Evolutie Interdisciplinair
Inhoud
Opzet cursus........................................................................................................... 2
Evolutietheorie als het grote verhaal van de biologie – Duur Aanen......................3
Ontwerp zonder Ontwerper.................................................................................... 9
Evolutionaire geneeskunde.................................................................................. 11
Moderne synthesis................................................................................................ 13
Taal evolutie – Kirsten Timmerman.......................................................................15
Monogamie/Polygamie – Liesbeth Sterck..............................................................20
Culturele evolutie................................................................................................. 28
Adaptionisme – Tom Ruth..................................................................................... 33
Gould & Lewontin (1979)................................................................................... 33
Godfrey-Smith (2000)........................................................................................ 35
Godfrey-Smith & Wilkins (2009)........................................................................36
Muziek & Evolutie – Bas Cornelissen....................................................................39
Pechakucha presentatie....................................................................................... 42
,Opzet cursus
- IIS interdisciplinary research model
o Oriëntatie
o Theoretische analyse
o Data aquisition & analyse
o Completion
- Boekenclub – 16 december (20%)
o Voorafgaand pitch opnemen (3min)
o Lucy Cooke - Bitch
- Vrije opdracht (20%)
o Ergens met evolutie/interdisciplinariteit te maken…
o 40 uur ongeveer
o Wat wilde je altijd al doen, maar nooit de kans voor gekregen?
o Is er n skill die je wilt ontwikkelen?
o Ideeën:
Canva!
Monopoly over de evolutie?
Evolutie social media?
Lily’s Proto lab
- Tentamen (20%)
- IOP + Presentatie (40%)
o Onderwerp:
o
- Doel cursus:
o Toepassing concepten en methoden uit evolutiebiologie
o Perspectieven uit andere disciplines
o Hoe voer je interdisciplinair onderzoek uit?
o Discussies/gesprekken
Bredere onderwerpen
Interdisciplinariteit Kennis (in bepaalde vorm) wordt geïntegreerd om een
bepaald vraagstuk beter te begrijpen
- Discipline A & Discipline B worden met elkaar geïntegreerd, dus meerdere
perspectieven op 1 vraagstuk laten integreren.
- Integratie is belangrijk
o Theoretisch
o Methodologisch
o Conceptueel
o Conflicten tussen disciplines
- Advance fundamental understanding (Bijvoorbeeld Darwin)
- Voorbeelden:
o Complexe vragen beantwoorden
o Eerdere antwoorden verbetren door andere perspectieven toe te
voegen
Evolutionair algoritme
- Effecten mutatie snelheid en populatiegrootte
, o Hoe hoger populatie grootte Hoe minder generaties nodig zijn
o Mutatiesnelheid sweetspot (0.05)
o Hoe hoger de populatiegrootte, hoe brederde sweetspot van
mutatiesnelheid
- Afwijkingen algoritme & biologische evolutie
o Model is geen realiteit met alle andere invloeden
o In de biologie is er geen TARGET PHRASE, in het algoritme wel!
o Evolutie heeft geen doel, gebeurt gewoon dus geen “maker”
o Tussen vormen in de evolutie moeten ADAPTIEF zijn!
Als je er 1 tussenuit haalt, dan kan je niet naar het einde
komen.
- Als
o Variatie, erfelijkheid & Differientiele fitness
Variatie Elke nieuwe generatie verschillende zinnen
Erfelijkheid Nieuwe zinnen lijken op (geselecteerde) zin uit
de vorige generatie
Differentiele fitness Een zin reproduceert N keer, de andere
zinnen niet
- Dan
o Natuurlijke selectie/verandering/veroudering
- William Paley complexiteit design without designer
Evolutietheorie als het grote verhaal van de
biologie – Duur Aanen
Wat is evolutiebiologie?
Meer dan wetenschap? wordt niet door iedereen geaccepteerd, en dat is
wellicht onnodig…
Evolutie theorie verklaring van het patroon dat we zien
- Lineus
o Deelde soorten in, onderscheide ondersoorten etc. taxonomie
o Wetenschappelijke verklaring van de evolutie theorie voor het
patroon in de natuur
- Verklaring voor adaptatie
Is evolutie biologie een ‘gewone’ natuur wetenschap
- Empirische wetenschap waarnemingen en experimenten
- Moderne theorie ondanks darwin steeds nieuwe perspectieven
o Wat is de rol van toeval
o Wat is de rol van natuurlijke selectie
o Hoe ontstaat reproductieve isolatie
o Hoe kan samenwerking (altruisme) ontstaan
- Maar de evolutiebiologie is wel speciaal
o Nothing makes sense, except in the light of evolution
o Evolution is a light which illuminates all facts, a trajectory which all
lines of thought must follow – this what evolution is.
- Is het meer dan een wetenschap?
o Wetenschap Religie
o Niet iedereen is het eens over levensbeschouwing
, Wat geeft betekenis, wetenschap leent zich hier niet voor
- Feike Sijbsma uitspraken
Wat is evolutiebiologie?
- Kans speelt een belangrijke rol in de evolutie
o Patronen
Meteoriet inslag wat de extinctie veroorzaakte van de
dinosauriërs kans voor zoogdieren om dit gat op te vullen
o Genetische drift
Toevalsprocessen
Kans effecten in kleine populaties
Door toeval accumulerende mutaties leiden tot
verandering genetische drift
o Hardy Weinberg random mating
o Mutaties
Ongericht (kans)
Emperische bevinding, in theorie kan een mutatie een gericht
proces zijn.
- Natuurlijke selectie
o Richting hogere fitness
o Adaptaties leveren hogere fitness op
o Darwin’s postulates
Variatie fenotype
Fenotype is erfelijk
Verschil in overleving en/of reproductieve fitness
Correlatie tussen fenotype en fitness
o Natuurlijke selectie leidt tot selectie op genen die op een hoger
fitness landschap zitten
- Natuurlijke selectie meer algemeen toepasbaar
o Tekening natekenen, met selectie op dunne of dikke lijnen na 6
generaties enorm groot verschil
o Hitch hiking selecteren op eigenschap kan ook een andere
eigenschap die aan die specifieke eigenschap gekoppeld is
meenemen
- Natuurlijke selectie vormt adaptaties
o Adaptive design beeldspraak, ontwerp door natuurlijke selectie
ipv letterlijk ontwerp!
o Het oog is hier een goed voorbeeld van enorm complex
Maar is het optimaal?
Nee, want er zit een blinde vlek in onze ogen (plek
waar de zenuwcellen het oog verlaten)
Inhoud
Opzet cursus........................................................................................................... 2
Evolutietheorie als het grote verhaal van de biologie – Duur Aanen......................3
Ontwerp zonder Ontwerper.................................................................................... 9
Evolutionaire geneeskunde.................................................................................. 11
Moderne synthesis................................................................................................ 13
Taal evolutie – Kirsten Timmerman.......................................................................15
Monogamie/Polygamie – Liesbeth Sterck..............................................................20
Culturele evolutie................................................................................................. 28
Adaptionisme – Tom Ruth..................................................................................... 33
Gould & Lewontin (1979)................................................................................... 33
Godfrey-Smith (2000)........................................................................................ 35
Godfrey-Smith & Wilkins (2009)........................................................................36
Muziek & Evolutie – Bas Cornelissen....................................................................39
Pechakucha presentatie....................................................................................... 42
,Opzet cursus
- IIS interdisciplinary research model
o Oriëntatie
o Theoretische analyse
o Data aquisition & analyse
o Completion
- Boekenclub – 16 december (20%)
o Voorafgaand pitch opnemen (3min)
o Lucy Cooke - Bitch
- Vrije opdracht (20%)
o Ergens met evolutie/interdisciplinariteit te maken…
o 40 uur ongeveer
o Wat wilde je altijd al doen, maar nooit de kans voor gekregen?
o Is er n skill die je wilt ontwikkelen?
o Ideeën:
Canva!
Monopoly over de evolutie?
Evolutie social media?
Lily’s Proto lab
- Tentamen (20%)
- IOP + Presentatie (40%)
o Onderwerp:
o
- Doel cursus:
o Toepassing concepten en methoden uit evolutiebiologie
o Perspectieven uit andere disciplines
o Hoe voer je interdisciplinair onderzoek uit?
o Discussies/gesprekken
Bredere onderwerpen
Interdisciplinariteit Kennis (in bepaalde vorm) wordt geïntegreerd om een
bepaald vraagstuk beter te begrijpen
- Discipline A & Discipline B worden met elkaar geïntegreerd, dus meerdere
perspectieven op 1 vraagstuk laten integreren.
- Integratie is belangrijk
o Theoretisch
o Methodologisch
o Conceptueel
o Conflicten tussen disciplines
- Advance fundamental understanding (Bijvoorbeeld Darwin)
- Voorbeelden:
o Complexe vragen beantwoorden
o Eerdere antwoorden verbetren door andere perspectieven toe te
voegen
Evolutionair algoritme
- Effecten mutatie snelheid en populatiegrootte
, o Hoe hoger populatie grootte Hoe minder generaties nodig zijn
o Mutatiesnelheid sweetspot (0.05)
o Hoe hoger de populatiegrootte, hoe brederde sweetspot van
mutatiesnelheid
- Afwijkingen algoritme & biologische evolutie
o Model is geen realiteit met alle andere invloeden
o In de biologie is er geen TARGET PHRASE, in het algoritme wel!
o Evolutie heeft geen doel, gebeurt gewoon dus geen “maker”
o Tussen vormen in de evolutie moeten ADAPTIEF zijn!
Als je er 1 tussenuit haalt, dan kan je niet naar het einde
komen.
- Als
o Variatie, erfelijkheid & Differientiele fitness
Variatie Elke nieuwe generatie verschillende zinnen
Erfelijkheid Nieuwe zinnen lijken op (geselecteerde) zin uit
de vorige generatie
Differentiele fitness Een zin reproduceert N keer, de andere
zinnen niet
- Dan
o Natuurlijke selectie/verandering/veroudering
- William Paley complexiteit design without designer
Evolutietheorie als het grote verhaal van de
biologie – Duur Aanen
Wat is evolutiebiologie?
Meer dan wetenschap? wordt niet door iedereen geaccepteerd, en dat is
wellicht onnodig…
Evolutie theorie verklaring van het patroon dat we zien
- Lineus
o Deelde soorten in, onderscheide ondersoorten etc. taxonomie
o Wetenschappelijke verklaring van de evolutie theorie voor het
patroon in de natuur
- Verklaring voor adaptatie
Is evolutie biologie een ‘gewone’ natuur wetenschap
- Empirische wetenschap waarnemingen en experimenten
- Moderne theorie ondanks darwin steeds nieuwe perspectieven
o Wat is de rol van toeval
o Wat is de rol van natuurlijke selectie
o Hoe ontstaat reproductieve isolatie
o Hoe kan samenwerking (altruisme) ontstaan
- Maar de evolutiebiologie is wel speciaal
o Nothing makes sense, except in the light of evolution
o Evolution is a light which illuminates all facts, a trajectory which all
lines of thought must follow – this what evolution is.
- Is het meer dan een wetenschap?
o Wetenschap Religie
o Niet iedereen is het eens over levensbeschouwing
, Wat geeft betekenis, wetenschap leent zich hier niet voor
- Feike Sijbsma uitspraken
Wat is evolutiebiologie?
- Kans speelt een belangrijke rol in de evolutie
o Patronen
Meteoriet inslag wat de extinctie veroorzaakte van de
dinosauriërs kans voor zoogdieren om dit gat op te vullen
o Genetische drift
Toevalsprocessen
Kans effecten in kleine populaties
Door toeval accumulerende mutaties leiden tot
verandering genetische drift
o Hardy Weinberg random mating
o Mutaties
Ongericht (kans)
Emperische bevinding, in theorie kan een mutatie een gericht
proces zijn.
- Natuurlijke selectie
o Richting hogere fitness
o Adaptaties leveren hogere fitness op
o Darwin’s postulates
Variatie fenotype
Fenotype is erfelijk
Verschil in overleving en/of reproductieve fitness
Correlatie tussen fenotype en fitness
o Natuurlijke selectie leidt tot selectie op genen die op een hoger
fitness landschap zitten
- Natuurlijke selectie meer algemeen toepasbaar
o Tekening natekenen, met selectie op dunne of dikke lijnen na 6
generaties enorm groot verschil
o Hitch hiking selecteren op eigenschap kan ook een andere
eigenschap die aan die specifieke eigenschap gekoppeld is
meenemen
- Natuurlijke selectie vormt adaptaties
o Adaptive design beeldspraak, ontwerp door natuurlijke selectie
ipv letterlijk ontwerp!
o Het oog is hier een goed voorbeeld van enorm complex
Maar is het optimaal?
Nee, want er zit een blinde vlek in onze ogen (plek
waar de zenuwcellen het oog verlaten)