Oefenvragen: Moleculaire Biologie
Wat zijn alle processen van het centrale dogma en licht ze toe.
o Repilicatie->transcriptie->translatie
o Repilicatie: DNA wordt gerepliceerd
o Transcriptie: DNA matrijs wordt overgeschreven tot mRNA
o Translatie: mRNA wordt vertaald in eiwitsequenties
DNA, RNA en eiwitten?
o DNA: deoxyribonucleïnezuur, dubbel helix en draagt erfelijk materiaal
o RNA: messenger ribonucleïnezuur, enkelstrengig en kan proteïne
transcripteren mbv tRNA.
o tRNA: transscriptie ribonucleïnezur, leest mRNA af en kan de specifieke AZ
hier aan koppelen.
o Eiwiten: lange ketens van AZ’en, worden indirect door DNA aangemaakt.
Deoxynucleotiden, nucleotiden en aminozuren. Benoem alle onderdelen van deze
moleculen:
De omgekeerd complementaire streng aan deze streng noteren we als..
o 5’-ACTG-3’
, De structuur van DNA:
o Een dubbele helix structuur, waarbij de purine (A en G) gebonden wordt de
pyrimides (T en C) dmv waterstofbruggen. De binding gebeurt van een 5’
uiteinde tot een 3’ uiteinde, dus aan een 5’ base zal er een 3’ base binden.
Hoe is een nucleotide opgebouwd?
o Een suikermolecule en een fosfaat geroep gebonden aan een base. Aan de 5’
een fosfaat en aan de 3’ een suiker.
Wat zijn de twee belangrijke secundaire structure die voorkomen in het DNA?
o De alfa-helix en de beta-pleated-sheet.
o De alfa-helix, hierbij zijn de waterstofatomen van de amine-groep van de
peptide naar dezelfde kan gezicht en de carboxyl-groep naar de nadere kant.
Dit zorgt dat er H-O bindigen tussen verschillen peptides mogelijk zijn.
o De beta-pleated-sheet, hierbij zijn de waterstofatomen en de carboxyl-groep
in een AZ naar dezelfde kant gericht zijn, bij de eerst volgende AZ zijn de
waterstofatomen en de carboxyl-groep naar de andere kan gericht. Hier door
worden er H-O bindingen gevorm van niet naast elkaar gelegen AZ.
De rol van waterstofbruggen bij baseparing en bij de secundaire structuren in DNA?
o Er zal een waterstofbrug gevormd worden tussen de positief geladen H en de
negatief geladen N en O. Tussen G en C zijn het er drie en tussen A en T twee.
Het proces dat RNA omzet in cDNA noemen we..
o Retrotranscriptie
De 3 niveaus van een mutatie?
o Gekende genen voor de mutatie
o Niet zo vaak voorkomend, maar toch gekende genen voor de mutatie.
o Onbekende gen dat de mutatie veroorzaakt
Wat is deze molecule?
o Deoxynucleotide
Wat is de lettercodering van deze molecule?
o 5’GACU-3’
, De sequentie die met 5’-AACGCTGTAA-3’ overeenkomt is...
o 5’TTACAGCGTT-3’
Als DNA-polymerase één nucleotide toevoegt aan deze moleculen welke zal het zijn?
5’-TTCAGAACGCTGTAATAT-3’
3’-TTGCGACATT-5’
o C toevoegen
Wat is de primaire structuur van eiwitten?
o AZ-sequentie met zwavelbruggen
Wat is de secundaire structuur?
o De alfa-helix en de beta-sheet
Wat is de super secundaire structuur?
o Ruimtelijke confirmatie, waar er bundels van alfa-helices en vaten van beta-
sheets zijn.
Wat is de tertiaire structuur?
o Volledige ruimtelijke structuur van één polypeptideketen.
Wat is de quaternaire structuur?
o Volledig ruimtelijke structuur van één eiwit
Wat is de regel van Chargaff?
o In een willekeurig genoom van een organisme is het aantal guanine basis
gelijk aan het aantal cytosine basen en het aantal tyrosine base gelijk aan het
aantal adenine base.
Structuur RNA?
o Enkelstrengig, ribosenucleïnezuur. Dat in de secundaire structuur soms korte
dubbelstrengig wordt door vorming van baseparingen. In de tertiaire
structuur wordt de secundaire structuur omgezet in een ruimtelijke structuur.
RNA reverse transcriptase?
o RNA omzetten in cDNA, mRNA + poly-A staart. Waarbij er een poly-T primer
gebonden wordt, hierdoor kan reverse transcriptase de keten verlengen en
een DNA-koppie maken. Hierna wordt van die DNA een cDNA gemaakt door
DNA-polymerase.
Wat is de essentie van de proef van Griffith?
o Transformatie! Er worden genen overgedragen van een ruwe bacteriestam
naar een gladde bacteriestam waardoor de gladde bacteriestammen ruw
worden. Het overgedragen gen codeert voor het enzym dat een
polysachariden kapsel aanmaakt waardoor de bacterie ruw wordt.
Wat is de essentie van de proef van Avery?
o De proef van Chargaff het ontleden op zoek naar de moleculen dat
verantwoordelijk was voor de transformatie van gladder naar ruwe stammen.
Dit hebben ze gedaan door polysacharide, lipiden, eiwitten, RNA en DNA af te
breken door deze te behandelen met enzymen. Het extract dat behandeld
werd met DNA-degeneratie enzymen of DNA-ase was niet in staat om
stammen te transformeren dus hieruit concludeerde Avery dat DNA
verantwoordelijk was voor de transformatie.
Eigenschappen van het transformerende principe?
o Dus zelf de chemische eigenschappen en fysische eigenschappen.
o Vet of eiwit extracties en eiwit of RNA-degestrende enzymen hebben geen
effect op de transformerende capaciteit.
Wat zijn alle processen van het centrale dogma en licht ze toe.
o Repilicatie->transcriptie->translatie
o Repilicatie: DNA wordt gerepliceerd
o Transcriptie: DNA matrijs wordt overgeschreven tot mRNA
o Translatie: mRNA wordt vertaald in eiwitsequenties
DNA, RNA en eiwitten?
o DNA: deoxyribonucleïnezuur, dubbel helix en draagt erfelijk materiaal
o RNA: messenger ribonucleïnezuur, enkelstrengig en kan proteïne
transcripteren mbv tRNA.
o tRNA: transscriptie ribonucleïnezur, leest mRNA af en kan de specifieke AZ
hier aan koppelen.
o Eiwiten: lange ketens van AZ’en, worden indirect door DNA aangemaakt.
Deoxynucleotiden, nucleotiden en aminozuren. Benoem alle onderdelen van deze
moleculen:
De omgekeerd complementaire streng aan deze streng noteren we als..
o 5’-ACTG-3’
, De structuur van DNA:
o Een dubbele helix structuur, waarbij de purine (A en G) gebonden wordt de
pyrimides (T en C) dmv waterstofbruggen. De binding gebeurt van een 5’
uiteinde tot een 3’ uiteinde, dus aan een 5’ base zal er een 3’ base binden.
Hoe is een nucleotide opgebouwd?
o Een suikermolecule en een fosfaat geroep gebonden aan een base. Aan de 5’
een fosfaat en aan de 3’ een suiker.
Wat zijn de twee belangrijke secundaire structure die voorkomen in het DNA?
o De alfa-helix en de beta-pleated-sheet.
o De alfa-helix, hierbij zijn de waterstofatomen van de amine-groep van de
peptide naar dezelfde kan gezicht en de carboxyl-groep naar de nadere kant.
Dit zorgt dat er H-O bindigen tussen verschillen peptides mogelijk zijn.
o De beta-pleated-sheet, hierbij zijn de waterstofatomen en de carboxyl-groep
in een AZ naar dezelfde kant gericht zijn, bij de eerst volgende AZ zijn de
waterstofatomen en de carboxyl-groep naar de andere kan gericht. Hier door
worden er H-O bindingen gevorm van niet naast elkaar gelegen AZ.
De rol van waterstofbruggen bij baseparing en bij de secundaire structuren in DNA?
o Er zal een waterstofbrug gevormd worden tussen de positief geladen H en de
negatief geladen N en O. Tussen G en C zijn het er drie en tussen A en T twee.
Het proces dat RNA omzet in cDNA noemen we..
o Retrotranscriptie
De 3 niveaus van een mutatie?
o Gekende genen voor de mutatie
o Niet zo vaak voorkomend, maar toch gekende genen voor de mutatie.
o Onbekende gen dat de mutatie veroorzaakt
Wat is deze molecule?
o Deoxynucleotide
Wat is de lettercodering van deze molecule?
o 5’GACU-3’
, De sequentie die met 5’-AACGCTGTAA-3’ overeenkomt is...
o 5’TTACAGCGTT-3’
Als DNA-polymerase één nucleotide toevoegt aan deze moleculen welke zal het zijn?
5’-TTCAGAACGCTGTAATAT-3’
3’-TTGCGACATT-5’
o C toevoegen
Wat is de primaire structuur van eiwitten?
o AZ-sequentie met zwavelbruggen
Wat is de secundaire structuur?
o De alfa-helix en de beta-sheet
Wat is de super secundaire structuur?
o Ruimtelijke confirmatie, waar er bundels van alfa-helices en vaten van beta-
sheets zijn.
Wat is de tertiaire structuur?
o Volledige ruimtelijke structuur van één polypeptideketen.
Wat is de quaternaire structuur?
o Volledig ruimtelijke structuur van één eiwit
Wat is de regel van Chargaff?
o In een willekeurig genoom van een organisme is het aantal guanine basis
gelijk aan het aantal cytosine basen en het aantal tyrosine base gelijk aan het
aantal adenine base.
Structuur RNA?
o Enkelstrengig, ribosenucleïnezuur. Dat in de secundaire structuur soms korte
dubbelstrengig wordt door vorming van baseparingen. In de tertiaire
structuur wordt de secundaire structuur omgezet in een ruimtelijke structuur.
RNA reverse transcriptase?
o RNA omzetten in cDNA, mRNA + poly-A staart. Waarbij er een poly-T primer
gebonden wordt, hierdoor kan reverse transcriptase de keten verlengen en
een DNA-koppie maken. Hierna wordt van die DNA een cDNA gemaakt door
DNA-polymerase.
Wat is de essentie van de proef van Griffith?
o Transformatie! Er worden genen overgedragen van een ruwe bacteriestam
naar een gladde bacteriestam waardoor de gladde bacteriestammen ruw
worden. Het overgedragen gen codeert voor het enzym dat een
polysachariden kapsel aanmaakt waardoor de bacterie ruw wordt.
Wat is de essentie van de proef van Avery?
o De proef van Chargaff het ontleden op zoek naar de moleculen dat
verantwoordelijk was voor de transformatie van gladder naar ruwe stammen.
Dit hebben ze gedaan door polysacharide, lipiden, eiwitten, RNA en DNA af te
breken door deze te behandelen met enzymen. Het extract dat behandeld
werd met DNA-degeneratie enzymen of DNA-ase was niet in staat om
stammen te transformeren dus hieruit concludeerde Avery dat DNA
verantwoordelijk was voor de transformatie.
Eigenschappen van het transformerende principe?
o Dus zelf de chemische eigenschappen en fysische eigenschappen.
o Vet of eiwit extracties en eiwit of RNA-degestrende enzymen hebben geen
effect op de transformerende capaciteit.
