100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached 4.2 TrustPilot
logo-home
Summary

Samenvatting Inleiding systeembiologie

Rating
-
Sold
7
Pages
13
Uploaded on
22-03-2021
Written in
2020/2021

Samenvatting van het vak Inleiding systeembiologie, gegeven tijdens het 3e jaar van Medische natuurwetenschappen.

Institution
Course









Whoops! We can’t load your doc right now. Try again or contact support.

Written for

Institution
Study
Course

Document information

Uploaded on
March 22, 2021
Number of pages
13
Written in
2020/2021
Type
Summary

Subjects

Content preview

Balans opstellen
K1+: deze reactie gaat naar rechts Massa actie kinetiek
K1-: deze reactie gaat naar links Snelheden
K2: deze reactie gaat maar 1 kant op, in dit geval naar rechts. Evenwicht & steady-state
Hoofdletters: naam
Kleine letters: concentratie
E: enzym
S: substraat Dit is een gesloten systeem, want
ES: gebonden enzym en substraat er wordt niks aan- of afgevoerd.
P: product
S: als een stof onderstreept is, dan betekent het dat het een constante
concentratie heeft. Er wordt dus steeds extra S toegevoegd om de
concentratie gelijk te houden. Voor deze stoffen hoef je nooit een balans
op te stellen!




1. Systeem definiëren
Parameter = constant
Variabele= niet constant
2. Balans opstellen
3. Kinetiek bepalen
V1 en V2 invullen
4. Stationaire punten bepalen
Stationaire toestand = wanneer de r.c. niet meer verandert
en dus geldt dx/dt = 0. Dit is op het snijpunt van V1 en V2.
Rate characteristic = een grafiek waarin te zien is hoe
processen afhangen van X.




Er zijn 2 soorten:
1. Massa actie kinetiek
2. Enzym kinetiek
Enzym kinetiek gebruik je als er enzym katalysatie bij betrokken is. Dit kan zijn: het vormen van een complex tussen 2
eiwitten / het binden van een ligand aan een receptor / spontane chemische reactie.



Belangrijk:
• De reactie gaat maar 1 kant op, dus gebruik je het
proces k1+.
• 2x moet je noteren als x2 in de balans.
• Je begint met 2 x en eindigt met 1 x, er gaat dus 1 x
af. Hierdoor schrijf je in de balans een - . Dit noem je
de storcheometrische coëfficiënt.




Summary Pagina 1

, Er zijn 2 soorten stationary states:
1. Steady-state
2. Equilibrium (evenwicht)
Voorbeelden:
S→X→P Heeft equilibrium. Uitleg: S, X en P zijn variabelen. Als je S toevoegt wordt dit omgezet in X. X wordt
omgezet in P. De reactie stopt wanneer alle stoffen in evenwicht zijn. De bijbehorende balansen zijn:
ds/dt= -v1. dx/dt=v1-v2. dp/dt=v2. Je kan het ook op een andere manier uitleggen; bij steady state geldt
er dat ds/dt=0. Dit betekent dat ds/dt = -v1 = 0. De snelheid van reactie 1 is dus 0. Als de snelheden 0 zijn,
is er sprake van evenwicht.
S→X→P Heeft equilibrium. Uitleg: stel je zet S op 1 dan wordt dit omgezet in X. X wordt omgezet in P. Er ontstaat
een evenwicht als alle stoffen een concentratie van 1 hebben. De bijbehorende balansen zijn: dx/dt = v1 -
v2. dp/dt = v2. Let op: je stelt dus geen balans op voor S.
S→X→P Heeft (meestal) een steady-state, maar dit is afhankelijk van de concentraties van S en P. Er is een
constante stroom door het systeem. Op het moment dat v1=v2 heb je een steady-state. Stel dat er geldt
v=0 op het moment van v1=v2, dan krijg je equilibrium. Dit is dus alleen bij specifieke/ unieke waarden
van S en P.
Heeft steady-state. Uitleg: er geldt V kinase = Vp, dus er is een steady state.




Volgorde van stappen tot systeembeschrijving?
1. Variabelen en parameters vaststellen
2. Balans opstellen
3. Kinetiek bepalen
4. Stationaire punten bepalen

Geef de balans van




dx/dt = v1 - v2
dy/dt = v2 - v3
dz/dt = v3 - v4
n.b. Z heeft ook invloed op X, maar dat hoef je niet te geven bij de balans. Als er gevraagd wordt om de
snelheden (rate equation), dan moet je wel rekening houden met Z.

Geef de balans van:




dx/dt = v1 - v2
dy/dt = v3 - v4
n.b. L heeft geen streep eronder dus je zou hier ook een balans voor kunnen opstellen, maar er zijn
verder geen stoffen die hem beïnvloeden. De stippellijn betekent regulatoire interactie, het heeft dus
invloed op een snelheid.





Summary Pagina 2

Get to know the seller

Seller avatar
Reputation scores are based on the amount of documents a seller has sold for a fee and the reviews they have received for those documents. There are three levels: Bronze, Silver and Gold. The better the reputation, the more your can rely on the quality of the sellers work.
boekentijger Vrije Universiteit Amsterdam
Follow You need to be logged in order to follow users or courses
Sold
184
Member since
7 year
Number of followers
128
Documents
51
Last sold
6 months ago
Samenvattingen en meer!

Ik bied mijn samenvattingen, hoorcollege aantekeningen, etc. van vakken aan die worden gegeven tijdens de studie Medische natuurwetenschappen en de minor 5 big issues in health aan de Vrije Universiteit Amsterdam! I also have English summaries for the master Biomedical Engineering given at Eindhoven University of Technology.

3.7

29 reviews

5
3
4
18
3
6
2
1
1
1

Recently viewed by you

Why students choose Stuvia

Created by fellow students, verified by reviews

Quality you can trust: written by students who passed their tests and reviewed by others who've used these notes.

Didn't get what you expected? Choose another document

No worries! You can instantly pick a different document that better fits what you're looking for.

Pay as you like, start learning right away

No subscription, no commitments. Pay the way you're used to via credit card and download your PDF document instantly.

Student with book image

“Bought, downloaded, and aced it. It really can be that simple.”

Alisha Student

Frequently asked questions