DEEL A - ALGEMENE BACTERIOLOGIE
1. Introductie
1.1 Evolutie
1.2 Historisch overzicht
1.3 Domeinen van het leven
1.4 Nomenclatuur
2. Morfologie van bacteriën en archaea
3. Microbiële celstructuur
3.1 Celenvelop
3.1.1 Celmembraan
3.1.2 Celwand
3.1.2.1 Gram-positieven
3.1.2.2 Gram-negatieven
3.1.2.3 Zuurvaste bacteriën
3.1.2.4 Archaea
3.1.2.5 Lysozym
3.1.3 Extracellulaire omhulsels
3.1.3.1 EPS-laag
3.1.3.2 S-laag
3.1.3.3 Slijmlaag
3.2 Extracellulaire structuren
3.2.1 Flagellum
3.2.2 Fimbriae, curli en pili
3.2.2.1 Fimbriae
3.2.2.2 Curli
3.2.2.3 Pili
3.2.2.3.1 F-pilus (fertiliteits- of sexpilus)
3.2.2.3.2 Type IV-pili
3.2.2.3.3 Type III- en type IV-secretiepili
3.3 Cytoplasma
3.3.1 Genomisch DNA
3.3.1.1 Chromosoom
3.3.1.2 Plasmiden
3.3.1.3 Bacteriofagen
3.3.2 Ribosomen
3.3.3 Endospore (en sporevorming)
3.3.4 Inclusies
3.3.4.1 Gasvacuolen
3.3.4.2 Intracellulaire reserves
4. Voedings- en fysische vereisten voor microbiële groei
4.1 Metabole diversiteit
4.2 Voedingselementen/-vereisten
4.3 Nutriëntopname – transportsystemen
4.3.1 Passief transport: gefaciliteerde diffusie
4.3.2 Actief transport
, 4.3.2.1 ABC-transporters – sideroforen
4.3.2.2 Secundaire transporters
4.3.2.3 Groepstranslocatie
4.4 Invloed omgevingsfactoren op microbiële groei
4.4.1 pH
4.4.2 Temperatuur
4.4.3 Zuurstof
4.4.4 H2O-beschikbaarheid
5. Microbiële groei
5.1 Celgroei: celcyclus en -deling
5.1.1 Celcyclus
5.1.2 Celdeling
5.2 Populatiegroei
5.2.1 Generatietijd
5.2.2 Groeisnelheid
5.2.3 Groeicurve
5.2.4 Batch- versus continue cultuur
5.3 Meting van microbiële groei
5.3.1 Directe methoden
5.3.1.1 Telkamer
5.3.1.2 Seriële verdunning
5.3.1.3 Filtermethode
5.3.1.4 Nat- en drooggewichtsbehandeling
5.3.2 Indirecte methode via turbidimetrie
5.4 Controle van microbiële groei
5.4.1 M.b.v. fysische methoden
5.4.1.1 Hitte
5.4.1.2 Straling
5.4.1.3 Filtratie
5.4.2 M.b.v. chemische agentia
5.4.2.1 Gassen
5.4.2.2 Fenolische verbindingen
5.4.2.3 Alcoholen
5.4.2.4 Halogenen
5.4.2.5 Andere agentia
6. Metabolisme
6.1 Katabolisme – energiegeneratie
6.1.1 Chemische energie: ATP
6.1.2 Elektrochemische energie: elektronentransport
6.1.3 ATP-productie
6.1.3.1 Substraatfosforylering
6.1.3.1.1 Glycolyse
6.1.3.1.2 Fermentatie
6.1.3.2 Elektronentransportfosforylering
6.1.3.2.1 Elektronentransportketen
6.1.3.2.2 PMF-generatie
6.1.3.2.3 ATP-synthase
6.1.3.3 Aerobe ademhaling
1. Introductie
1.1 Evolutie
1.2 Historisch overzicht
1.3 Domeinen van het leven
1.4 Nomenclatuur
2. Morfologie van bacteriën en archaea
3. Microbiële celstructuur
3.1 Celenvelop
3.1.1 Celmembraan
3.1.2 Celwand
3.1.2.1 Gram-positieven
3.1.2.2 Gram-negatieven
3.1.2.3 Zuurvaste bacteriën
3.1.2.4 Archaea
3.1.2.5 Lysozym
3.1.3 Extracellulaire omhulsels
3.1.3.1 EPS-laag
3.1.3.2 S-laag
3.1.3.3 Slijmlaag
3.2 Extracellulaire structuren
3.2.1 Flagellum
3.2.2 Fimbriae, curli en pili
3.2.2.1 Fimbriae
3.2.2.2 Curli
3.2.2.3 Pili
3.2.2.3.1 F-pilus (fertiliteits- of sexpilus)
3.2.2.3.2 Type IV-pili
3.2.2.3.3 Type III- en type IV-secretiepili
3.3 Cytoplasma
3.3.1 Genomisch DNA
3.3.1.1 Chromosoom
3.3.1.2 Plasmiden
3.3.1.3 Bacteriofagen
3.3.2 Ribosomen
3.3.3 Endospore (en sporevorming)
3.3.4 Inclusies
3.3.4.1 Gasvacuolen
3.3.4.2 Intracellulaire reserves
4. Voedings- en fysische vereisten voor microbiële groei
4.1 Metabole diversiteit
4.2 Voedingselementen/-vereisten
4.3 Nutriëntopname – transportsystemen
4.3.1 Passief transport: gefaciliteerde diffusie
4.3.2 Actief transport
, 4.3.2.1 ABC-transporters – sideroforen
4.3.2.2 Secundaire transporters
4.3.2.3 Groepstranslocatie
4.4 Invloed omgevingsfactoren op microbiële groei
4.4.1 pH
4.4.2 Temperatuur
4.4.3 Zuurstof
4.4.4 H2O-beschikbaarheid
5. Microbiële groei
5.1 Celgroei: celcyclus en -deling
5.1.1 Celcyclus
5.1.2 Celdeling
5.2 Populatiegroei
5.2.1 Generatietijd
5.2.2 Groeisnelheid
5.2.3 Groeicurve
5.2.4 Batch- versus continue cultuur
5.3 Meting van microbiële groei
5.3.1 Directe methoden
5.3.1.1 Telkamer
5.3.1.2 Seriële verdunning
5.3.1.3 Filtermethode
5.3.1.4 Nat- en drooggewichtsbehandeling
5.3.2 Indirecte methode via turbidimetrie
5.4 Controle van microbiële groei
5.4.1 M.b.v. fysische methoden
5.4.1.1 Hitte
5.4.1.2 Straling
5.4.1.3 Filtratie
5.4.2 M.b.v. chemische agentia
5.4.2.1 Gassen
5.4.2.2 Fenolische verbindingen
5.4.2.3 Alcoholen
5.4.2.4 Halogenen
5.4.2.5 Andere agentia
6. Metabolisme
6.1 Katabolisme – energiegeneratie
6.1.1 Chemische energie: ATP
6.1.2 Elektrochemische energie: elektronentransport
6.1.3 ATP-productie
6.1.3.1 Substraatfosforylering
6.1.3.1.1 Glycolyse
6.1.3.1.2 Fermentatie
6.1.3.2 Elektronentransportfosforylering
6.1.3.2.1 Elektronentransportketen
6.1.3.2.2 PMF-generatie
6.1.3.2.3 ATP-synthase
6.1.3.3 Aerobe ademhaling
