Periode 3
03-001:
ImageJ is een gratis biomedisch beeldbewerkingsprogramma
- Windows
- MacOS
- Linux
Mogelijkheden:
- Histogramanalyse
- ROI-metingen
- Filters
- DICOM-beelden
Semi-logaritmisch grafiek papier
- y= 10^x
- aflezen: grafiek van y = 2 x 10^x
,03-003:
Opdracht 1: Matrix
Open het beeld Xray.tif en beantwoord onderstaande vragen:
1. Hoe groot is de matrix?
,325,0 x 325,0
Halveer de matrixgrootte met behulp van de plugin Matrix.
2. Verandert het beeld?
- Ja, het wordt meer ingezoomd
Probeer andere matrixgrootten.
1. Bij welke optie worden pixels zichtbaar?
- 81,25 x 81,25
Opdracht 2: Bitdiepte
Open het beeld Xray en beantwoord onderstaande vragen:
1.Wat is de bitdiepte?
- 8 bits
1.Wat is de maximale en de minimale grijswaarde die mogelijk is bij deze bitdiepte?
- Image show info display range, wit is laag en zwart is hoog, dit is
alleen bij röntgen
- 0-255
- Grijswaarde berekenen 2^bitdiepte
Kies met behulp van de plugin Bitdiepte een nieuwe bitdiepte. Loop het menuutje af:
7,6,5,4,3,2,1 bit waarbij je dient terug te gaan naar het originele beeld voordat je een nieuwe
keuze selecteert.
- 1 = beeldkwaliteit is heel slecht, je ziet alleen grijs en wit
- 2 = beeldkwaliteit is slecht, je ziet alleen de kleuren wit, grijs, zwart
o Je ziet valse contouren, die kan je met het blote oog zien, als de bitdiepte hoger
is dan kan je het niet onderscheiden
- 3 = beeldkwaliteit is nog steeds slecht, je ziet wel iets meer details
- 4 = beeldkwaliteit is beter, meer details
- 5 = beeldkwaliteit is nog beter, meer details
- 6 = beeldkwaliteit is beter
- 7 = beeldkwaliteit verschilt weinig met 8
3.Bij welke bitdiepte zie je de beeldkwaliteit zichtbaar afnemen of valse contouren
ontstaan in het beeld?
, - Bij bitdiepte 1-4
3.Bij welke bitdiepte is de beeldkwaliteit zichtbaar afgenomen?
- Bitdiepte 4
3.Leg uit waarom valse contouren ontstaan.
- Mensen zien tot 40 grijswaarden, daarboven zien we geen verschil
3.Wat is het verband tussen het aantal bits per pixel en het aantal mogelijke
grijswaarden (helderheidsniveau ’s)?
- Als de grijswaarden lager zijn, dan heb je minder pixels per bits
Opdracht 3: Window en Level
Open het beeld Xray.
Bekijk het histogram (Analyze > Histogram, of CTRL-H).
1. Waarom heeft een lage pixelwaarde een hoge helderheid?
- Lage pixelwaarde heeft weinig details, fotonen komen minder door bot heen en daar is
het wit. Wit in het röntgenbeeld zijn de botten.
1. Wat in het beeld is de smalle piek aan de rechterkant in het histogram?
- De zijkant van het beeld is zwart, dus lucht. Dat heeft een hoge bitdipete
Het window en level zijn aan te passen door de optie Image>Adjust>Window/Level.
Bij deze foto is het window: 269 en het level: 128
1.Wat is het effect van een groot window op het beeld? Leg uit waarom een groot
window dit effect heeft.
- Het beeld wordt donkerder, mate van details nemen af. Met window
verander je de scherpte bij de breedte van het beeld. Hoe hoger de
window, hoe meer de lijn met de klok meedraait. De window is perfect als
het lijntje horizontaal door het beeld gaat
1.Wat is het effect van een hoog level op het beeld? Leg uit waarom een hoog level dit
effect heeft.
- Het level gaat over de hoogte in venster, als je het level verhoogt dan wordt het beeld
witter en de details nemen af. Level kleiner = donkerder
Als de bitdiepte hoger is dan is de
grijswaarde te onderscheiden.
Matrix kleiner wordt, is het beeld
meer ingezoomd
Valse contouren: mensen zien tot 40
grijswaarden, daarboven is geen
verschil
Grijswaarden laag? = minder pixels
per bits
Lage pixel waarden: weinig details,
fotonen komen minder door bot
heen en daar is het wit. Wit in het
röntgenbeeld zijn de botten.
03-005
Opdracht 1 Buislading en ruis
03-001:
ImageJ is een gratis biomedisch beeldbewerkingsprogramma
- Windows
- MacOS
- Linux
Mogelijkheden:
- Histogramanalyse
- ROI-metingen
- Filters
- DICOM-beelden
Semi-logaritmisch grafiek papier
- y= 10^x
- aflezen: grafiek van y = 2 x 10^x
,03-003:
Opdracht 1: Matrix
Open het beeld Xray.tif en beantwoord onderstaande vragen:
1. Hoe groot is de matrix?
,325,0 x 325,0
Halveer de matrixgrootte met behulp van de plugin Matrix.
2. Verandert het beeld?
- Ja, het wordt meer ingezoomd
Probeer andere matrixgrootten.
1. Bij welke optie worden pixels zichtbaar?
- 81,25 x 81,25
Opdracht 2: Bitdiepte
Open het beeld Xray en beantwoord onderstaande vragen:
1.Wat is de bitdiepte?
- 8 bits
1.Wat is de maximale en de minimale grijswaarde die mogelijk is bij deze bitdiepte?
- Image show info display range, wit is laag en zwart is hoog, dit is
alleen bij röntgen
- 0-255
- Grijswaarde berekenen 2^bitdiepte
Kies met behulp van de plugin Bitdiepte een nieuwe bitdiepte. Loop het menuutje af:
7,6,5,4,3,2,1 bit waarbij je dient terug te gaan naar het originele beeld voordat je een nieuwe
keuze selecteert.
- 1 = beeldkwaliteit is heel slecht, je ziet alleen grijs en wit
- 2 = beeldkwaliteit is slecht, je ziet alleen de kleuren wit, grijs, zwart
o Je ziet valse contouren, die kan je met het blote oog zien, als de bitdiepte hoger
is dan kan je het niet onderscheiden
- 3 = beeldkwaliteit is nog steeds slecht, je ziet wel iets meer details
- 4 = beeldkwaliteit is beter, meer details
- 5 = beeldkwaliteit is nog beter, meer details
- 6 = beeldkwaliteit is beter
- 7 = beeldkwaliteit verschilt weinig met 8
3.Bij welke bitdiepte zie je de beeldkwaliteit zichtbaar afnemen of valse contouren
ontstaan in het beeld?
, - Bij bitdiepte 1-4
3.Bij welke bitdiepte is de beeldkwaliteit zichtbaar afgenomen?
- Bitdiepte 4
3.Leg uit waarom valse contouren ontstaan.
- Mensen zien tot 40 grijswaarden, daarboven zien we geen verschil
3.Wat is het verband tussen het aantal bits per pixel en het aantal mogelijke
grijswaarden (helderheidsniveau ’s)?
- Als de grijswaarden lager zijn, dan heb je minder pixels per bits
Opdracht 3: Window en Level
Open het beeld Xray.
Bekijk het histogram (Analyze > Histogram, of CTRL-H).
1. Waarom heeft een lage pixelwaarde een hoge helderheid?
- Lage pixelwaarde heeft weinig details, fotonen komen minder door bot heen en daar is
het wit. Wit in het röntgenbeeld zijn de botten.
1. Wat in het beeld is de smalle piek aan de rechterkant in het histogram?
- De zijkant van het beeld is zwart, dus lucht. Dat heeft een hoge bitdipete
Het window en level zijn aan te passen door de optie Image>Adjust>Window/Level.
Bij deze foto is het window: 269 en het level: 128
1.Wat is het effect van een groot window op het beeld? Leg uit waarom een groot
window dit effect heeft.
- Het beeld wordt donkerder, mate van details nemen af. Met window
verander je de scherpte bij de breedte van het beeld. Hoe hoger de
window, hoe meer de lijn met de klok meedraait. De window is perfect als
het lijntje horizontaal door het beeld gaat
1.Wat is het effect van een hoog level op het beeld? Leg uit waarom een hoog level dit
effect heeft.
- Het level gaat over de hoogte in venster, als je het level verhoogt dan wordt het beeld
witter en de details nemen af. Level kleiner = donkerder
Als de bitdiepte hoger is dan is de
grijswaarde te onderscheiden.
Matrix kleiner wordt, is het beeld
meer ingezoomd
Valse contouren: mensen zien tot 40
grijswaarden, daarboven is geen
verschil
Grijswaarden laag? = minder pixels
per bits
Lage pixel waarden: weinig details,
fotonen komen minder door bot
heen en daar is het wit. Wit in het
röntgenbeeld zijn de botten.
03-005
Opdracht 1 Buislading en ruis
