Samenvatting moleculaire biologie Angelika Kolodziejska 2Ba BMW
1 DNA, chromosomen en cellen
1.1 Structuren en functie van nucleïnezuren
Thymine (DNA) heeft een methylgroep en verschilt zo van Uracil (RNA)
Basenparen:
G&C 3 waterstofbruggen sterker
A&T 2 waterstofbruggen
Classical DNA-dependent DNA polymerase: standard DNA replicatie en/of reparative
RNA-dependent DNA polymerase: genoom evolutie en telomeer functie
1.2 Structuur en functie van chromosomen
Typisch eukaryoot chromosoom kan honderden miljoenen bp lang zijn
Chromosomen bestaan uit chromatine
o Dna-proteïne complex
o Chromosomen zijn dynamische structuren die alterneren tussen dichte en losse
opvouwing
3 niveau’s van opvouwing
o Rond histonen: 7 keer korter
o 30 nm fiber: 7 keer korter
o Chromatine lussen: variabel +- 7 keer
Heterochromatine: supercompact DNA, meer meer dan de 3 niveau’s. veelal genetisch
inactief (te compact)
Chromosoom functie:
Gespecialiseerde sequenties die nodig zijn:
Centromeren (kinetochoor bindt)
Origins of replications
Telomeren
o Gespecialiseerde structuren aan het einde
Zullen lus vormen DNA hybridiseert om zichzelf te beschermen (3’ kant)
o 6N repeats (GGGTTA)
o Nodig voor behoud van integriteit van chromosomen wanneer cel deelt worden
deze korter
Telomerase brengt telomeren weer op lengte
Werking telomerase:
Complementaire sequentie hecht aan en telomerase zal streng
verlengen
Kan maar aantal keer verlengen beschermingsmechanisme
Tumorcellen activeren telomerase waardoor ze eeuwig blijven delen
cel immortaliseren
Dmv southern blotting kan je zien hoeveel kb aan telomeren je nog hebt
Telomeren en cellulaire veroudering
Lichaamscellen hebben een vooraf bepaalde levensduur
Cellen delen een beperkt aantal keer
o Bv huidbiopt om fibroblasten te kweken:
Kind: cellen delen 80-tal keer
Volwassenen: cellen delen 10 tot 20 keer
Cellen die niet meer delen worden senescent genoemd
Progressieve verkorting van telomeren met celdelingen
1
, Samenvatting moleculaire biologie Angelika Kolodziejska 2Ba BMW
Telomerase is aanwezig:
o In kiemlijncellen
o In snel delende somatische cellen
Telomerase functie vermindert met de leeftijd
Verschillen in DNA copy number
Ploïdie: het aantal kopies van de basis chromosomen set
Meeste cellen bij de mens zijn diploïd (2C)
Sperma cellen en eicellen zijn haploïd (1C)
Sommige gespecialiseerde cellen zijn nulliploïd (0C): erythrocyten, bloedplaatjes, …
Sommige zijn polyploïd: 2 mechanismen
o Replicatie zonder celdeling
o Celfusie
Copy number verandert tijdens de celcyclus
1.3 DNA en chromosomen in celdeling en celcyclus
S G2 M G1 S
Vroege S-fase
Dubbele helix wordt bijeengehouden door cohesine
DNA = 2C, chromosomen = 2n
Late S-fase
Cohesine wordt verwijderd behalve in het centrum
Vorming zuster chromatiden
DNA = 4C, chromosomen = 2n
M-fase
Zuster chromatiden delen en geven 2 chromosomen die eerlijk verdeeld worden in 2
dochtercellen
Mitochondriën
E productie dmv oxidatieve fosforylatie
Hebben eigen DNA
Eigen transcriptie en translatie
Eigen genetische code
Mitochondrieel DNA van de mens (mt DNA)
Geen intronen
Geen recombinatie
Genen
o 2 rRNA
o 22 tRNA
o 13 ewitten de rest importeren zevanuit de cel
Mitochondrieel genetische code
Slechts 13 polypeptiden worden gevormd
Beperkte functionele belasting
Genetische code is verschillend van universele
o 4 codons verschillend
(in enosymbiont theorie: mit afkomstig van purper bac zo klein en zo weinig genen waarvoor ze
moeten coderen dat wanneer je iets verandert het niet direct verandering geeft)
Oneven replicatie van mitochondrieel DNA
Replicatie van mtDNA is niet gekoppeld aan celcyclus
Sommige mtDNA moleculen kunnen meer gerepliceerd worden dan andere
Mitochondriële mutaties kunnen in een bepaald percentage voorkomen
2
1 DNA, chromosomen en cellen
1.1 Structuren en functie van nucleïnezuren
Thymine (DNA) heeft een methylgroep en verschilt zo van Uracil (RNA)
Basenparen:
G&C 3 waterstofbruggen sterker
A&T 2 waterstofbruggen
Classical DNA-dependent DNA polymerase: standard DNA replicatie en/of reparative
RNA-dependent DNA polymerase: genoom evolutie en telomeer functie
1.2 Structuur en functie van chromosomen
Typisch eukaryoot chromosoom kan honderden miljoenen bp lang zijn
Chromosomen bestaan uit chromatine
o Dna-proteïne complex
o Chromosomen zijn dynamische structuren die alterneren tussen dichte en losse
opvouwing
3 niveau’s van opvouwing
o Rond histonen: 7 keer korter
o 30 nm fiber: 7 keer korter
o Chromatine lussen: variabel +- 7 keer
Heterochromatine: supercompact DNA, meer meer dan de 3 niveau’s. veelal genetisch
inactief (te compact)
Chromosoom functie:
Gespecialiseerde sequenties die nodig zijn:
Centromeren (kinetochoor bindt)
Origins of replications
Telomeren
o Gespecialiseerde structuren aan het einde
Zullen lus vormen DNA hybridiseert om zichzelf te beschermen (3’ kant)
o 6N repeats (GGGTTA)
o Nodig voor behoud van integriteit van chromosomen wanneer cel deelt worden
deze korter
Telomerase brengt telomeren weer op lengte
Werking telomerase:
Complementaire sequentie hecht aan en telomerase zal streng
verlengen
Kan maar aantal keer verlengen beschermingsmechanisme
Tumorcellen activeren telomerase waardoor ze eeuwig blijven delen
cel immortaliseren
Dmv southern blotting kan je zien hoeveel kb aan telomeren je nog hebt
Telomeren en cellulaire veroudering
Lichaamscellen hebben een vooraf bepaalde levensduur
Cellen delen een beperkt aantal keer
o Bv huidbiopt om fibroblasten te kweken:
Kind: cellen delen 80-tal keer
Volwassenen: cellen delen 10 tot 20 keer
Cellen die niet meer delen worden senescent genoemd
Progressieve verkorting van telomeren met celdelingen
1
, Samenvatting moleculaire biologie Angelika Kolodziejska 2Ba BMW
Telomerase is aanwezig:
o In kiemlijncellen
o In snel delende somatische cellen
Telomerase functie vermindert met de leeftijd
Verschillen in DNA copy number
Ploïdie: het aantal kopies van de basis chromosomen set
Meeste cellen bij de mens zijn diploïd (2C)
Sperma cellen en eicellen zijn haploïd (1C)
Sommige gespecialiseerde cellen zijn nulliploïd (0C): erythrocyten, bloedplaatjes, …
Sommige zijn polyploïd: 2 mechanismen
o Replicatie zonder celdeling
o Celfusie
Copy number verandert tijdens de celcyclus
1.3 DNA en chromosomen in celdeling en celcyclus
S G2 M G1 S
Vroege S-fase
Dubbele helix wordt bijeengehouden door cohesine
DNA = 2C, chromosomen = 2n
Late S-fase
Cohesine wordt verwijderd behalve in het centrum
Vorming zuster chromatiden
DNA = 4C, chromosomen = 2n
M-fase
Zuster chromatiden delen en geven 2 chromosomen die eerlijk verdeeld worden in 2
dochtercellen
Mitochondriën
E productie dmv oxidatieve fosforylatie
Hebben eigen DNA
Eigen transcriptie en translatie
Eigen genetische code
Mitochondrieel DNA van de mens (mt DNA)
Geen intronen
Geen recombinatie
Genen
o 2 rRNA
o 22 tRNA
o 13 ewitten de rest importeren zevanuit de cel
Mitochondrieel genetische code
Slechts 13 polypeptiden worden gevormd
Beperkte functionele belasting
Genetische code is verschillend van universele
o 4 codons verschillend
(in enosymbiont theorie: mit afkomstig van purper bac zo klein en zo weinig genen waarvoor ze
moeten coderen dat wanneer je iets verandert het niet direct verandering geeft)
Oneven replicatie van mitochondrieel DNA
Replicatie van mtDNA is niet gekoppeld aan celcyclus
Sommige mtDNA moleculen kunnen meer gerepliceerd worden dan andere
Mitochondriële mutaties kunnen in een bepaald percentage voorkomen
2