Key Words Microben 2023
Colleges Hamoen:
1ste college
MRSA Methicillin-resistant staphylococcus aurus (resistent tegen
meticilline achtigen)
Streptococcus Longontsteking
pneumoniae
Mycobacterium Tuberculose
tuberculosis
Salmonella typhimurium & Voedselvergiftiging
Escherichia coli
Helicobacter pylori Maagzweer
Neisseria gonorrhoeae Gonorrhoeae
Legionella pneumophila Veteranenziekte
Haemophilus influenzae Hersenvliesontsteking
Bacillus anthracis Miltvuur
(Dodelijk toxin) – Van grond naar plant naar dier – maakt
sporen(kan je poeder van maken)
Candida albicans (Gist) kan infectie in mond/vagina veroorzaken
Fusarium / Phytophthora Planten schimmel(bananen) / aardappelziekte
Plasmodium falciparum Malaria
Trypanosoma brucei Slaapziekte (eencellige parasiet))
Leishmania major Intracellulair pathogeen dat de macrofagen en dendritis cellen vh
immuunsysteem infecteren
- Leishmaniasis (uitgroeiing met grote bultjes)
hepatitis Virale infectie die leidt tot ontsteking vd lever
dengue Verspreiding virus door muggen – knokkelkoorts
HIV Virus dat het immuunsysteem aanvalt
polio (Kan zorgen voor volledige verlamming) virus die zenuwstelsel
aantast
measles Virus die bultjes veroorzaakt
vaccine (attenuated)
Louis Pasteur Ontwikkelde de eerste vaccinatie
Immunization The stimulation of a immune response by deliberate inoculation
with an attenuated pathogen.
symbiosis 2 organen die samen leven, voordeel, nadeel, niks
rhizobium Gram- bacterien, wortelknobbel
micorrhiza Samenlevingsvorm tussen schimmels en plantenwortel
Lichens (korstmossen) Schimmel die in mutualistische symbiose samenleeft met
cyanobacterie/photobiont (alg, plant
microbiome Geheel aan micro-organismen die zich in een bepaalde omgeving
bevindt. Symbiose met dier/mens is essentieel
➢ Menselijke microbioom (verteringsstelsel)
- Veel ziektes met microbioom
➢ Nutriëntenkringloop (plant)
- Moleculen worden afgebroken en gebruik voor groei van
andere organismen (afvalwaterverwerking)
1
, Key Words Microben 2023
➢ Biotechnologie
- Productie van chemische verbindingen en enzymen
(vitamines, biofuels)
- Antibiotica: schimmels(+bacteriën) die bacteriën en
schimmelsbestrijden
Flemming Ontdekker anibiotica (penicillium)
examples of food - Alcohol
preservation/processing - Zuurdesem
- Yoghurt
- Soyabonen
3 essential roles of
bacteria
3 useful activities of - Gentherapie
virusses - Decoratief (wit+roze tulp)
- Bacteriofaag: Plankton bloom onder controle houden
bacteriofagen Biologische controle op bacteriën dmv virussen
microbial scale e. coli = 2,5µm
(micrometres) bloedcel = 8µm
paramecium = 100µm (pantoffeldiertje)
Antonie van Leeuwenhoek Licht microscoop ontwikkeling
Hooke (cell) Kwam met de term “cel” .Bouwde eerste compound microscoop.
Basic forms (bacilli, cocci, Bacilli – langwerpige staafjes
spiral) Spirochetes – kurkentrekker staafjes
Cocci – bolletjes op een rij
wavelength visible De golflengte moet kleiner of gelijk zijn dan de orde vh object to
light~bacterial cell resolve shape(zichtbaar licht 400-700nm)
bright field Microscoop die een donker plaatje van een opbject op een lichte
achtergrond – scherper door immersion oil
oil emersion Resolutie verhogen
Gram-stain - positive —> dikke celwand
(negative/positive) - negatief —> dunne celwand + extra buiten membraan
phase contrast Alternatief gram staining. Geen kleuring, geen details
microscope (Zernike)
Immunofluorescence Labelen mbv kleur. Kan compartimenten zien.
(primary/secondary
antibody)
GFP Fluorescent eiwit
TEM/SEM Transmissie EM —> elektron door specimen, internal structures
Scanning EM —> elektron scan the surface, external features in
3D
cryo-EM (tomography) Sample is flash frozen, 3D, high resolution
cell envelope Cytoplasma + celmembraan + cel wand
nucleoid DNA in bacteriën, geen membraan omheen
hopanoids (in sommige bacteria) om membraan fluiditeit te verlagen, ipv
cholesterol (adds strenght to membranes)
peptidoglycan Hieruit is bacterial cell wall opgebouwd (murein)
2
, Key Words Microben 2023
lipid II Target van antibiotica om wall kapot te maken
L- & D-alanines Meeste structuren hebben L-configuratie
D-configuratie is minder gangbaar, wordt minder afgebroken,
hogere resistentie (peptidoglycan)
transglycosilation/transpe Nodig voor t maken van peptidoglycan cross-bridge. Uitgevoerd
ptidation door PBP
Gram-positive/negative - Heeft 1 peptidogycan laag, dubbel membraan dus moeilijk
te bestrijden. + hebben S-laag boven t membraan voor de
structuur, stevigheid en bescherming van de proteïnen
periplasma Laag tussen de membranen van gram- bacteria (niks,
peptidoglycan en lipoproteins)
LPS Problemen bij immuno response —> draadjes aan buiten
membraan bij gram-
Capsule Bestaat uit polysacceriden, beschermt de cel
S-layer Beschermende laag, subunits bestaande uit eiwitten (kan cell
shape veranderen en helpen bij osmotic stress)
mycoplasma Bacteria zonder cellwand – veroorzaakt pneumonia en meningitis
FtsZ, MreB, CreS FtsZ —> vormt “z-ring”, coördineert septum synthese, voorloper
tubuline
MreB —> vormt polymeren aan laterale wand, voorloper actine.
(Geen MreB, ronde cel)
CreS —> haalt MreB dicht bij elkaar, vormt kromming, makkelijk
door fiscose substantie, spiraal vorm
division septum New wall between two daughter cells
thylakoids Gevouwen intracellulaire photosynthetic membranes (niet t
zelfde als chloroplasten)
carboxysomes Polyhedral bodies packed met rubisco enzymen voor CO2 fixatie
gas vesicles Increase buoyancy —> bepalen diepte in zee
storage granules (PHB) Energie – glycogen, PHB
Oxidatie – sulfur
Lipid bodies
Magnetosomes Zodat t naar de goede pool gaat, door membrane-embedded
crystals of magnetite
Pili Attachment/ DNA opname, conjugatie
stalk Dat t ergens vast blijft zitten, extentie vh cytoplasma
Chemotaxis Movement of a bacterium in response to chemical gradients of
attractants/repellents
clockwise/counter- Flagella laat bewegen. The filament rotates by a moter driven
clockwise/tumbling/rando door de proton motive kracht, kan clockwise(CW) of
m walk counterclockwise(CCW)
CW – flagellar bundle valt uit elkaar – tumble=bacterie briefly,
then changes direction
CCW – flagella bundle together, push cell forward
2de college
complex/enriched
3
Colleges Hamoen:
1ste college
MRSA Methicillin-resistant staphylococcus aurus (resistent tegen
meticilline achtigen)
Streptococcus Longontsteking
pneumoniae
Mycobacterium Tuberculose
tuberculosis
Salmonella typhimurium & Voedselvergiftiging
Escherichia coli
Helicobacter pylori Maagzweer
Neisseria gonorrhoeae Gonorrhoeae
Legionella pneumophila Veteranenziekte
Haemophilus influenzae Hersenvliesontsteking
Bacillus anthracis Miltvuur
(Dodelijk toxin) – Van grond naar plant naar dier – maakt
sporen(kan je poeder van maken)
Candida albicans (Gist) kan infectie in mond/vagina veroorzaken
Fusarium / Phytophthora Planten schimmel(bananen) / aardappelziekte
Plasmodium falciparum Malaria
Trypanosoma brucei Slaapziekte (eencellige parasiet))
Leishmania major Intracellulair pathogeen dat de macrofagen en dendritis cellen vh
immuunsysteem infecteren
- Leishmaniasis (uitgroeiing met grote bultjes)
hepatitis Virale infectie die leidt tot ontsteking vd lever
dengue Verspreiding virus door muggen – knokkelkoorts
HIV Virus dat het immuunsysteem aanvalt
polio (Kan zorgen voor volledige verlamming) virus die zenuwstelsel
aantast
measles Virus die bultjes veroorzaakt
vaccine (attenuated)
Louis Pasteur Ontwikkelde de eerste vaccinatie
Immunization The stimulation of a immune response by deliberate inoculation
with an attenuated pathogen.
symbiosis 2 organen die samen leven, voordeel, nadeel, niks
rhizobium Gram- bacterien, wortelknobbel
micorrhiza Samenlevingsvorm tussen schimmels en plantenwortel
Lichens (korstmossen) Schimmel die in mutualistische symbiose samenleeft met
cyanobacterie/photobiont (alg, plant
microbiome Geheel aan micro-organismen die zich in een bepaalde omgeving
bevindt. Symbiose met dier/mens is essentieel
➢ Menselijke microbioom (verteringsstelsel)
- Veel ziektes met microbioom
➢ Nutriëntenkringloop (plant)
- Moleculen worden afgebroken en gebruik voor groei van
andere organismen (afvalwaterverwerking)
1
, Key Words Microben 2023
➢ Biotechnologie
- Productie van chemische verbindingen en enzymen
(vitamines, biofuels)
- Antibiotica: schimmels(+bacteriën) die bacteriën en
schimmelsbestrijden
Flemming Ontdekker anibiotica (penicillium)
examples of food - Alcohol
preservation/processing - Zuurdesem
- Yoghurt
- Soyabonen
3 essential roles of
bacteria
3 useful activities of - Gentherapie
virusses - Decoratief (wit+roze tulp)
- Bacteriofaag: Plankton bloom onder controle houden
bacteriofagen Biologische controle op bacteriën dmv virussen
microbial scale e. coli = 2,5µm
(micrometres) bloedcel = 8µm
paramecium = 100µm (pantoffeldiertje)
Antonie van Leeuwenhoek Licht microscoop ontwikkeling
Hooke (cell) Kwam met de term “cel” .Bouwde eerste compound microscoop.
Basic forms (bacilli, cocci, Bacilli – langwerpige staafjes
spiral) Spirochetes – kurkentrekker staafjes
Cocci – bolletjes op een rij
wavelength visible De golflengte moet kleiner of gelijk zijn dan de orde vh object to
light~bacterial cell resolve shape(zichtbaar licht 400-700nm)
bright field Microscoop die een donker plaatje van een opbject op een lichte
achtergrond – scherper door immersion oil
oil emersion Resolutie verhogen
Gram-stain - positive —> dikke celwand
(negative/positive) - negatief —> dunne celwand + extra buiten membraan
phase contrast Alternatief gram staining. Geen kleuring, geen details
microscope (Zernike)
Immunofluorescence Labelen mbv kleur. Kan compartimenten zien.
(primary/secondary
antibody)
GFP Fluorescent eiwit
TEM/SEM Transmissie EM —> elektron door specimen, internal structures
Scanning EM —> elektron scan the surface, external features in
3D
cryo-EM (tomography) Sample is flash frozen, 3D, high resolution
cell envelope Cytoplasma + celmembraan + cel wand
nucleoid DNA in bacteriën, geen membraan omheen
hopanoids (in sommige bacteria) om membraan fluiditeit te verlagen, ipv
cholesterol (adds strenght to membranes)
peptidoglycan Hieruit is bacterial cell wall opgebouwd (murein)
2
, Key Words Microben 2023
lipid II Target van antibiotica om wall kapot te maken
L- & D-alanines Meeste structuren hebben L-configuratie
D-configuratie is minder gangbaar, wordt minder afgebroken,
hogere resistentie (peptidoglycan)
transglycosilation/transpe Nodig voor t maken van peptidoglycan cross-bridge. Uitgevoerd
ptidation door PBP
Gram-positive/negative - Heeft 1 peptidogycan laag, dubbel membraan dus moeilijk
te bestrijden. + hebben S-laag boven t membraan voor de
structuur, stevigheid en bescherming van de proteïnen
periplasma Laag tussen de membranen van gram- bacteria (niks,
peptidoglycan en lipoproteins)
LPS Problemen bij immuno response —> draadjes aan buiten
membraan bij gram-
Capsule Bestaat uit polysacceriden, beschermt de cel
S-layer Beschermende laag, subunits bestaande uit eiwitten (kan cell
shape veranderen en helpen bij osmotic stress)
mycoplasma Bacteria zonder cellwand – veroorzaakt pneumonia en meningitis
FtsZ, MreB, CreS FtsZ —> vormt “z-ring”, coördineert septum synthese, voorloper
tubuline
MreB —> vormt polymeren aan laterale wand, voorloper actine.
(Geen MreB, ronde cel)
CreS —> haalt MreB dicht bij elkaar, vormt kromming, makkelijk
door fiscose substantie, spiraal vorm
division septum New wall between two daughter cells
thylakoids Gevouwen intracellulaire photosynthetic membranes (niet t
zelfde als chloroplasten)
carboxysomes Polyhedral bodies packed met rubisco enzymen voor CO2 fixatie
gas vesicles Increase buoyancy —> bepalen diepte in zee
storage granules (PHB) Energie – glycogen, PHB
Oxidatie – sulfur
Lipid bodies
Magnetosomes Zodat t naar de goede pool gaat, door membrane-embedded
crystals of magnetite
Pili Attachment/ DNA opname, conjugatie
stalk Dat t ergens vast blijft zitten, extentie vh cytoplasma
Chemotaxis Movement of a bacterium in response to chemical gradients of
attractants/repellents
clockwise/counter- Flagella laat bewegen. The filament rotates by a moter driven
clockwise/tumbling/rando door de proton motive kracht, kan clockwise(CW) of
m walk counterclockwise(CCW)
CW – flagellar bundle valt uit elkaar – tumble=bacterie briefly,
then changes direction
CCW – flagella bundle together, push cell forward
2de college
complex/enriched
3
