KLASSIFIZIERUNG VON MIKRO ORGANISME N
.
1 phänotypische analyse .
2
genotypische analyse
al
Morphologie al
DNA-DNA-Hybridisierung
a Beweglichkeit b) GC-Werte
c) Metabolismus CDNA
Profiling
a)
al Physiologie Multilocus-Sequenztypisierung
el Zellipidchemie
.
3
phylogenetischeanalyseganzergenome
f)Zellwandchemie
BEZIE HUNGEN DER MIKRO ORGANIS MEN
HOMOLOGE
-Gene die von einem
,
gemeinsamen
Vorfahren vererbt wurden
L ~
ORTHOLOGE PARALOGE
Gene die
Gene die von einem
gemeinsamen von einem
gemeinsamen
-
-
,
,
Vorfahren vererbt wurden Vorfahren vererbt wurden
unterschied Funktion haben
+ die
gleiche Funktion haben +
.
(z B
. .
bei Genduplikation)
ARCHAE N
·
schon immer da
-
leben in heißer + saurer
Umgebung
· kein Zellkern
·
Einzeller
↑ Extremophile :
hyperthermophil oo (heiße Quellen metallophil in konterminierten Böden
psycrophil 15 % (Eis Tiefseel
,
Oligotroph benötigt wenig Nährstoffe
piezophil/barophil niedriger Druck (Tiefsee) anaerob O ist toxisch/tödlich
acidophil pH 2 halophil 2-5MNaCI (Salzsee
alkaliphil pH 10
, CRENARCHAEOTA ARCHAE N
EURYARCHAEOTA
-
archaeelle
Symbiose ↑ viele methanogen
KORARCHAEOTA
. Nanoauchaeum
z B .
-
equitans & Ignicoccus hospitalis + anaerob (O +
4H , CH + 2H , 0
kleinstes archaelles Genom
·
Thermoplasmatales thermoacidophil :
↳
Symbiot . Gemeinschaft
NANOARCHAEOTA -
Zellmembran ,
aber keine Zellwang
·
Desulforococcales :
- sehr klein
>
-
Pyrolobus fumavii :
rauchende Feuerlappen -
wachsen bei ca. 602
↳ aus Blacksmoker · Picrophilus am acidophilsten (pH =
0 .
6)
THAUMARCHAEOTA
~
Topt =
106 C
°
(wächst bei höchsten
·
Thermococcales :
Hyperthermophil
bekannten Temperatur =
113
°
C) -
schlafend >
-
Thermococcus :
~
chemolitotroph
↳ wachsen sehr langsam
↳
Hz +
NUs NH , Topt 85-90°
=
>
- ~
·
Nitrososphaerales
Raumtemp =Kältestarre
sulfolobales acidophil hyperthermophil
~
· : .
,
acrob chemolitotroph Nitrosopumilales Pyrococcus heterotroph
·
,
>
- :
,
anaerob
-Schwefellappen Cenarchaeales
- Topt 100%
· =
können in heißer Batteriesäure wachsen
HS/H +
-
-S -
He
LOKIARCHAEUM
-
HS/S H , SO ·
Halobacteriales
>
-
am ähnlichsten
·
Methanobacteriales
> sulfolobus acidocaldarius
zu
Eukaryoten ·
Methanosarcinales
·
Methanomicrobiales
> Acidianus infernus ·
Methanococcales
Methanopyrales
·
·
Thermoproteales ·
Archaeoglobales
.
1 phänotypische analyse .
2
genotypische analyse
al
Morphologie al
DNA-DNA-Hybridisierung
a Beweglichkeit b) GC-Werte
c) Metabolismus CDNA
Profiling
a)
al Physiologie Multilocus-Sequenztypisierung
el Zellipidchemie
.
3
phylogenetischeanalyseganzergenome
f)Zellwandchemie
BEZIE HUNGEN DER MIKRO ORGANIS MEN
HOMOLOGE
-Gene die von einem
,
gemeinsamen
Vorfahren vererbt wurden
L ~
ORTHOLOGE PARALOGE
Gene die
Gene die von einem
gemeinsamen von einem
gemeinsamen
-
-
,
,
Vorfahren vererbt wurden Vorfahren vererbt wurden
unterschied Funktion haben
+ die
gleiche Funktion haben +
.
(z B
. .
bei Genduplikation)
ARCHAE N
·
schon immer da
-
leben in heißer + saurer
Umgebung
· kein Zellkern
·
Einzeller
↑ Extremophile :
hyperthermophil oo (heiße Quellen metallophil in konterminierten Böden
psycrophil 15 % (Eis Tiefseel
,
Oligotroph benötigt wenig Nährstoffe
piezophil/barophil niedriger Druck (Tiefsee) anaerob O ist toxisch/tödlich
acidophil pH 2 halophil 2-5MNaCI (Salzsee
alkaliphil pH 10
, CRENARCHAEOTA ARCHAE N
EURYARCHAEOTA
-
archaeelle
Symbiose ↑ viele methanogen
KORARCHAEOTA
. Nanoauchaeum
z B .
-
equitans & Ignicoccus hospitalis + anaerob (O +
4H , CH + 2H , 0
kleinstes archaelles Genom
·
Thermoplasmatales thermoacidophil :
↳
Symbiot . Gemeinschaft
NANOARCHAEOTA -
Zellmembran ,
aber keine Zellwang
·
Desulforococcales :
- sehr klein
>
-
Pyrolobus fumavii :
rauchende Feuerlappen -
wachsen bei ca. 602
↳ aus Blacksmoker · Picrophilus am acidophilsten (pH =
0 .
6)
THAUMARCHAEOTA
~
Topt =
106 C
°
(wächst bei höchsten
·
Thermococcales :
Hyperthermophil
bekannten Temperatur =
113
°
C) -
schlafend >
-
Thermococcus :
~
chemolitotroph
↳ wachsen sehr langsam
↳
Hz +
NUs NH , Topt 85-90°
=
>
- ~
·
Nitrososphaerales
Raumtemp =Kältestarre
sulfolobales acidophil hyperthermophil
~
· : .
,
acrob chemolitotroph Nitrosopumilales Pyrococcus heterotroph
·
,
>
- :
,
anaerob
-Schwefellappen Cenarchaeales
- Topt 100%
· =
können in heißer Batteriesäure wachsen
HS/H +
-
-S -
He
LOKIARCHAEUM
-
HS/S H , SO ·
Halobacteriales
>
-
am ähnlichsten
·
Methanobacteriales
> sulfolobus acidocaldarius
zu
Eukaryoten ·
Methanosarcinales
·
Methanomicrobiales
> Acidianus infernus ·
Methanococcales
Methanopyrales
·
·
Thermoproteales ·
Archaeoglobales
