Identificatie van genen voor erfelijke
(monogene) ziekten
Expressie van het ziektefenotype is afhankelijk van enkele of meerdere genen
o Omgevingsomstandigheden kennen wisselende invloed
Verschillend afhankelijk van soort ziekte, populaties en veranderende
omgevingsomstandigheden
Koppelingsanalyse
Genen identificeren in monogene aandoeningen
Eerste stap om ziektegen te identificeren is de koppelingsanalyse
o Levert echter enkel chromosomale regio op
→ verdere procedures nodig om in gekoppelde regio betrokken gen te identificeren
Positionele klonering uitgevoerd
o Twee loci die samen worden overgeërfd zijn gekoppeld
Door crossing over tijdens de meiose worden twee loci op grote afstand van
elkaar op hetzelfde chromosoom niet altijd samen overgeërfd
→ recombinatie zorgt voor een herschikking van allelen van loci op hetzelfde
chromosoom en dubbele recombinatie maakt het mogelijk dat loci toch
samen worden overgeërfd
recombinatie is minder waarschijnlijk indien twee loci dicht bij elkaar
gelegen zijn
Recombinatiefrequentie Ө kan berekend worden
o Berekend op basis van stambomen en merkers
aantal recombinanten
o
aantal recombinanten+aantal niet−recombinanten
Indien 0,5 zien we niet-gekoppelde loci
Twee loci op een grotere afstand gaan meer recombineren dan twee
loci dicht bij elkaar → Ө werkt als maat voor de genetische afstand
,
(monogene) ziekten
Expressie van het ziektefenotype is afhankelijk van enkele of meerdere genen
o Omgevingsomstandigheden kennen wisselende invloed
Verschillend afhankelijk van soort ziekte, populaties en veranderende
omgevingsomstandigheden
Koppelingsanalyse
Genen identificeren in monogene aandoeningen
Eerste stap om ziektegen te identificeren is de koppelingsanalyse
o Levert echter enkel chromosomale regio op
→ verdere procedures nodig om in gekoppelde regio betrokken gen te identificeren
Positionele klonering uitgevoerd
o Twee loci die samen worden overgeërfd zijn gekoppeld
Door crossing over tijdens de meiose worden twee loci op grote afstand van
elkaar op hetzelfde chromosoom niet altijd samen overgeërfd
→ recombinatie zorgt voor een herschikking van allelen van loci op hetzelfde
chromosoom en dubbele recombinatie maakt het mogelijk dat loci toch
samen worden overgeërfd
recombinatie is minder waarschijnlijk indien twee loci dicht bij elkaar
gelegen zijn
Recombinatiefrequentie Ө kan berekend worden
o Berekend op basis van stambomen en merkers
aantal recombinanten
o
aantal recombinanten+aantal niet−recombinanten
Indien 0,5 zien we niet-gekoppelde loci
Twee loci op een grotere afstand gaan meer recombineren dan twee
loci dicht bij elkaar → Ө werkt als maat voor de genetische afstand
,
