Samenvatting Hoofdstuk 4 inleiding tot biochemische processen

H4: Eiwit-eiwit en eiwit-ligandinteracties

4.1. Inleiding

 Sterkte binding met bijhorende Kd waarde van 10-3 tot 10-12 M (zie H3 Calmoduline en Zn2+)
 Contactplaats op eiwit voor 2e eiwit ligt op opp en is complementair qua vorm en lading
 Meerdere (niet aaneensluitende) contactopp
 Scaffold-fctie: eiwitten die fungeren als bouwsteiger waarop vele eiwitten vasthechten ter
vorming van multi-eiwitcomplex (bv celadhesiecomolexen, signaalcomplex, celrespiratie:
enzymcomplexen)
 Bindingplaats kleinere (organische) molecule of ligand kan ook in een depressie of protrusie
(bv lus) zitten.
 Diepe groeve=cleft of diepe holte=pocket
 In binnenste eiwitdomein=cavity (ingesloten in intern micromilieu)
 Kan vormveranderingen of conformatieveranderingen ondergaan
 Treden op door binding partnermolecule (bv 2e eiwit, ligand of allostere inhibitor): zorgt
voor trigger => gaan zich vormelijk aan elkaar aanpassen = induced fit
 Conformatieverandering kan ook optreden na posttranslationele modificatie




4.2 Skelet- en hartspiercontracties: showcase van eiwit-eiwitcomplexen, ligand-
geïnduceerde conformatieveranderingen, cooperatieve werking en competitie

 Actine-eiwitten = dunne filamenten = opnames spiersarcomeerstructuur
 Myosines=multimeren= hexamere quaternaire structuur (2 zware pptketens en 2 van
verschillende types kleinere pptketens)
 ‘Hoofdjes’
 Sliding model= contact tssn dik en dun en regulatie ervan
 Tropomyosine: associeert met actinefilament
 Troponines hebben rol bij regulatie spiercontractie bij verhoging intracellulaire Ca2+
 Spiercontractie is show-case eiwitwerking
 DIAAAAAAAAAAAA
 D

,
, 4.3
Structuur-




fctieverbanden in eiwitten betrokken in O2-binding en transport

 Hemoglobine (Hb, bloedcel) en myoglobine (Mb, Myob, spierweefsel)
 Hb: O2 in bloedbaan transporteren
 Mb: O2 uit bloedbaan via diffusie binden en beschkbaar stellen voor mitochondrieen (ATP)




4.3.1 Myoglobine en hemoglobine binden O2 via haemgroep


 Binden O2 via prosthetische groep = haemgroep
 Haemgroep + O2 geeft rode kleur aan spieren en bloed

, Haemgroep= organische molecule (protoporfyrine IX)+ Fe2+ => Aromatisch karakter en
vlakke strctuur




4.3.2 Myoglobine:
eiwitstructuur en O2-
binding

 Mb = 153 AZ tot all-alfaklasse
 Bevat 8 alfa-helices verbonden door korte lussen
 Hydrofobe holte = haemzak gevormd tssn E en F helix
 Polaire propionaatgroep die naar buiten gericht zijn => unieke positie




 Histidines in E en F helices zijn
belangrijk
 Histidine in F-helix levert 5e
coordinatieve binding met ijzerion

, =>Fe ion uit haemvlak getrokken naar proximale His in F

 Myoglobine met haemgroep = deoxymyoglobine of deoxy-Myob kan 1 O2 binden waarbij
Oxy-myoglobine gevormd wordt




 His op E = distale His. O2 kan reversibele binding vormen met Fe2+ ion => 6 e coordinatieve
binding




 Concentratie van ligand
O2 dat door diffusie uit
aanwezig bloedcapilairen
in spiercellen
binnenkomt, de conc van myoblobine in deze cellen en affiniteit van Mb voor dit ligand zal de
hoeveelheid Myob-O2 in spiercellen bepalen
 Perifeer
weefsel zoals spierweefsel
is lage O2
 Zuurstofconcentratie wordt weergegeven door partieeldruk O2 (pO2)
 Lage partieeldruk van pO2 in rust = 20 torr = 20mmHg
 Intensie spierwerking: 10 Torr
 Om te kunnen werken
als effectieve
bindingsmolecule
verwacht mn hoge
affiniteit myoglobine
onder deze condities
 O2-dissociatiecurve

,