Samenvatting moleculaire biologie h5: translatie
Verschillende types RNA = mRNA, tRNA en rRNA
Code uit vier basen → 3 Letter Code (= CODON) codeert voor 20 Verschillende
Aminozuren
UGU = Cysteine
UGG = Trypsine
UGA = STOP Codon
GGU = Glycine
GCU = Alanine
GUU = Valine
Genetische Code
Triplet
Geen leestekens en spaties
Gedegenereerd = Verschillende codons coderen voor hetzelfde AZ en het
is niet omkeerbaar
Codons volgen elkaar op in een leesraam
Open leesraam (ORF) = specifiek soort leesraam dat kan coderen voor
een eiwit. Het begint met een STARTCodon en eindigt met een STOPcodon
START Codon = AUG (codeert voor Methionine)
STOP Codons = UAA, UAG, UGA
Messenger RNA (mRNA) = Bevat het open leesraam
Prokaryoten = mRNA is lineair
Aan de 5’ uiteinde: Trifosfaat
Aan de 3’ uiteinde: 3’ OH
Er kunnen verschillende Open Leesramen naast elkaar aanwezig zijn
Polycistronisch = kan 1 mRNA verschillende open leesramen na elkaar
bevatten.
Eukaryoten = Na transcriptie wordt mRNA gemodificeerd
Aan de 5’ uiteinde: CAP (Eerste modificatie)
Aan de 3’ uiteinde: PolyA-staart (Tweede modificatie)
Splicing = verwijderen van intronen (Derde modificatie)
Modificaties gebeuren door enzymen die aan de staart van RNA
polymerase hangen
, CAP MODIFICATIE (Enkel Eukaryoten)
Dit wordt uitgevoerd door een enzym dat ook zich bevindt tot de staart
van RNA polymerase
Als het 5’ uiteinde gevormd is door RNA polymerase → Zullen enzymen dit
uiteinde herkennen
Het enzym vindt een GTP
Het Alpha fosfaat uiteinde van GTP gaat binden met de Beta fosfaat
van het 5’ uiteinde
Er zal een methylering gebeuren op de GUANINE van GTP
Functie van CAP modificatie
1. Bescherming tegen RNAsen: RNAsen herkennen mRNA niet als RNA
2. Signaal dat dit mRNA is (dat een ORF aanwezig is en dat er translatie kan
gebeuren)
3. Signaal voor transport naar het cytoplasma (voor translatie met ribosomen)
POLYADENYLERING (POLY A STAART) = 200 - 250 A’s
Functie = (1) Bescherming tegen afbraak van Open Leesraam
(2) Signaal voor het translatie mechanisme
(3) Alle RNA met een Poly A - Staart moeten naar het cytoplasma worden
getransporteerd
Verschillende types RNA = mRNA, tRNA en rRNA
Code uit vier basen → 3 Letter Code (= CODON) codeert voor 20 Verschillende
Aminozuren
UGU = Cysteine
UGG = Trypsine
UGA = STOP Codon
GGU = Glycine
GCU = Alanine
GUU = Valine
Genetische Code
Triplet
Geen leestekens en spaties
Gedegenereerd = Verschillende codons coderen voor hetzelfde AZ en het
is niet omkeerbaar
Codons volgen elkaar op in een leesraam
Open leesraam (ORF) = specifiek soort leesraam dat kan coderen voor
een eiwit. Het begint met een STARTCodon en eindigt met een STOPcodon
START Codon = AUG (codeert voor Methionine)
STOP Codons = UAA, UAG, UGA
Messenger RNA (mRNA) = Bevat het open leesraam
Prokaryoten = mRNA is lineair
Aan de 5’ uiteinde: Trifosfaat
Aan de 3’ uiteinde: 3’ OH
Er kunnen verschillende Open Leesramen naast elkaar aanwezig zijn
Polycistronisch = kan 1 mRNA verschillende open leesramen na elkaar
bevatten.
Eukaryoten = Na transcriptie wordt mRNA gemodificeerd
Aan de 5’ uiteinde: CAP (Eerste modificatie)
Aan de 3’ uiteinde: PolyA-staart (Tweede modificatie)
Splicing = verwijderen van intronen (Derde modificatie)
Modificaties gebeuren door enzymen die aan de staart van RNA
polymerase hangen
, CAP MODIFICATIE (Enkel Eukaryoten)
Dit wordt uitgevoerd door een enzym dat ook zich bevindt tot de staart
van RNA polymerase
Als het 5’ uiteinde gevormd is door RNA polymerase → Zullen enzymen dit
uiteinde herkennen
Het enzym vindt een GTP
Het Alpha fosfaat uiteinde van GTP gaat binden met de Beta fosfaat
van het 5’ uiteinde
Er zal een methylering gebeuren op de GUANINE van GTP
Functie van CAP modificatie
1. Bescherming tegen RNAsen: RNAsen herkennen mRNA niet als RNA
2. Signaal dat dit mRNA is (dat een ORF aanwezig is en dat er translatie kan
gebeuren)
3. Signaal voor transport naar het cytoplasma (voor translatie met ribosomen)
POLYADENYLERING (POLY A STAART) = 200 - 250 A’s
Functie = (1) Bescherming tegen afbraak van Open Leesraam
(2) Signaal voor het translatie mechanisme
(3) Alle RNA met een Poly A - Staart moeten naar het cytoplasma worden
getransporteerd
