Samenvatting moleculaire biologie
geschreven door
2017
www.stuvia.nl
Gedownload door: mjpvkampen |
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.
, Stuvia - Koop en Verkoop de Beste Samenvattingen
Samenvatting moleculaire
biologie
Biomedische wetenschappen
2017-2018
Gedownload door: mjpvkampen |
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.
, Stuvia - Koop en Verkoop de Beste Samenvattingen
HOOFDSTUK 0: ZELFSTUDIE
1. DNA replicatie
1.1. Inleiding
DNA replicatie = identieke kopieën maken van het DNA, dit is nodig wanneer de cel gaat
delen
Volgens AT/GC regel
→ A bindt met T (dubbele binding)
→ C bindt met G (driedubbele binding)
DNA regelt zijn eigen duplicatie
Nucleotide = suiker + fosfaatgroep + base
1.2. Proces + betrokken eiwitten
① Ini a e
Replicon = replicatie-eenheid
Replicatieoorsprong = origin of replication = plek
waar DNA synthese wordt gestart
Initatior ontwindt DNA streng aan de origin of
replication
② Lokale ontwinding
DNA helicase ontwindt DNA streng verder van 5' naar 3'
→ Breekt H-bruggen tussen basen dankzij ATP-hydrolyse
→ Vorming van een replicatievork (= vorm die de
opengeknipte DNA streng krijgt)
Topoisomerasen = DNA gyrasen maken kleine breuken in de
dubbele helix om supercoiling te voorkomen
→ Enkelstrengig DNA bindende eiwitten = single strand
binding proteins hechten zich vast op ontwonden
strengen om te voorkomen dat ze terug samenklitten
③ RNA priming
DNA polymerase kan enkel nucleotiden koppelen aan bestaande
nucleotideketens
→ RNA primers worden toegevoegd door DNA primase
→ Primer is complementair aan DNA
Primers in de leading strand (= 5' naar 3')
→ 1 primer aangemaakt
Primers in de lagging strand (= 3' naar 5')
→ Meerdere primers aangemaakt
④ Elonga e
Dankzij DNA polymerase
→ Alleen van 5' naar 3' op de nieuwe streng
→ Deoxynucleoside trifosfaten (= vrije nucleotiden met 3
fosfaatgroepen op) binden met de template strand
→ DNA polymerase breekt de binding tussen de 1e en 2e
fosfaatgroep (geeft energie vrij)
o Nucleotide met 1 fosfaatgroep wordt aangehecht aan de template strand
met een phosphoester bond
Leading strand:
→ 1 lange leading strand gevormd
2
Gedownload door: mjpvkampen |
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.
, Stuvia - Koop en Verkoop de Beste Samenvattingen
Lagging strand:
→ Meerdere okasaki fragmenten gevormd
→ Groeit tot het de RNA primer van een ander fragment tegenkomt
Bidirectionele replicatie = DNA replicatie gebeurt in beide richtingen
⑤ Liga e
Exonuclease (= DNA polymerase 1) verwijdert RNA
primer
DNA polymerase 1 vult de lege plekjes met DNA MAAR
er ontbreekt altijd 1 covalente binding
Ligase plakt deze DNA fragmenten aan elkaar
1.3. DNA replicatie bij prokaryoten
DNA primase maakt RNA primers
DNA polymerase III hangt de nucleotiden aan de primers
→ In de lagging strand verwijdert DNA polymerase III meteen de primers en vervangt
deze door DNA
DNA ligase lijmt de stukken DNA aan elkaar
1.4. DNA replicatie is zeer stabiel: (3) oorzaken
1. H-bruggen tussen A&T en C&G zijn het stabielst
→ Indien bv. A&C per ongeluk binden, zal dit complex zichzelf afbreken omdat het zo
instabiel is
2. DNA polymerase gaat geen bindingen vormen indien er een verkeerd basenpaar is (vb. A&C)
3. Proofreading
→ DNA polymerase herkent fout gematchte nucleotiden en verwijdert deze dan ook
→ Gaat dan even in de 3' tot 5' richting, en keert dan weer om wanneer de basenparen
verwijderd zijn
1.5. Soorten DNA polymerasen
Evolutie: mutaties hebben gezorgd voor verschillende DNA polymerasen
Prokaryoten hebben minder soorten DNA polymerasen dan eukaryoten
Prokaryoten Eukaryoten
Soort Functie Soort Functie
I Verwijdert RNA primers α Maakt RNA primers
Vult gaten op Maakt korte DNA strengen
Herstelt DNA
III DNA replicatie ε, δ DNA replicatie (snel)
II, IV, V Herstelt DNA schade ϒ DNA replicatie bij
Repliceert DNA over DNA mitochondriën
schade
η,κ,ι,ζ Repliceert DNA over DNA
schade
α, β, δ, ε, Herstelt DNA
σ, λ, μ, φ,
θ
2. Transcriptie = RNA synthese
2.1. Eiwitsynthese bij eukaryoten algemeen
DNA wordt afgelezen en er wordt een eiwit van gemaakt via het maken van een RNA streng
Transcriptie = pre-mRNA synthese uit een DNA streng
→ DNA moleculen veranderen hierbij niet
3
Gedownload door: mjpvkampen |
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.
geschreven door
2017
www.stuvia.nl
Gedownload door: mjpvkampen |
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.
, Stuvia - Koop en Verkoop de Beste Samenvattingen
Samenvatting moleculaire
biologie
Biomedische wetenschappen
2017-2018
Gedownload door: mjpvkampen |
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.
, Stuvia - Koop en Verkoop de Beste Samenvattingen
HOOFDSTUK 0: ZELFSTUDIE
1. DNA replicatie
1.1. Inleiding
DNA replicatie = identieke kopieën maken van het DNA, dit is nodig wanneer de cel gaat
delen
Volgens AT/GC regel
→ A bindt met T (dubbele binding)
→ C bindt met G (driedubbele binding)
DNA regelt zijn eigen duplicatie
Nucleotide = suiker + fosfaatgroep + base
1.2. Proces + betrokken eiwitten
① Ini a e
Replicon = replicatie-eenheid
Replicatieoorsprong = origin of replication = plek
waar DNA synthese wordt gestart
Initatior ontwindt DNA streng aan de origin of
replication
② Lokale ontwinding
DNA helicase ontwindt DNA streng verder van 5' naar 3'
→ Breekt H-bruggen tussen basen dankzij ATP-hydrolyse
→ Vorming van een replicatievork (= vorm die de
opengeknipte DNA streng krijgt)
Topoisomerasen = DNA gyrasen maken kleine breuken in de
dubbele helix om supercoiling te voorkomen
→ Enkelstrengig DNA bindende eiwitten = single strand
binding proteins hechten zich vast op ontwonden
strengen om te voorkomen dat ze terug samenklitten
③ RNA priming
DNA polymerase kan enkel nucleotiden koppelen aan bestaande
nucleotideketens
→ RNA primers worden toegevoegd door DNA primase
→ Primer is complementair aan DNA
Primers in de leading strand (= 5' naar 3')
→ 1 primer aangemaakt
Primers in de lagging strand (= 3' naar 5')
→ Meerdere primers aangemaakt
④ Elonga e
Dankzij DNA polymerase
→ Alleen van 5' naar 3' op de nieuwe streng
→ Deoxynucleoside trifosfaten (= vrije nucleotiden met 3
fosfaatgroepen op) binden met de template strand
→ DNA polymerase breekt de binding tussen de 1e en 2e
fosfaatgroep (geeft energie vrij)
o Nucleotide met 1 fosfaatgroep wordt aangehecht aan de template strand
met een phosphoester bond
Leading strand:
→ 1 lange leading strand gevormd
2
Gedownload door: mjpvkampen |
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.
, Stuvia - Koop en Verkoop de Beste Samenvattingen
Lagging strand:
→ Meerdere okasaki fragmenten gevormd
→ Groeit tot het de RNA primer van een ander fragment tegenkomt
Bidirectionele replicatie = DNA replicatie gebeurt in beide richtingen
⑤ Liga e
Exonuclease (= DNA polymerase 1) verwijdert RNA
primer
DNA polymerase 1 vult de lege plekjes met DNA MAAR
er ontbreekt altijd 1 covalente binding
Ligase plakt deze DNA fragmenten aan elkaar
1.3. DNA replicatie bij prokaryoten
DNA primase maakt RNA primers
DNA polymerase III hangt de nucleotiden aan de primers
→ In de lagging strand verwijdert DNA polymerase III meteen de primers en vervangt
deze door DNA
DNA ligase lijmt de stukken DNA aan elkaar
1.4. DNA replicatie is zeer stabiel: (3) oorzaken
1. H-bruggen tussen A&T en C&G zijn het stabielst
→ Indien bv. A&C per ongeluk binden, zal dit complex zichzelf afbreken omdat het zo
instabiel is
2. DNA polymerase gaat geen bindingen vormen indien er een verkeerd basenpaar is (vb. A&C)
3. Proofreading
→ DNA polymerase herkent fout gematchte nucleotiden en verwijdert deze dan ook
→ Gaat dan even in de 3' tot 5' richting, en keert dan weer om wanneer de basenparen
verwijderd zijn
1.5. Soorten DNA polymerasen
Evolutie: mutaties hebben gezorgd voor verschillende DNA polymerasen
Prokaryoten hebben minder soorten DNA polymerasen dan eukaryoten
Prokaryoten Eukaryoten
Soort Functie Soort Functie
I Verwijdert RNA primers α Maakt RNA primers
Vult gaten op Maakt korte DNA strengen
Herstelt DNA
III DNA replicatie ε, δ DNA replicatie (snel)
II, IV, V Herstelt DNA schade ϒ DNA replicatie bij
Repliceert DNA over DNA mitochondriën
schade
η,κ,ι,ζ Repliceert DNA over DNA
schade
α, β, δ, ε, Herstelt DNA
σ, λ, μ, φ,
θ
2. Transcriptie = RNA synthese
2.1. Eiwitsynthese bij eukaryoten algemeen
DNA wordt afgelezen en er wordt een eiwit van gemaakt via het maken van een RNA streng
Transcriptie = pre-mRNA synthese uit een DNA streng
→ DNA moleculen veranderen hierbij niet
3
Gedownload door: mjpvkampen |
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.
