Begrippen + Uitleg Microben UvA
Introductie Microben
MRSA =
bacterie die methicillin resistent is (Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus)
Streptococcus pneumoniae=
Longontsteking
Mycobacterium tuberculosis
Tuberculose (TB)
Salmonella typhimurium & Escherichia coli
Voedselvergiftiging
Helicobacter pylori
Maagzweer
Neisseria gonorrhoeae
Gonorroe
Legionella pneumophila
Veteranenziekte
Haemophilus influenzae
Hersenvliesontsteking
Bacillus anthracis
Miltvuur (antrax)
Candida albicans
Infectie in de normale vaginale en mond flora (gist) opportunistische pathogeen. Een gist die in de
menselijke darm leeft. Kan voor ziekte zorgen als er overgroei is “candidiasis”, bijvoorbeeld bij een
verzwakt immuunsysteem.
Fusarium
Schimmel die planten ziek kan maken
Phytophthora (infestans)
,Schimmel die leidt tot aardappelziekte
Plasmodium falciparum
Eencellige protozoa die malaria veroorzaakt
Trypanosoma brucei
Slaapziekte, veroorzaakt door eencellige parasiet
Leishmania major
Leishmaniasis, veroorzaakt door eencellige parasiet, infecteert immuunsysteem
Hepatitis
Virusinfectie, ontsteking van de lever
Dengue
Virusinfectie die wordt overgedragen door een mug
HIV
Virusinfectie, veroorzaakt aids, soa, valt immuunsysteem aan
Polio
Virusinfectie, veroorzaakt kinderverlamming
Measles
Virusinfectie (mazelen) kinderhuiduitslag
Vaccine (attenuated)
Immuniteit veroorzaakt door het inbrengen van een verzwakte ziektestam
Stimulatie van een immuunsysteem reactie door een verzwakte ziekteverwekker
Pasteur
Louis pasteur ontwikkelde het eerste vaccin (Fowl cholera, rabies)
Symbiosis
Langdurige samenleving tussen twee of meer organisme van verschillende soorten waarbij minstens
1 een voordeel heeft
Rhizobium
wortelknobbelbacterien , beide voordelige symbiose met planten, fixeren stikstof
Mycorrhiza
Samenwerking tussen planten en schimmels. Mineralen uit de grond in ruil door gemaakte suikers
Lichens (korstmossen)
Schimmel die in voordelige symbiose samenleeft met alg of blauwwier, heeft een cortical laag, algal
laag, medulla laag.
,Microbiome
Essentiële symbiose met hogere organismen zoals darmflora en huidflora
Flemming
Alexander Fleming ontdekte het eerste antibiotica, penicillium (doodt bacteriën) gemaakt uit een
schimmel.
Examples of food preservation/processing
- bier door gist
- brood door gist en bacterien
- soya (Natto) = Bacillus subtillis
- tempeh = rhizopus oligosporus
3 essential roles of bacteria
- Fixatie van stikstof
- Nutriënten recycling : voedingstoffen kringloop
- Regulatie van zuurstof
- Microbioom
3 useful activities of viruses
- Algenbloei controleren
- Kleuren van tulpen breken
- Gentherapie en transformatie van eucaryotische cellen
microbial scale (micrometres)
Hooke (cell)
Robert Hooke, eerste microscoop gemaakt, bekeek soort schimmel: mold, introduceerde de term cell
Basic forms (bacilli, cocci, spiral)
Bacilli= lange en korte ketens (filamenten)
Spirochetes/spiral = gedraaide bacterien (soort helix) (sneller te verplaatsen in water)
, cocco = ronde bactierien die in ketens groeien
Wavelength visible light~bacterial cell
Golflengte moet gelijk of kleiner zijn dan het object om de vorm te kunnen zien
700 nm tot 400 nm
bright field
Creëert een donkere afbeelding van een object over een lichte achtergrond
oil emersion
Olie voor de lens plaatsen die het licht anders breekt waardoor de resolutie hoger wordt
Gram-stain
Verschil tussen twee type bacterien
Gram Positieve = bacterien met een dikkere celwand (houden de kristal violet stain)
Gram negatief = heeft dunne celwand dus de kleur blijft minder goed binnen
negative stain
de achtergrond een kleur geven zodat het object beter zichtbaar is
DAPI
Fluorescerende microscoop, het organisme absorbeert licht van een bepaalde golflengte en zend een
lagere energie en grotere golflengte uit
Fluorophore = fluorescerent chemisch onderdeel (chemical affinity, labeled antibodies, DNA/RNA
hybridization
Immunofluorescence (primary/secondary antibody)
Techniek van lichtmicroscopie met een fluorescentie microscoop
Primary antibody is chemisch gelinkt aan fluor, de primary antibody bindt aan het antigen
Secondary antibodies binden aan de primary antibody en niet direct aan het antigen
GFP
Groene fluorescerende kleur uit kwallen, van eiwit, handig om eiwit te lokaliseren
sepF bind aan GFP
phase contrast microscope (Zernike)
Werkt met twee lichtbundels met een onderling faseverschil, creëert interferentie, duidelijk beeld
zonder kleuring nodig. Diepte effect, kijken naar live cellen en organellen
Introductie Microben
MRSA =
bacterie die methicillin resistent is (Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus)
Streptococcus pneumoniae=
Longontsteking
Mycobacterium tuberculosis
Tuberculose (TB)
Salmonella typhimurium & Escherichia coli
Voedselvergiftiging
Helicobacter pylori
Maagzweer
Neisseria gonorrhoeae
Gonorroe
Legionella pneumophila
Veteranenziekte
Haemophilus influenzae
Hersenvliesontsteking
Bacillus anthracis
Miltvuur (antrax)
Candida albicans
Infectie in de normale vaginale en mond flora (gist) opportunistische pathogeen. Een gist die in de
menselijke darm leeft. Kan voor ziekte zorgen als er overgroei is “candidiasis”, bijvoorbeeld bij een
verzwakt immuunsysteem.
Fusarium
Schimmel die planten ziek kan maken
Phytophthora (infestans)
,Schimmel die leidt tot aardappelziekte
Plasmodium falciparum
Eencellige protozoa die malaria veroorzaakt
Trypanosoma brucei
Slaapziekte, veroorzaakt door eencellige parasiet
Leishmania major
Leishmaniasis, veroorzaakt door eencellige parasiet, infecteert immuunsysteem
Hepatitis
Virusinfectie, ontsteking van de lever
Dengue
Virusinfectie die wordt overgedragen door een mug
HIV
Virusinfectie, veroorzaakt aids, soa, valt immuunsysteem aan
Polio
Virusinfectie, veroorzaakt kinderverlamming
Measles
Virusinfectie (mazelen) kinderhuiduitslag
Vaccine (attenuated)
Immuniteit veroorzaakt door het inbrengen van een verzwakte ziektestam
Stimulatie van een immuunsysteem reactie door een verzwakte ziekteverwekker
Pasteur
Louis pasteur ontwikkelde het eerste vaccin (Fowl cholera, rabies)
Symbiosis
Langdurige samenleving tussen twee of meer organisme van verschillende soorten waarbij minstens
1 een voordeel heeft
Rhizobium
wortelknobbelbacterien , beide voordelige symbiose met planten, fixeren stikstof
Mycorrhiza
Samenwerking tussen planten en schimmels. Mineralen uit de grond in ruil door gemaakte suikers
Lichens (korstmossen)
Schimmel die in voordelige symbiose samenleeft met alg of blauwwier, heeft een cortical laag, algal
laag, medulla laag.
,Microbiome
Essentiële symbiose met hogere organismen zoals darmflora en huidflora
Flemming
Alexander Fleming ontdekte het eerste antibiotica, penicillium (doodt bacteriën) gemaakt uit een
schimmel.
Examples of food preservation/processing
- bier door gist
- brood door gist en bacterien
- soya (Natto) = Bacillus subtillis
- tempeh = rhizopus oligosporus
3 essential roles of bacteria
- Fixatie van stikstof
- Nutriënten recycling : voedingstoffen kringloop
- Regulatie van zuurstof
- Microbioom
3 useful activities of viruses
- Algenbloei controleren
- Kleuren van tulpen breken
- Gentherapie en transformatie van eucaryotische cellen
microbial scale (micrometres)
Hooke (cell)
Robert Hooke, eerste microscoop gemaakt, bekeek soort schimmel: mold, introduceerde de term cell
Basic forms (bacilli, cocci, spiral)
Bacilli= lange en korte ketens (filamenten)
Spirochetes/spiral = gedraaide bacterien (soort helix) (sneller te verplaatsen in water)
, cocco = ronde bactierien die in ketens groeien
Wavelength visible light~bacterial cell
Golflengte moet gelijk of kleiner zijn dan het object om de vorm te kunnen zien
700 nm tot 400 nm
bright field
Creëert een donkere afbeelding van een object over een lichte achtergrond
oil emersion
Olie voor de lens plaatsen die het licht anders breekt waardoor de resolutie hoger wordt
Gram-stain
Verschil tussen twee type bacterien
Gram Positieve = bacterien met een dikkere celwand (houden de kristal violet stain)
Gram negatief = heeft dunne celwand dus de kleur blijft minder goed binnen
negative stain
de achtergrond een kleur geven zodat het object beter zichtbaar is
DAPI
Fluorescerende microscoop, het organisme absorbeert licht van een bepaalde golflengte en zend een
lagere energie en grotere golflengte uit
Fluorophore = fluorescerent chemisch onderdeel (chemical affinity, labeled antibodies, DNA/RNA
hybridization
Immunofluorescence (primary/secondary antibody)
Techniek van lichtmicroscopie met een fluorescentie microscoop
Primary antibody is chemisch gelinkt aan fluor, de primary antibody bindt aan het antigen
Secondary antibodies binden aan de primary antibody en niet direct aan het antigen
GFP
Groene fluorescerende kleur uit kwallen, van eiwit, handig om eiwit te lokaliseren
sepF bind aan GFP
phase contrast microscope (Zernike)
Werkt met twee lichtbundels met een onderling faseverschil, creëert interferentie, duidelijk beeld
zonder kleuring nodig. Diepte effect, kijken naar live cellen en organellen
