2de Bach. BMW Metabolisme
Door Zeno De Paus
,Zeno De Paus Metabolisme 2de Bach. BMW
Inhoud
Hoofdstuk 1: Glycolyse en gluconeogenese....................................................................................................... 4
Inleiding ............................................................................................................................................................................4
Opname van glucose in de cel via transporters ................................................................................................5
Passieve opname van glucose..............................................................................................................................5
Actieve opname van glucose ................................................................................................................................6
De glycolyse .....................................................................................................................................................................6
Dissachariden als bron van koolhydraten ................................................................................................... 11
Metabole ziekte rondom de glycolyse ........................................................................................................... 12
Regulatie van de glycolytische weg ................................................................................................................ 13
De gluconeogenese .................................................................................................................................................... 14
Regulatie van de gluconeogenese ................................................................................................................... 17
Oplossing examenvraag ........................................................................................................................................... 20
Hoofdstuk 2: De citroenzuurcyclus .................................................................................................................... 21
Inleiding ......................................................................................................................................................................... 21
De omzetting van pyruvaat naar acetyl-CoA ................................................................................................... 21
De reacties van de citroenzuur cyclus ............................................................................................................... 22
Regulatie van de citroenzuur cyclus ................................................................................................................... 24
Het amfibool karakter van de citroenzuurcyclus .......................................................................................... 25
Metabole aandoeningen .......................................................................................................................................... 26
Oplossing examenvraag ........................................................................................................................................... 26
Hoofdstuk 3: De oxidatieve fosforylatie ........................................................................................................... 27
Inleiding ......................................................................................................................................................................... 27
Vrije energie opbrengst van elektronentransport ........................................................................................ 27
De elektronentransportketen................................................................................................................................ 29
De protonengradiënt drijft de synthese van ATP .......................................................................................... 31
Transport doorheen mitochondriale membranen ....................................................................................... 33
Totale ATP opbrengst uit glucose ........................................................................................................................ 33
De regulatie van de cellulaire respiratie ........................................................................................................... 34
Oplossing examenvraag ........................................................................................................................................... 35
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,Zeno De Paus Metabolisme 2de Bach. BMW
Hoofdstuk 4: Pentosefosfaat weg ....................................................................................................................... 35
Inleiding ......................................................................................................................................................................... 35
Reacties van de pentosefosfaat weg ................................................................................................................... 36
Het lot van glucose-6-fosfaat (G6P) .................................................................................................................... 37
De rol van de pentosefosfaat pathway in de bescherming tegen oxidatieve stress ........................ 39
Oplossing examenvraag ........................................................................................................................................... 39
Hoofdstuk 5: Het glycogeen metabolisme ....................................................................................................... 40
Inleiding ......................................................................................................................................................................... 40
De afbraak van glycogeen........................................................................................................................................ 41
Regulatie van de glycogeen afbraak .................................................................................................................... 42
De synthese van glycogeen ..................................................................................................................................... 43
Regulatie en reciproke regulatie van de glycogeen synthese ................................................................... 44
Regulatie van de glycogeen synthese ............................................................................................................ 44
Reciproke regulatie van de glycogeen afbraak en synthese ................................................................. 45
Metabole aandoeningen .......................................................................................................................................... 46
Oplossing examenvraag ........................................................................................................................................... 46
Hoofdstuk 6: De globine familie .......................................................................................................................... 47
Inleiding ......................................................................................................................................................................... 47
Hemoglobine en myoglobine ................................................................................................................................. 47
De myoglobine-𝑂2 binding ................................................................................................................................ 48
De hemoglobine-𝑂2 binding ............................................................................................................................. 49
Allosterische effectoren van hemoglobine....................................................................................................... 51
Ziekten veroorzaakt door mutaties in hemoglobine ................................................................................... 52
Oplossing examenvraag ........................................................................................................................................... 53
Hoofdstuk 7: Vetten ................................................................................................................................................ 54
Herhaling ....................................................................................................................................................................... 54
Triglyceriden zijn hoog geconcentreerde energiebronnen ....................................................................... 55
Transport van vetten in ons lichaam .................................................................................................................. 55
Vetzuurafbraak (= katabolisme) ......................................................................................................................... 59
Vetzuursynthese (= anabolisme) ........................................................................................................................ 62
Regulatie van het vetzuurmetabolisme............................................................................................................. 63
De synthese van cholesterol en zijn derivaten ............................................................................................... 64
Eicosanoïde hormonen ............................................................................................................................................ 65
Fosfolipiden .................................................................................................................................................................. 66
2
, Zeno De Paus Metabolisme 2de Bach. BMW
Hoofdstuk 8: Eiwitten en aminozuren .............................................................................................................. 67
Extracellulaire afbraak van eiwitten tot aminozuren .................................................................................. 67
Intracellulaire afbraak van eiwitten tot aminozuren................................................................................... 68
Aminozuur afbraak: verwijdering van N-atoom............................................................................................ 69
Uitscheiding van 𝑁𝐻4 + via de ureumcyclus............................................................................................. 71
Aminozuur afbraak: katabolisme van het koolstof skelet ......................................................................... 72
Afwijkingen in het aminozuur katabolisme .................................................................................................... 73
Afgeleiden van tyrosine: catecholamines ......................................................................................................... 74
Aminozuren als bron voor de ‘one-C-pool’ ...................................................................................................... 75
𝑁2-fixatie ....................................................................................................................................................................... 76
Aminozuur anabolisme ............................................................................................................................................ 77
Regulatie aminozuur synthese.............................................................................................................................. 79
Aminozuren als precursoren van vele biomoleculen .................................................................................. 79
Hoofdstuk 9: Nucleotiden ..................................................................................................................................... 80
Herhaling ....................................................................................................................................................................... 80
De purine nucleotide synthese (volledig te kunnen tekenen) ................................................................. 81
De novo purine nucleotide synthese ............................................................................................................. 81
Salvage pathway ..................................................................................................................................................... 83
De pyrimidine nucleotide synthese (volledig te kunnen tekenen)........................................................ 84
De novo pyrimidine nucleotide synthese .................................................................................................... 84
Salvage pathway van pyrimidine nucleotide synthese .......................................................................... 85
Deoxyribonucleotiden synthese........................................................................................................................... 85
Hoofdstuk 10: Geïntegreerd metabolisme ...................................................................................................... 86
Orgaan specificiteit .................................................................................................................................................... 86
Metabole homeostase en adaptatie .................................................................................................................... 89
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Inhoud
Hoofdstuk 1: Glycolyse en gluconeogenese....................................................................................................... 4
Inleiding ............................................................................................................................................................................4
Opname van glucose in de cel via transporters ................................................................................................5
Passieve opname van glucose..............................................................................................................................5
Actieve opname van glucose ................................................................................................................................6
De glycolyse .....................................................................................................................................................................6
Dissachariden als bron van koolhydraten ................................................................................................... 11
Metabole ziekte rondom de glycolyse ........................................................................................................... 12
Regulatie van de glycolytische weg ................................................................................................................ 13
De gluconeogenese .................................................................................................................................................... 14
Regulatie van de gluconeogenese ................................................................................................................... 17
Oplossing examenvraag ........................................................................................................................................... 20
Hoofdstuk 2: De citroenzuurcyclus .................................................................................................................... 21
Inleiding ......................................................................................................................................................................... 21
De omzetting van pyruvaat naar acetyl-CoA ................................................................................................... 21
De reacties van de citroenzuur cyclus ............................................................................................................... 22
Regulatie van de citroenzuur cyclus ................................................................................................................... 24
Het amfibool karakter van de citroenzuurcyclus .......................................................................................... 25
Metabole aandoeningen .......................................................................................................................................... 26
Oplossing examenvraag ........................................................................................................................................... 26
Hoofdstuk 3: De oxidatieve fosforylatie ........................................................................................................... 27
Inleiding ......................................................................................................................................................................... 27
Vrije energie opbrengst van elektronentransport ........................................................................................ 27
De elektronentransportketen................................................................................................................................ 29
De protonengradiënt drijft de synthese van ATP .......................................................................................... 31
Transport doorheen mitochondriale membranen ....................................................................................... 33
Totale ATP opbrengst uit glucose ........................................................................................................................ 33
De regulatie van de cellulaire respiratie ........................................................................................................... 34
Oplossing examenvraag ........................................................................................................................................... 35
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Hoofdstuk 4: Pentosefosfaat weg ....................................................................................................................... 35
Inleiding ......................................................................................................................................................................... 35
Reacties van de pentosefosfaat weg ................................................................................................................... 36
Het lot van glucose-6-fosfaat (G6P) .................................................................................................................... 37
De rol van de pentosefosfaat pathway in de bescherming tegen oxidatieve stress ........................ 39
Oplossing examenvraag ........................................................................................................................................... 39
Hoofdstuk 5: Het glycogeen metabolisme ....................................................................................................... 40
Inleiding ......................................................................................................................................................................... 40
De afbraak van glycogeen........................................................................................................................................ 41
Regulatie van de glycogeen afbraak .................................................................................................................... 42
De synthese van glycogeen ..................................................................................................................................... 43
Regulatie en reciproke regulatie van de glycogeen synthese ................................................................... 44
Regulatie van de glycogeen synthese ............................................................................................................ 44
Reciproke regulatie van de glycogeen afbraak en synthese ................................................................. 45
Metabole aandoeningen .......................................................................................................................................... 46
Oplossing examenvraag ........................................................................................................................................... 46
Hoofdstuk 6: De globine familie .......................................................................................................................... 47
Inleiding ......................................................................................................................................................................... 47
Hemoglobine en myoglobine ................................................................................................................................. 47
De myoglobine-𝑂2 binding ................................................................................................................................ 48
De hemoglobine-𝑂2 binding ............................................................................................................................. 49
Allosterische effectoren van hemoglobine....................................................................................................... 51
Ziekten veroorzaakt door mutaties in hemoglobine ................................................................................... 52
Oplossing examenvraag ........................................................................................................................................... 53
Hoofdstuk 7: Vetten ................................................................................................................................................ 54
Herhaling ....................................................................................................................................................................... 54
Triglyceriden zijn hoog geconcentreerde energiebronnen ....................................................................... 55
Transport van vetten in ons lichaam .................................................................................................................. 55
Vetzuurafbraak (= katabolisme) ......................................................................................................................... 59
Vetzuursynthese (= anabolisme) ........................................................................................................................ 62
Regulatie van het vetzuurmetabolisme............................................................................................................. 63
De synthese van cholesterol en zijn derivaten ............................................................................................... 64
Eicosanoïde hormonen ............................................................................................................................................ 65
Fosfolipiden .................................................................................................................................................................. 66
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Hoofdstuk 8: Eiwitten en aminozuren .............................................................................................................. 67
Extracellulaire afbraak van eiwitten tot aminozuren .................................................................................. 67
Intracellulaire afbraak van eiwitten tot aminozuren................................................................................... 68
Aminozuur afbraak: verwijdering van N-atoom............................................................................................ 69
Uitscheiding van 𝑁𝐻4 + via de ureumcyclus............................................................................................. 71
Aminozuur afbraak: katabolisme van het koolstof skelet ......................................................................... 72
Afwijkingen in het aminozuur katabolisme .................................................................................................... 73
Afgeleiden van tyrosine: catecholamines ......................................................................................................... 74
Aminozuren als bron voor de ‘one-C-pool’ ...................................................................................................... 75
𝑁2-fixatie ....................................................................................................................................................................... 76
Aminozuur anabolisme ............................................................................................................................................ 77
Regulatie aminozuur synthese.............................................................................................................................. 79
Aminozuren als precursoren van vele biomoleculen .................................................................................. 79
Hoofdstuk 9: Nucleotiden ..................................................................................................................................... 80
Herhaling ....................................................................................................................................................................... 80
De purine nucleotide synthese (volledig te kunnen tekenen) ................................................................. 81
De novo purine nucleotide synthese ............................................................................................................. 81
Salvage pathway ..................................................................................................................................................... 83
De pyrimidine nucleotide synthese (volledig te kunnen tekenen)........................................................ 84
De novo pyrimidine nucleotide synthese .................................................................................................... 84
Salvage pathway van pyrimidine nucleotide synthese .......................................................................... 85
Deoxyribonucleotiden synthese........................................................................................................................... 85
Hoofdstuk 10: Geïntegreerd metabolisme ...................................................................................................... 86
Orgaan specificiteit .................................................................................................................................................... 86
Metabole homeostase en adaptatie .................................................................................................................... 89
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