Samenvatting Biochemie
Inleidende colleges
Biochemische concepten
Verbranding van Glucose:
C6H12O6 + 6 O2 → 6 CO2 + 6 H2O Exothermreactie Levert energie
Zodra de ΔG negatief is vind de reactie spontaan plaats, je redeneert vanuit de stof
Verbreken van een binding kost energie
Vormen van een nieuwe binding levert energie
ΔH endotherm geen spontane reactie
Het verloop van energie kan worden weergegeven in energiediagrammen kunnen beide kanten
oplopen.
Figuur 1 Verloop in energiediagrammen
Een enzym verlaagt de activeringsenergie voor een reactie, daardoor gaat de reactie sneller,
oftewel wel i.p.v. niet bij lichaamstemperatuur.
Figuur 2 Weergave enzym activeringsenergie
Bij evenwichtsreacties aflopende reactie eenmaal gevormd gaat niet meer gemakkelijk terug.
wel makkelijk terug = als de reactie ook al terug kan verlopen is er sprake van een evenwicht
stel; er stelt zicht een evenwicht op in 28:8 verandering zicht dan stelt hij zich opnieuw in.
Enzym veranderd de ligging van het evenwicht niet, deze versnelt het instellen van het evenwicht.
Een enzym kan worden aangezet of uitgezet door verschillende soorten remming of activatie:
1. Allo sterische activatie = op een andere plek
2. Cocalente modificatie = door een binding… (reversibele
fosforylering)
Figuur 4 Cocalente modificatie door binding aan bv. serine residu
Figuur 3 Primaire eiwitstructuur
Figuur 5 Covalente modificatie door fosforylering
Pagina 1 van 19
,Eiwitten : bouw en functie
De aminozuurvolgorde bepaald de driedimensionale structuur bepaald weer de functie en
werking
Een organische redoxreactie in half reacties
Figuur 6 Verschillende oxidatieladders
CH4 + 2 H2O → CO2 + 8 H+ + 8 e
2 O2 + 8 H+ + 8 e → 4 H2O
___________________________+
CH4 + 2 O2 → CO2 + 2 H2O
Figuur 7 Biochemische notatie van biochemische reacties
Figuur 8 Scheikundige notatie van de eerste reactie
Elektronentransport
Omzetting van energie met behulp van protongradiënten
- Cel ademhaling (in mitochondriën) brandstof + O2 ATP
- Fotosynthese (in chloroplast) zonlicht (energie) ATP + Glucose
Pagina 2 van 19
, Beide gebruiken elektronentransportketens Citroenzuurcyclus vind plaats in de
mitochondriën en verbrand CO2 ( Energie NADH en FADH2 = brandstof)
Figuur 9 Overzicht van de citroenzuurcyclus
Figuur 10 Rode pijl geeft weer: elektronen worden via een serie redoxreacties overgedragen van
NADA op O2
- Oxidator Neemt elektronen op
o Sterkte van een oxidator gaan de elektronen naar links, dan is daar een sterker
oxidator. Dan H+ bijvoorbeeld Cu2+ met Cu elektronen + waarde in tabel
- Reductor Staat elektronen af
Figuur 11 Voorbeeld redoxreactie
Standaard Electrode potentiaal: Hoe hoger de + waarde, Hoe sterker de oxidator
Spontane reactie: Oxidator boven reductor Als andersom: door energie toe te voegen.
Electrolyse: Cl2 uit zeewater.
Fotosynthese: energiebron zonlicht
Totaalreactie elektronentransportketen (celademhaling)
½ O2 + NADH + H+ → H2O + NAD+
In de elektronen transportketen gaat dit met tussenstappen. Hierbij worden oxidatoren die zwakker
zijn dan O2 gebruikt en weer terug gevormd. O.a. Fe3+ (als onderdeel van een cytochroom eiwit).
Pagina 3 van 19
Inleidende colleges
Biochemische concepten
Verbranding van Glucose:
C6H12O6 + 6 O2 → 6 CO2 + 6 H2O Exothermreactie Levert energie
Zodra de ΔG negatief is vind de reactie spontaan plaats, je redeneert vanuit de stof
Verbreken van een binding kost energie
Vormen van een nieuwe binding levert energie
ΔH endotherm geen spontane reactie
Het verloop van energie kan worden weergegeven in energiediagrammen kunnen beide kanten
oplopen.
Figuur 1 Verloop in energiediagrammen
Een enzym verlaagt de activeringsenergie voor een reactie, daardoor gaat de reactie sneller,
oftewel wel i.p.v. niet bij lichaamstemperatuur.
Figuur 2 Weergave enzym activeringsenergie
Bij evenwichtsreacties aflopende reactie eenmaal gevormd gaat niet meer gemakkelijk terug.
wel makkelijk terug = als de reactie ook al terug kan verlopen is er sprake van een evenwicht
stel; er stelt zicht een evenwicht op in 28:8 verandering zicht dan stelt hij zich opnieuw in.
Enzym veranderd de ligging van het evenwicht niet, deze versnelt het instellen van het evenwicht.
Een enzym kan worden aangezet of uitgezet door verschillende soorten remming of activatie:
1. Allo sterische activatie = op een andere plek
2. Cocalente modificatie = door een binding… (reversibele
fosforylering)
Figuur 4 Cocalente modificatie door binding aan bv. serine residu
Figuur 3 Primaire eiwitstructuur
Figuur 5 Covalente modificatie door fosforylering
Pagina 1 van 19
,Eiwitten : bouw en functie
De aminozuurvolgorde bepaald de driedimensionale structuur bepaald weer de functie en
werking
Een organische redoxreactie in half reacties
Figuur 6 Verschillende oxidatieladders
CH4 + 2 H2O → CO2 + 8 H+ + 8 e
2 O2 + 8 H+ + 8 e → 4 H2O
___________________________+
CH4 + 2 O2 → CO2 + 2 H2O
Figuur 7 Biochemische notatie van biochemische reacties
Figuur 8 Scheikundige notatie van de eerste reactie
Elektronentransport
Omzetting van energie met behulp van protongradiënten
- Cel ademhaling (in mitochondriën) brandstof + O2 ATP
- Fotosynthese (in chloroplast) zonlicht (energie) ATP + Glucose
Pagina 2 van 19
, Beide gebruiken elektronentransportketens Citroenzuurcyclus vind plaats in de
mitochondriën en verbrand CO2 ( Energie NADH en FADH2 = brandstof)
Figuur 9 Overzicht van de citroenzuurcyclus
Figuur 10 Rode pijl geeft weer: elektronen worden via een serie redoxreacties overgedragen van
NADA op O2
- Oxidator Neemt elektronen op
o Sterkte van een oxidator gaan de elektronen naar links, dan is daar een sterker
oxidator. Dan H+ bijvoorbeeld Cu2+ met Cu elektronen + waarde in tabel
- Reductor Staat elektronen af
Figuur 11 Voorbeeld redoxreactie
Standaard Electrode potentiaal: Hoe hoger de + waarde, Hoe sterker de oxidator
Spontane reactie: Oxidator boven reductor Als andersom: door energie toe te voegen.
Electrolyse: Cl2 uit zeewater.
Fotosynthese: energiebron zonlicht
Totaalreactie elektronentransportketen (celademhaling)
½ O2 + NADH + H+ → H2O + NAD+
In de elektronen transportketen gaat dit met tussenstappen. Hierbij worden oxidatoren die zwakker
zijn dan O2 gebruikt en weer terug gevormd. O.a. Fe3+ (als onderdeel van een cytochroom eiwit).
Pagina 3 van 19
