DEEL III: MICROBIOME-
BASED ANTIMICROBIAL
THERAPIES
,MICROBIOOM IN DE DARMEN
MICROBIOOM
Een gezonde microbioom wordt gekarakteriseerd door verschillende soorten micro-organisme, ze
zijn in ongeveer gelijke hoeveelheden aanwezig
Bij blootstelling aan AB:
o minder soorten micro-organisme (verminderde diversiteit)
= rijkheid en gelijkheid zullen sterk gaan dalen
Þ we missen micro-organismen die bijdragen aan onze gezondheid
o Als het microbioom in onevenwicht is:
Þ kan men ziekte gaan ontwikkelen
Þ er zal 1 dominante microbiële soort gaan terugvinden
= heel veel van dezelfde pathogenen en minder andere micro-organismen
AANWEZIGE MICRO-ORGANISMEN THV GI-STELSEL
• Maag:
o De pH in de maag (1-2) voorkomt de groei van de meeste micro-organismen
o Er is een lage dichtheid aan microben, minder dan 1000 cellen/mL
o Veel orale soorten micro-organismen kunnen de maag bereiken, maar worden daar
meestal afgedood.
o Helicobacter pylori komt vaak voor:
Eigenschappen:
§ Deze bacterie kan overleven in de zure omgeving van de maag.
§ Het bevindt zich in de slijmvlieslaag (mucus) van de maag.
Mechanisme:
§ Produceert het enzym urease.
§ Urease zet ureum om in ammoniak en CO2, waardoor de pH lokaal wordt
verhoogd
® Dit stelt H. pylori in staat om te overleven ondanks de zure omstandigheden
o Andere micro-organismen die kunnen overleven bij een lage pH:
§ Lactobacillus spp.
§ Streptococcus spp.
2
, • Dunne darm:
o Relatieve korte residentie tijd, ongeveer 255 minuten
o Microbiële populatie in de dunne darm:
Þ Omdat de darminhoud snel afgevoerd wordt kunnen hier niet super veel micro-
organismen blijven
Þ Hoe verder in het GI-systeem, hoe groter het aantal micro-organismen
Þ Van het duodenum tot het terminale ileum neemt de dichtheid van micro-
organismen toe: 104 tot 108 cellen/mL
Þ Het aandeel facultatieve anaeroben neemt af richting het terminale ileum
ð komt omdat we meer anaerobe omstandigheden gaan hebben
o Oxygenatie van micro-organismen:
Þ Naarmate je dieper in de dunne darm komt, neemt de hoeveelheid zuurstof af:
ð gunstig voor strikt anaerobe micro-organismen
• Colon en faeces
o Lange transit tijd (35h)
§ Inhoud blijft langer
§ micro-organismen hebben tijd om te gaan groeien
o Hoge dichtheid van micro-organismen (1011 – 1012 microbial cells/mL)
§ Door reabsorptie zal de inhoud zich concentreren ➱ hoge aantallen bacterien
§ Stoelgang wordt vaster, want water wordt onttrokken in de dikke darm
§ Colon bevat meer bacterien dan de dunne darm
§ Studies gebeuren in faecale materiaal, want dit is een weerspiegeling vd dikke
darm
o Elke person heeft minstens 160 verschillende species (>1000 species in de populatie)
§ Aantal diverse soorten is veel hoger in de colon dan in de maag
§ heel veel diversiteit
ROL VAN HET MICROBIOOM IN MENSELIJKE FYSIOLOGIE
Hoe beschermt het microbioom ons tegen infectieziektes:
1) Kolonisatie resistentie: beschermen tegen pathogene MO
a. Door compititie voor nutrienten en bindingsplaatsen ad gastheer waardoor de
pathogeen niet kan groeien en zo ons niet ziek kan maken
b. Er kunnen ook metabolieten geproduceerd worden door het microbioom
2) Trainen van het immuunsysteem om te reageren op pathogene MO
3) Microbioom kan bepaalde enzymen ter beschikking stellen die de gastheer zelf niet kan
produceren
Þ hierdoor kan ons lichaam een aantal metabole processen uitvoeren die het
anders niet zou kunnen doen
Þ omzetten van vezels en substraten die anders niet verteerd zouden worden
3
BASED ANTIMICROBIAL
THERAPIES
,MICROBIOOM IN DE DARMEN
MICROBIOOM
Een gezonde microbioom wordt gekarakteriseerd door verschillende soorten micro-organisme, ze
zijn in ongeveer gelijke hoeveelheden aanwezig
Bij blootstelling aan AB:
o minder soorten micro-organisme (verminderde diversiteit)
= rijkheid en gelijkheid zullen sterk gaan dalen
Þ we missen micro-organismen die bijdragen aan onze gezondheid
o Als het microbioom in onevenwicht is:
Þ kan men ziekte gaan ontwikkelen
Þ er zal 1 dominante microbiële soort gaan terugvinden
= heel veel van dezelfde pathogenen en minder andere micro-organismen
AANWEZIGE MICRO-ORGANISMEN THV GI-STELSEL
• Maag:
o De pH in de maag (1-2) voorkomt de groei van de meeste micro-organismen
o Er is een lage dichtheid aan microben, minder dan 1000 cellen/mL
o Veel orale soorten micro-organismen kunnen de maag bereiken, maar worden daar
meestal afgedood.
o Helicobacter pylori komt vaak voor:
Eigenschappen:
§ Deze bacterie kan overleven in de zure omgeving van de maag.
§ Het bevindt zich in de slijmvlieslaag (mucus) van de maag.
Mechanisme:
§ Produceert het enzym urease.
§ Urease zet ureum om in ammoniak en CO2, waardoor de pH lokaal wordt
verhoogd
® Dit stelt H. pylori in staat om te overleven ondanks de zure omstandigheden
o Andere micro-organismen die kunnen overleven bij een lage pH:
§ Lactobacillus spp.
§ Streptococcus spp.
2
, • Dunne darm:
o Relatieve korte residentie tijd, ongeveer 255 minuten
o Microbiële populatie in de dunne darm:
Þ Omdat de darminhoud snel afgevoerd wordt kunnen hier niet super veel micro-
organismen blijven
Þ Hoe verder in het GI-systeem, hoe groter het aantal micro-organismen
Þ Van het duodenum tot het terminale ileum neemt de dichtheid van micro-
organismen toe: 104 tot 108 cellen/mL
Þ Het aandeel facultatieve anaeroben neemt af richting het terminale ileum
ð komt omdat we meer anaerobe omstandigheden gaan hebben
o Oxygenatie van micro-organismen:
Þ Naarmate je dieper in de dunne darm komt, neemt de hoeveelheid zuurstof af:
ð gunstig voor strikt anaerobe micro-organismen
• Colon en faeces
o Lange transit tijd (35h)
§ Inhoud blijft langer
§ micro-organismen hebben tijd om te gaan groeien
o Hoge dichtheid van micro-organismen (1011 – 1012 microbial cells/mL)
§ Door reabsorptie zal de inhoud zich concentreren ➱ hoge aantallen bacterien
§ Stoelgang wordt vaster, want water wordt onttrokken in de dikke darm
§ Colon bevat meer bacterien dan de dunne darm
§ Studies gebeuren in faecale materiaal, want dit is een weerspiegeling vd dikke
darm
o Elke person heeft minstens 160 verschillende species (>1000 species in de populatie)
§ Aantal diverse soorten is veel hoger in de colon dan in de maag
§ heel veel diversiteit
ROL VAN HET MICROBIOOM IN MENSELIJKE FYSIOLOGIE
Hoe beschermt het microbioom ons tegen infectieziektes:
1) Kolonisatie resistentie: beschermen tegen pathogene MO
a. Door compititie voor nutrienten en bindingsplaatsen ad gastheer waardoor de
pathogeen niet kan groeien en zo ons niet ziek kan maken
b. Er kunnen ook metabolieten geproduceerd worden door het microbioom
2) Trainen van het immuunsysteem om te reageren op pathogene MO
3) Microbioom kan bepaalde enzymen ter beschikking stellen die de gastheer zelf niet kan
produceren
Þ hierdoor kan ons lichaam een aantal metabole processen uitvoeren die het
anders niet zou kunnen doen
Þ omzetten van vezels en substraten die anders niet verteerd zouden worden
3
