Tools voor een biotechnoloog
Restricte-enzyme
PCR
Plasmidennennanderen“vectoren”
Tentransformerenncellenn
DetecteenProbenvoornhetnteruivindennvannsequentesn(later)
NodiienResistente-ienen
HandiienReporterienen
RestrictonnandnmodifcatonnofnDNA,n2n6-basenparennsequentesnherkendnenniecleavedndoorn2n
verschillendentypenIInrestrictenenzymen,n2nstrandsnvanndenherkenniissequentesnhebbenndezelfden
sequenten(palindroom)(1nnaarn3).
EcoR1nmaaktnstckynendsn(staiieredncuts),nEcoRVnkniptnaannbeidenstrandsnvannhetnDNAndirectn
teienoverelkaarn(bluntnends).
EcoR1nennEcoRVnherkennennspecifeken6bpnsequente.
,11.1nRestrictonnEnzymesnandnNucleicnAcidnSeparaton
nModifcatonnenzymesnenprotectncell'snDNAnfornrestrictonnenzymes
- Chemicallynmodifynnucleotdesninnrestrictonnrecoinitonnsequence
- ModifcatonnienerallynconsistsnofnmethylatonnofnDNA
Gemodifceerdnmetnmethylases,nmethyliroepenntoeievoeid,nbeschermininrestricitesitenvann
knippenndoornEcoR1nennEcoRV.
Natuurlijknrol;nbeschermenncelnteiennniet-eiiennDNAn(viral),nzelfescherminincelnteiennrestricten
enzymenenmodifcatenenzymen.
Restricte-enzymennzijnnontdektninnbacteriënninndenjarenn0 nvannden2 steneeuw.nZenfunctonerenn
bijnbacteriënnalsnbeschermininteienninjectenvannvirus-DNA.nHunnontdekkininleiddentotnden
ontwikkelininvannienetschenmodifcate.
11.3 The Polymerase Chain Reacton
DNAnreplicateninnvitro;namplifcate,nPCRnkannseimentennDNAnkopiërenntotnbiljoennvoud.n
1.nTemplatenDNAniedenatureerdndoornhitte.n(denaturate)
2.nArtfcialnDNAnoliionucleotdenprimersnopnelkenstrandntoeievoeid.n(annealini)
3.nDNAnpolymerasenextentonnvannprimersniebruikmakendnvannoriiinelenDNAnalsntemplate.
4.nIncubatentjd;ntempnomhooi,nstrandniescheiden,ntarietnienen2xnzoveelnaanweziinenz…
1.nTemp.nomlaai,nprimersnhybridiserennmetncomplementairenreiio’snvannnieuwniemaaktnDNA.
, • ApplicatonsnofnPCRe
– Phyloienetcnstudies.
– Surveyinindiferentniroupsnofnenvironmentalnorianisms.
– AmplifyininsmallnamountsnofnDNA.
– Identfyininanspecifcnbacteria.
– Lookininfornanspecifcniene.
VariatonsnofnPCRe
– ReversentranscriptonnPCRn(RTnPCR).
– CannmakenDNAnfromnannRNAntemplate.
– Usesnthenenzymenreversentranscriptasen.
– QuanttatvenPCRn(qnPCR).
– Usesnfuorescentnprobentonmonitornthenamplifcatonnprocess.
Specifekenprimers,nhoienannealinisntemp;nPCRnspecifek,nTAQnpolymerasenstabielntotn91niraden
PCRnvoornamplifcatenkleinenhoeveelhedennDNAnvb.nfossielennennforensisch.
11.4 Essentals of Molecular Cloning
nMolecularnclonininenisolatonnandnincorporatonnofnanpiecenofnDNAnintonanvectornsonitncannben
replicatednandnmanipulated.
FraimentnDNAnieisoleerdnennierepliceerd.
Isolerennbepaalde/iewensteniennvannzijnnoriiinelenlocatenennverplaatsnhetnnaarneennkleinnenn
manipuleerbaarnienetschnelementnzoalsneennplasmidenofneennvirus;nvector.
ResulteertninnrecombinantnDNA,neennDNAnmolecuulndatnDNAnbevatnvann2nofnmeernbronnen.n
Wanneerniekloneerdnkanniewenstenienniemanipuleerdnwordennennteruiieplaatstnwordenninneenn
cel.
Threenmainnstepsnofnienencloninie
1. IsolatonnandnfraimentatonnofnsourcenDNA
2. InsertonnofnDNAnfraimentnintonclonininvector
3. IntroductonnofnclonednDNAnintonhostnorianism