lOMoARcPSD|4306819
Gedownload door Lara vd Linde ()
, lOMoARcPSD|4306819
Gedownload door Lara vd Linde ()
, lOMoARcPSD|4306819
Samenvatting bioinformatica
Links
Gebruiken om restrictie-enzymen op te zoeken. Voeg het restrictie-enzym in de ‘SEARCH NEB’.
https://international.neb.com/
In Pubmed staat het originele artikel waarin deze sequentie (X80055.1) beschreven staat.
Gebruiken voor blast-analyse (inzichtelijk maken)
Gedownload door Lara vd Linde ()
, lOMoARcPSD|4306819
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Voor het verkrijgen van het reverse-complement http://www.bioinformatics.org/sms/rev_comp.html
Hierbij worden alle coderende sequenties aan elkaar gemaakt. Dus geen intronen. Wel uit hetzelfde gen.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast
Alfabetisch gerangschikte commands. https://ss64.com/bash/
Officiële Linux pagina.
http://www.gnu.org/software/coreutils/coreutils.html
Genome browser. Deze databank bevat de complete genomen van verschillende organismen, waaronder
mensen. Als er een nieuwe versie van een genoom gesequenced is komt deze terecht in de USCS databank, alsmede
verbeterde versie van bestaande genomen. Het humane genoom is al vijf keer vernieuwd door verbeterde sequentie-
technieken. Deze databank bevat verschillende opties waaronder een “genome browser” waarin je overzichtelijk alle
genen per chromosoom kan zien + vele extra’s. Je kan ook je eigen data uploaden in parallel met een genoom, zodat je
datasets over elkaar kan leggen.
http://genome-euro.ucsc.edu/
Search translation EMBOSS transeq
https://www.ebi.ac.uk/services
Hierbij kan je DNA omzetten in aminozuren https://www.ebi.ac.uk/Tools/st/emboss_transeq/
Voor het vinden van het isoelectrisch punt en Molair weight. https://web.expasy.org/compute_pi/
Voor het zoeken van pathways in de cellen. Eerst een lijst met pathways en dan klik je de juiste aan. En alle kaarten
zijn in teractief als je klikt op KEGG pathways 6. Human diseases acute myeloid leukemia. HELP voor legenda
https://www.kegg.jp/
NCBI structure
Gedownload door Lara vd Linde ()
Gedownload door Lara vd Linde ()
, lOMoARcPSD|4306819
Gedownload door Lara vd Linde ()
, lOMoARcPSD|4306819
Samenvatting bioinformatica
Links
Gebruiken om restrictie-enzymen op te zoeken. Voeg het restrictie-enzym in de ‘SEARCH NEB’.
https://international.neb.com/
In Pubmed staat het originele artikel waarin deze sequentie (X80055.1) beschreven staat.
Gebruiken voor blast-analyse (inzichtelijk maken)
Gedownload door Lara vd Linde ()
, lOMoARcPSD|4306819
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Voor het verkrijgen van het reverse-complement http://www.bioinformatics.org/sms/rev_comp.html
Hierbij worden alle coderende sequenties aan elkaar gemaakt. Dus geen intronen. Wel uit hetzelfde gen.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast
Alfabetisch gerangschikte commands. https://ss64.com/bash/
Officiële Linux pagina.
http://www.gnu.org/software/coreutils/coreutils.html
Genome browser. Deze databank bevat de complete genomen van verschillende organismen, waaronder
mensen. Als er een nieuwe versie van een genoom gesequenced is komt deze terecht in de USCS databank, alsmede
verbeterde versie van bestaande genomen. Het humane genoom is al vijf keer vernieuwd door verbeterde sequentie-
technieken. Deze databank bevat verschillende opties waaronder een “genome browser” waarin je overzichtelijk alle
genen per chromosoom kan zien + vele extra’s. Je kan ook je eigen data uploaden in parallel met een genoom, zodat je
datasets over elkaar kan leggen.
http://genome-euro.ucsc.edu/
Search translation EMBOSS transeq
https://www.ebi.ac.uk/services
Hierbij kan je DNA omzetten in aminozuren https://www.ebi.ac.uk/Tools/st/emboss_transeq/
Voor het vinden van het isoelectrisch punt en Molair weight. https://web.expasy.org/compute_pi/
Voor het zoeken van pathways in de cellen. Eerst een lijst met pathways en dan klik je de juiste aan. En alle kaarten
zijn in teractief als je klikt op KEGG pathways 6. Human diseases acute myeloid leukemia. HELP voor legenda
https://www.kegg.jp/
NCBI structure
Gedownload door Lara vd Linde ()
