Moleculen samenvatting
Fysische chemie
Inhoudsopgave
Thema 1 elektrochemie en oxidatieve fosforylering.......................................................................................2
Hoorcollege 1 & 2.................................................................................................................................................2
Hoorcollege 3 & 4 Elektrochemie.........................................................................................................................4
Thema 2 thermodynamica............................................................................................................................. 7
Hoorcollege 5 & 6 biologische thermodynamica.................................................................................................7
Hoorcollege 7 & 8 Biologische thermodynamica...............................................................................................10
Hoorcollege 9 & 10 Biologische thermodynamica deel 3..................................................................................12
, Thema 1 elektrochemie en oxidatieve fosforylering
Hoorcollege 1 & 2
Redox
Energie/enthalpie - glucose kan je omzetten in ATP en warmte
Entropie – concentraties, gradienten, pH en (temperatuur).
Deze 3 komen samen in de Gibbs vrije energie.
De oxidatieve fosforylering
Redox reacties
Oxidator + e- reductor
Deze reactie heet reductie.
Reductor oxidator + e-
Deze reactie heet oxidatie.
De reductor en bijbehorende oxidator noemen we een redoxkoppel.
Normaal gesproken zetten we altijd de elektronen in een halfreactie aan de linkerkant. Om
twee halfreacties bij elkaar op te tellen moet je een halfreactie omdraaien om zo de
elektronen tegen elkaar weg te kunnen strepen.
Om te weten welke kant de reactie op loopt moet je weten hoe sterk de drang is van die
elektronen om opgenomen te worden.
Je kan het testen door een elektrode van zink in een oplossing van Zn2+ te doen en een
platinum elektrode met H2 gas en H+ in de oplossing. De voltmeter tussen deze elektroden
geeft dan de druk aan. De kant waar de elektronen meer afgestaan worden aan de
oplossing, wordt een beetje positief en de andere kant negatief, omdat hier juist meer
elektronen komen. De voltmeter slaat dan dus uit naar de positieve kant. Als je van alles
hierbij 1 M toevoegd (H2 en H+ zijn referentie) krijg je de redoxpotentiaal (E0). Als deze
negatief is dan staat de reductor makkelijker elektronen af dan H2. Positief staat de reductor
moeilijker elektronen af dan H2. Wat opvalt in stryer is dat ze niet de e- en de H+ niet
opschrijven in de redoxreacties. Wat ook raar is is dat de reactie van H+ naar H2 niet een
redoxpotentiaal van 0) hebben. Dit komt omdat ze in het boek een pH van 7 als standaard
gebruiken.
DG0’ = -n * F * E’0
DG = energie die beschikbaar is (J/mol)
n = aantal e- (mol e- betrokken in de reactie)
F = faraday (96,48 * 10^3 C/mol = 96,48 kJ/mol/V
Elektrochemie = we willen weten waar de ATP vandaan komt.
NADH kunnen we oxideren naar NAD+. NADH wordt gemaakt in het lichaam, voornamelijk in
de mitochondrien. Je moet deze NAD+ telkens weer recyclen.
Fysische chemie
Inhoudsopgave
Thema 1 elektrochemie en oxidatieve fosforylering.......................................................................................2
Hoorcollege 1 & 2.................................................................................................................................................2
Hoorcollege 3 & 4 Elektrochemie.........................................................................................................................4
Thema 2 thermodynamica............................................................................................................................. 7
Hoorcollege 5 & 6 biologische thermodynamica.................................................................................................7
Hoorcollege 7 & 8 Biologische thermodynamica...............................................................................................10
Hoorcollege 9 & 10 Biologische thermodynamica deel 3..................................................................................12
, Thema 1 elektrochemie en oxidatieve fosforylering
Hoorcollege 1 & 2
Redox
Energie/enthalpie - glucose kan je omzetten in ATP en warmte
Entropie – concentraties, gradienten, pH en (temperatuur).
Deze 3 komen samen in de Gibbs vrije energie.
De oxidatieve fosforylering
Redox reacties
Oxidator + e- reductor
Deze reactie heet reductie.
Reductor oxidator + e-
Deze reactie heet oxidatie.
De reductor en bijbehorende oxidator noemen we een redoxkoppel.
Normaal gesproken zetten we altijd de elektronen in een halfreactie aan de linkerkant. Om
twee halfreacties bij elkaar op te tellen moet je een halfreactie omdraaien om zo de
elektronen tegen elkaar weg te kunnen strepen.
Om te weten welke kant de reactie op loopt moet je weten hoe sterk de drang is van die
elektronen om opgenomen te worden.
Je kan het testen door een elektrode van zink in een oplossing van Zn2+ te doen en een
platinum elektrode met H2 gas en H+ in de oplossing. De voltmeter tussen deze elektroden
geeft dan de druk aan. De kant waar de elektronen meer afgestaan worden aan de
oplossing, wordt een beetje positief en de andere kant negatief, omdat hier juist meer
elektronen komen. De voltmeter slaat dan dus uit naar de positieve kant. Als je van alles
hierbij 1 M toevoegd (H2 en H+ zijn referentie) krijg je de redoxpotentiaal (E0). Als deze
negatief is dan staat de reductor makkelijker elektronen af dan H2. Positief staat de reductor
moeilijker elektronen af dan H2. Wat opvalt in stryer is dat ze niet de e- en de H+ niet
opschrijven in de redoxreacties. Wat ook raar is is dat de reactie van H+ naar H2 niet een
redoxpotentiaal van 0) hebben. Dit komt omdat ze in het boek een pH van 7 als standaard
gebruiken.
DG0’ = -n * F * E’0
DG = energie die beschikbaar is (J/mol)
n = aantal e- (mol e- betrokken in de reactie)
F = faraday (96,48 * 10^3 C/mol = 96,48 kJ/mol/V
Elektrochemie = we willen weten waar de ATP vandaan komt.
NADH kunnen we oxideren naar NAD+. NADH wordt gemaakt in het lichaam, voornamelijk in
de mitochondrien. Je moet deze NAD+ telkens weer recyclen.
