Aquaporine
Aquaporine
Waterdiffusie door membraan
1 per 1
Bidirectioneel
Transportproteinen
Sneller dan permeabiliteit
Nutriententransport naar binnenkant cel
E nodig
Heel specifiek
Goede regulatie door sensoren
Affiniteit:

, Lage concentratie nutrienten  hoge affiniteit transporter
Hoge concentratie nutrienten  lage affiniteit transporter
Structuur transporters
Conformatieverandering  stof kan door
Transport events
Uniporter
Antiporter
Symporter
Simpel transport
Bv lac permease
Proton motive force




Groep transport
Met PEP ipv proton motive force
P van PEP  fosforylatie cascade  P op transporter
Voor transport suikers