Samenvatting BMW Genoom - Zelfstudie Aantekeningen + HC Week 3 - Universiteit Utrecht

Genoom – Blok 2 – Zelfstudie en
Hoorcolleges week 3
Inhoud
BMW Genoom – ZS – Gencontrole – E-module 1 – H7...........................................................................2
BMW Genoom – ZS – Gencontrole – E-module 2 – H7...........................................................................6
BMW Genoom – ZS – Gencontrole – E-module 3 – H7.........................................................................10
BMW Genoom – ZS – Gencontrole – E-module 4 – H7.........................................................................13




1

, BMW Genoom – ZS – Gencontrole – E-module 1 – H7
Algemene opmerkingen:

 Alle verschillende celtypen in een organisme hebben hetzelfde DNA, maar kunnen toch
anders tot expressie komen door de verschillen in de eiwitmoleculen en RNA
 Verschillende celtypen synthetiseren verschillende setjes van RNAs en DNA waarbij;
- veel structurele eiwitten hetzelfde zijn
- sommige RNAs en eiwitten specifiek zijn voor 1 type cel
- RNAs vaak in een andere hoeveelheid tot expressie komen in verschillende cellen
- de hoeveelheid mRNA niet alles zegt over de hoeveelheid eiwit of hun post-translationele
modificaties
 Externe signalen kunnen de genexpressie van een cel beïnvloeden
- hormonen, receptoren

Regulatie genexpressie

 genexpressie kan gereguleerd worden tijdens een van de vele stappen die de cel moet
doorlopen om van DNA naar RNA te komen
 een cel kan de eiwitproductie reguleren door 8 stappen:
1. Transcriptionele controle = de controle over wanneer en hoe vaak een eiwit wordt
getranscribeerd
- deze stap is het meest prominent
2. RNA processing control = controle over de splicing en processing van een RNA molecuul
3. RNA transport and localisation control = control over welke complete mRNAs worden
geëxporteerd uit de kern en waar ze terecht komen in het cytoplasma
4. Translationele controle = controle over welke mRNAs worden getransleerd door de
ribosomen
5. mRNA degratie controle = controle over welke mRNA moleculen in het cytoplasma worden
afgebroken
6. Protein activity controle = controle over het
(de)activeren van eiwitten na de translatie
7. Protein localisation control = controle over
de uiteindelijke vestiging van eiwitten na de
translatie
8. Protein degration controle = controle over
het afbreken van eiwitten na de translatie
 Stap 6-8 hebben te maken met post-
translationele modificaties

Transcriptie regulators = eiwitten die de transcriptie beïnvloeden

 Gen specifiek
 Maken contact met aminozuren die uitsteken uit structurele motieven (a-helix + ß-sheet)
 herkent een specifieke cis-regulator sequentie doordat de oppervlakte sequentie hiervan
identiek is aan de DNA sequentie
 Gaat H-bruggen, hydrofobe bindingen en ionische bindingen aan met het DNA




2