Evaluación de efectividad de técnicas de laboratorio para obtener eDNA de peces en el Río Barranquitas de Puerto Rico

La evaluación de eDNA de comunidades acuáticas ofrece una gran alternativa para los estudios de biodiversidad de poblaciones de peces sin utilizar métodos tradicionales de muestreo de captura. La técnica utiliza una muestra de agua para obtener ADN de cualquier especie que viva en el ecosistema acuático. Como en muchas otras técnicas de muestreo, se debe realizar un proceso de validación para obtener datos confiables. Los estudios informan diferentes cantidades de volúmenes de agua según corresponda para obtener ADN de calidad. Nuestras revisiones de la literatura indicaron cantidades de 0,75 a 3,0 litros de muestra de agua para obtener suficiente eDNA. En nuestro estudio, evaluamos muestras de agua de 0,75 y 1,5 litros con filtro Millipore de 0,22 µm utilizando el kit DNeasy Power Water para la obtención de eDNA. Nuestros resultados indicaron que en ambas filtraciones se obtuvo material genético, sin embargo, la calidad de la filtración de 1,5 L fue mejor. La calidad del material genético se determinó mediante nanofotómetro y electroforesis comparativa. En el nanofotómetro, se encontraron algunas impurezas en las muestras, pero los resultados mostraron la presencia de ácidos nucleicos. Además, cuando se realizó la electroforesis se pudo observar la calidad de la extracción de ADN y se validó la técnica.