Samenvatting MoBi deel RNA

H7: transcriptie bij prokaryoten
Structuur van RNA

 Opbouw
o Ribose
o OH op C2
o Uracyl ipv thymine

 Vorming keten
o Identiek als DNA
 Fosodiesterbinding
o 5’ -> fosfaat
o 3’ -> OH groep

 Bouw
o Enkelstrengig
 Structuren zoals eiwitten
 Secundaire structuren
o Hairpin
o Stamlus
 Tertiaire structuur
o Pseudoknot

o Dubbelstrengig
 RNA-helix -> dubbelstrengig (A-
helix)
 Smallen en diepe groef
 Intramolleculaire bindingen
o Korte stukje helix

o Heteroduplexen met DNA

 Ribonucleoproteinecomplexen (RNPs)
o Complex met eiwitten
 Complexe functies



 Soorten RNA-overzicht

,Boodschapper tussen DNA en eiwit
 Hypotheses
o Nucleotiden -> RNA -> eiwitten -> DNA
o RNA kan katalytische activiteit
 Ribosimen
 Nog aanwezig in ribosomen
o Ribosomen
 Grote subeenheid
 Kleine subeenheid
o Eiwitten dan geëvolueerd tot beste enzymen




 Waarom RNA als boodschapper
o Zit in kern en cytoplasma
o RNA en DNA hebben zelfde taal
o DNA bij eukaryoten enkel in nucleus




 Experiment bewijs RNA (Brenner, Jacob, Meselson)
o Ribosomen zwaarder maken
 Doel
 Densiteit ribosomen veranderen
o Ribosomen zwaarder maken
 Benodigdheden
 Zwaardere isotopen C13 en N15
 Centrifuge
 Werkwijze
 Bacteriën opgroeien in zware isotopen
o Ribosomen worden zo zwaarder
 Uit lisaten ribosomen uithalen
 Densiteit van ribosomen onderzoeken
o Via centrifuge densiteit gradiënt
 Je ziet 2 banden
 Bovenste band -> zwaarder halve
ribosomen
 Onderste rand -> zwaardere hele ribosomen

, o Bacteriën infecteren met faag
 Doel
 Aantonen dat er een mRNA bestaat
 Benodigdheden
 Radioactieve P32
o Om nucleïnezuren te labelen
 Werkwijze
 Bacterien eerst zwaarder maken
 Bacteriën infecteren met faag
o Gaan virale eiwitten en RNA aanmaken
 Nieuwe RNA lichter dan oude
o Normale eiwit aanmaak van bacterieen stopt
 Terug in normaal medium met radioactief isotoop
o P32 wordt in nieuw RNA ingebouwd
 Om nieuw RNA op te sporen
 Waarneming
o Hybridisatie van radioactief RNA
 DNA-bacterie
 Geen hybridisatie
 DNA Faag
 Hybridisatie mogelijk
 RNA gemaakt op basis van viraal DNA




o Resultaten
 Bacteriofaag infectie leidt niet tot nieuwe ribosomen
 Bacteriofaag infectie induceert synthese van RNA dat associeert
met oude ribosomen
 Bacteriofaag induceert de synthese van een RNA dat hybridiseert
met een faag DNA maar niet met bacterieel DNA
 Alle ribosomen kunnen elk RNA coderen