Aantekeningen tijdens hoorcolleges in het collegejaar 2021-2022.
I.1 The Transforming Principle
• DNA is de drager van erfelijke informatie
• Hier zijn geen andere moleculen voor nodig.
Dit principe wordt uitgelegd in de video wat op canvas is toegevoegd. Deze video gaat over de
geschiedenis van het DNA-onderzoek.
Verder is het belangrijk te weten dat het suikermolecuul in zowel DNA als RNA ribose is. Het enige
verschil is dat het suikermolecuul geen OH-groep heeft op de tweede (2') koolstofatoom in DNA,
vandaar de naam Deoxyribose Nucleic Acid.
I.2 Structure of DNA and RNA
I.2.1 Basen, Nucleosiden en Nucleotiden
Op het 1e koolstofatoom zit de stikstofbase (A,G,T of C) zoals aangegeven op afb. 1:
Afbeelding 1: structuurformule van een enkele nucleotide.
En op het 4e koolstofatoom zit de fosforgroep, aangegeven in oranje:
Afbeelding 2: Digitale 3-D weergave van structuurformule een enkele nucleotide, zonder stikstofbase.
Moleculen zonder fosfaatgroep noemt men een nucleoside. In afbeelding 3 is een voorbeeld van hoe
dit eruit ziet met een ribose molecuul:
, Afbeelding 3: weergave van structuurformule ribose zonder fosforgroep = nucleoside.
De organische stikstofbasen bevatten stikstof N. Ze zijn onder te verdelen in twee groepen - purines en
pyrimidines.
Purines hebben twee ringen en pyrimidines hebben een enkele ring.
Afbeelding 4: schematische weergave van de structuurformules van purines (links) en pyrimidines
(rechts). Bij elk molecuul staan twee namen: de bovenste benaming duidt op de nucleoside en de
onderste is de naam van de stikstofbase.
Deze basen kunnen worden gemodificeerd d.m.v. enzymatische reacties.
Lees verder op: https://canvas.vu.nl/courses/63393/pages/dot21-bases-nucleosides-and-nucleotides
I.2.3 RNA as a Macromolecule
1. Het ribosemolecuul in RNA zorgt voor een onregelmatige structuur vergeleken met DNA.
2. RNA bevat de stikstofbase Uracil, i.p.v. thymine in DNA. Het gevolg hiervan is nog beetje vaag
voor mn begrip…
DNA heeft een helixstructuur (duhh, we know) waarbij de twee strengen antiparallel
lopen - 3' en 5'. De primaire, en eigenlijk enige, functie van DNA is "the cellular
memory". RNA heeft daarentegen veel meer functies en hier is zeker nog niet alles over
bekend!
RNA bestaat in onze cellen voornamelijk als een 'single strand' van nucleotiden. MAAR onder
bepaalde omstandigheden in onze cellen, is RNA in staat op te vouwen tot een 3-D structuur = stem-
loop.
Net als in DNA, worden baseparen gevormd die antiparallel aan elkaar lopen (stem). Hier zijn
helixstructuren ook terug te vinden. However, in deze stem-loop structuren van RNA bestaan ook veel
van deze baseparen uit mismatches, met een destabilisatie van de RNA-structuur als gevolg. Op deze
plaatsen worden de loops gevormd.
I.3 Interactions between Nucleic Acids and Proteins
I.1 The Transforming Principle
• DNA is de drager van erfelijke informatie
• Hier zijn geen andere moleculen voor nodig.
Dit principe wordt uitgelegd in de video wat op canvas is toegevoegd. Deze video gaat over de
geschiedenis van het DNA-onderzoek.
Verder is het belangrijk te weten dat het suikermolecuul in zowel DNA als RNA ribose is. Het enige
verschil is dat het suikermolecuul geen OH-groep heeft op de tweede (2') koolstofatoom in DNA,
vandaar de naam Deoxyribose Nucleic Acid.
I.2 Structure of DNA and RNA
I.2.1 Basen, Nucleosiden en Nucleotiden
Op het 1e koolstofatoom zit de stikstofbase (A,G,T of C) zoals aangegeven op afb. 1:
Afbeelding 1: structuurformule van een enkele nucleotide.
En op het 4e koolstofatoom zit de fosforgroep, aangegeven in oranje:
Afbeelding 2: Digitale 3-D weergave van structuurformule een enkele nucleotide, zonder stikstofbase.
Moleculen zonder fosfaatgroep noemt men een nucleoside. In afbeelding 3 is een voorbeeld van hoe
dit eruit ziet met een ribose molecuul:
, Afbeelding 3: weergave van structuurformule ribose zonder fosforgroep = nucleoside.
De organische stikstofbasen bevatten stikstof N. Ze zijn onder te verdelen in twee groepen - purines en
pyrimidines.
Purines hebben twee ringen en pyrimidines hebben een enkele ring.
Afbeelding 4: schematische weergave van de structuurformules van purines (links) en pyrimidines
(rechts). Bij elk molecuul staan twee namen: de bovenste benaming duidt op de nucleoside en de
onderste is de naam van de stikstofbase.
Deze basen kunnen worden gemodificeerd d.m.v. enzymatische reacties.
Lees verder op: https://canvas.vu.nl/courses/63393/pages/dot21-bases-nucleosides-and-nucleotides
I.2.3 RNA as a Macromolecule
1. Het ribosemolecuul in RNA zorgt voor een onregelmatige structuur vergeleken met DNA.
2. RNA bevat de stikstofbase Uracil, i.p.v. thymine in DNA. Het gevolg hiervan is nog beetje vaag
voor mn begrip…
DNA heeft een helixstructuur (duhh, we know) waarbij de twee strengen antiparallel
lopen - 3' en 5'. De primaire, en eigenlijk enige, functie van DNA is "the cellular
memory". RNA heeft daarentegen veel meer functies en hier is zeker nog niet alles over
bekend!
RNA bestaat in onze cellen voornamelijk als een 'single strand' van nucleotiden. MAAR onder
bepaalde omstandigheden in onze cellen, is RNA in staat op te vouwen tot een 3-D structuur = stem-
loop.
Net als in DNA, worden baseparen gevormd die antiparallel aan elkaar lopen (stem). Hier zijn
helixstructuren ook terug te vinden. However, in deze stem-loop structuren van RNA bestaan ook veel
van deze baseparen uit mismatches, met een destabilisatie van de RNA-structuur als gevolg. Op deze
plaatsen worden de loops gevormd.
I.3 Interactions between Nucleic Acids and Proteins
