Samenvatting Cellen en Weefsels deeltentamen 2

Cellen en weefsels deeltentamen 2

H15 Cel signalering
H15-1 Generale cel signalerings pathways
Signalering
- Contact afhankelijk
- Autocrien
- Paracrien
- Endocrien
- Synaptisch
Receptoren
- Membraan
- Hebben binding pockets
- Maakt met non covalente bindingen contact:
- Van der Waalsbruggen
- Waterstofverbindingen
- Electro verbindingen
- Hydrofobe verbindingen
- Lage Kd —> hoge affiniteit




- Ionkanalen
- GPCR
- Enzym-gekoppeld (kinases)
- Intracellulair
- Steroid receptoren
- Induced fit: ligand bindt —> receptor verandert
Intracelullaire eiwit cascade
- Functies (en ook meteen het nut van zoveel eiwitten):
- Amplificatie
- Op 1 signaleringspad
- Integratie <—> distributie
- 2 verschillende signalen tot 1 en 1 signaal heeft verschillende effecten in verschillende
signaleringspaden
- Feedforward <—> feedback
- Post translational modificaties van eiwitten
- Kinases <—> fosfatases
- Zetten P erop (ATP —>ADP) <—> halen P eraf
- P op serine
- P kan zorgen voor activatie of inactivatie
- GEF <—> GAP

, - Halen GDP eraf en zetten GTP erop <—> maken GDP
- Ubiquitinering ligases <—> Deubiquitinering enzym
- In 3 stappen
- E1: ubiquitin activating enzyme
- E2: ubiquitin conjugating enzyme
- Geeft af aan eiwit maar heeft E3 nodig
- E3: ubiquitin ligase
- Kan activeren en deactiveren




Proteosoom vs lysosoom
- Meer dan 4 ubiquitines —> afgebroken
Feedback
- Positive feedback moet actief weer uitgezet worden




- Negatieve feedback
Intracellulaire signaleringscomplexen
- Scaffold protein
- Zorgt dat alle eiwitten die nodig zijn voor de signalering
in de buurt zijn
- Op het receptor zelf
- Vaak bij receptor tyrosine kinases
- Op fosfolipiden
- Signaleringseiwitten komen dicht bij elkaar door
gefosfoforyleerde PiP2 —> PiP3
- In het echt complex van alle drie
- PTB: fosfo tyrosine binding domain
- PH: Plextrin homology
- Grb2 heeft SH2 & SH3 domeinen
- Verschil tussen een SH2 en een SH3:

,Signalering uitzetten:
Leerdoelen:
1) The different components of signaling pathways
2) The different types of receptors
3) 3 types of activation and deactivation
4) Different types of response modulation: Amplification, feedback,
integration and down-regulation

H15-2 GPCR’s
- 7x door membraan
- Kan GPCR zien als een GEF die G eiwit activeert
- Ligand bindt —> affiniteit van alpha subunit verandert —>
conformatie verandering —> GDP —> GTP
- Galfa-s, Galfa-i en Galfa-q




PKA signaling
- GPCR —> cAMP —> PKA —> CREB —> cis regulator regio —>
gen transcriptie
- Second messenger: cAMP
- 1 GPCR kan meerdere G eiwitten aanzetten

, cAMP meten:
- Probe + geen cyclisch AMP + straling —> FRET —> gele kleuring
- Probe + cyclisch AMP —> EYFP & ECFP niet meer dicht genoeg bij elkaar geen FRET
- Blauw: weinig cAMP




PKC signalling
- PIP2 signalling
- Bij PiP2 zijn er 3 plekken met fosfaatgroep
- Maar als ze van diaglycerol loskomt heet ze IP3
- Second messengers:
- IP3
- Ca2+




Fura-2 dye: calcium meten
- Kan bij meten van zaadcel die in eicel komt
Uitzetten van GPCR:
- GPCR kinase (GRK)
- Defosforyleren van GPCR
- Arrestin: receptor mediated endocytose
- Of (hele kleine kans, hele grote affiniteit) ligand die laat los van GPCR