HOOFDSTUK 4: EIWITOPZUIVERING
Introductie:
Na productie: eiwitten opgezuiverd worden
- Recombinante eiwit (interesse): 1-5 % v proteïne massa
- Alle onzuiverheden verwijderen
o Belangrijk voor opzuiveren:
Fysicochemische eig v recombinante product en onzuiverheden
Bronnen v onzuiverheden bv: contaminatie tijdens productie, …
- Opzuivering kostelijker dan productie zelf
Staalvoorbereiding:
Centrifugatie:
= Scheiden v mengsels door centrifugale kracht
- Centrifuge: toestel die rotor in roterende beweging om vaste as laat roteren
o Principe: sedimentatie
Oiv Zw scheiden stoffen zich obv dichtheid/zwaarte/vorm
Centrifuge: g-kracht >> zwaartekracht
Aan buitenkant zwaardere dingen (meer kracht op)
- Soorten scheidingen d.m.v. centrifugatie
o Pelleting:
Meest voorkomende
Pellet: op bodem centrifugebuis deeltjes geconcentreerd
Supernatans: overgebeleven oplossing
Vaak om bacteriën te oogsten of verwijderen
o Dichtheidsgradiënt:
Scheiding obv dichtheid
Betere resolutie dan klassieke
Principe:
Staal op matrix met gradiënt v dichtheid plaatsen (toe- of afnemen)
Centrifugatie
Moleculen in evenwicht met omgeving/matrix met zelfde dichtheid
Gescheiden deeltjes geoogst
Toepassingen:
Minder voor eiwitzuiveringen
Meer voor scheiding cellen, celorganellen, virussen, … (scheiding
bloed)
Dialyse:
= door selectieve en passieve diffusie via semi-permeabel membraan verwijderen v kleine
ongewenste verbindingen uit macromoleculen in oplossing
- Tot evenwicht in concentratie oplossing binnen/buiten membraan
- Door membraan:
o Wel: Kleine moleculen en bufferzouten
o Niet: moleculen groter dan poriegrootte vh membraan (bv eiwitten)
o Membranen: vers grootte bv: 3 kDa, 10 kDa, 50 kDa, …
o V staal << V buffer
, - Principe:
o Eiwitten in recipiënt afgelijnd door membraan
o Geheel in tank brengen met veel buffer
o Uitwisseling componenten v ene kant nr andere
o Buffer verversen + herhalen tot buffer hebben die ons interesseert
- Toepassingen:
o Verwijderen kleine onzuiverheden
o Veranderen v buffer:
Na/voor zuiveringsstap
Formulatiebuffer
Cellen openbreken:
- Bij zoogdiercellen & gisten: product meestal gesecreteerd nr medium met supernatans
verder gewerkt
- Bij bacteriën: productie meestal intracellulair verder werken met pellet, supernatans weg
o Eerst cellen openbreken
o Celwand bacteriën bemoeilijkt openbreken
o Fysieke disruptie methoden VS oplossing gebaseerde methoden
- Methoden:
o Fysieke methoden:
French press:
Onder grote druk (tot 1000 bar) door smalle opening geforceerd
Hoge schuifkrachten op cellen
Uit smalle opening: in fractie v seconde in atmosfersiche druk
Cellen breken open (soms herhalen)
Voordeel:
Capaciteit: 1000den liters per uur
Nadelen:
Grote krachten: warmte-ontwikkeling eiwitdenaturatie
Systeem adequaat koelen
Schudden in aanwezigheid v inerte parels (bv. glas):
Mengen met parels
Intens schudden/draaien
Bacteriën breken door botsen of geplet te worden
Optimale verhouding parels/bacteriën & schud-/draaisnelheid
noodzakelijk + afh v type bacterie
Voordeel:
Capaciteit: 1000den liters per uur
Nadelen:
Grote krachten: warmte-ontwikkeling eiwitdenaturatie
Systeem adequaat koelen
Sonicatie:
Pulsen hoog frequente geluidsgolven
Probe onderdompelen doorheen vloeibaar milieu sturen
Ontstaan microscopische luchtbelletjes
Imploderen
Ontstaan schokgolfjes openbreken cellen
Nadelen:
Warmte-ontwikkeling eiwitdenaturatie: opl systeem
adequaat koelen en korte implusen ipv langdurige
Enkel kleinere volumes (< 100 ml) + laboratoiumschaal
o Toevoegen detergenten:
Introductie:
Na productie: eiwitten opgezuiverd worden
- Recombinante eiwit (interesse): 1-5 % v proteïne massa
- Alle onzuiverheden verwijderen
o Belangrijk voor opzuiveren:
Fysicochemische eig v recombinante product en onzuiverheden
Bronnen v onzuiverheden bv: contaminatie tijdens productie, …
- Opzuivering kostelijker dan productie zelf
Staalvoorbereiding:
Centrifugatie:
= Scheiden v mengsels door centrifugale kracht
- Centrifuge: toestel die rotor in roterende beweging om vaste as laat roteren
o Principe: sedimentatie
Oiv Zw scheiden stoffen zich obv dichtheid/zwaarte/vorm
Centrifuge: g-kracht >> zwaartekracht
Aan buitenkant zwaardere dingen (meer kracht op)
- Soorten scheidingen d.m.v. centrifugatie
o Pelleting:
Meest voorkomende
Pellet: op bodem centrifugebuis deeltjes geconcentreerd
Supernatans: overgebeleven oplossing
Vaak om bacteriën te oogsten of verwijderen
o Dichtheidsgradiënt:
Scheiding obv dichtheid
Betere resolutie dan klassieke
Principe:
Staal op matrix met gradiënt v dichtheid plaatsen (toe- of afnemen)
Centrifugatie
Moleculen in evenwicht met omgeving/matrix met zelfde dichtheid
Gescheiden deeltjes geoogst
Toepassingen:
Minder voor eiwitzuiveringen
Meer voor scheiding cellen, celorganellen, virussen, … (scheiding
bloed)
Dialyse:
= door selectieve en passieve diffusie via semi-permeabel membraan verwijderen v kleine
ongewenste verbindingen uit macromoleculen in oplossing
- Tot evenwicht in concentratie oplossing binnen/buiten membraan
- Door membraan:
o Wel: Kleine moleculen en bufferzouten
o Niet: moleculen groter dan poriegrootte vh membraan (bv eiwitten)
o Membranen: vers grootte bv: 3 kDa, 10 kDa, 50 kDa, …
o V staal << V buffer
, - Principe:
o Eiwitten in recipiënt afgelijnd door membraan
o Geheel in tank brengen met veel buffer
o Uitwisseling componenten v ene kant nr andere
o Buffer verversen + herhalen tot buffer hebben die ons interesseert
- Toepassingen:
o Verwijderen kleine onzuiverheden
o Veranderen v buffer:
Na/voor zuiveringsstap
Formulatiebuffer
Cellen openbreken:
- Bij zoogdiercellen & gisten: product meestal gesecreteerd nr medium met supernatans
verder gewerkt
- Bij bacteriën: productie meestal intracellulair verder werken met pellet, supernatans weg
o Eerst cellen openbreken
o Celwand bacteriën bemoeilijkt openbreken
o Fysieke disruptie methoden VS oplossing gebaseerde methoden
- Methoden:
o Fysieke methoden:
French press:
Onder grote druk (tot 1000 bar) door smalle opening geforceerd
Hoge schuifkrachten op cellen
Uit smalle opening: in fractie v seconde in atmosfersiche druk
Cellen breken open (soms herhalen)
Voordeel:
Capaciteit: 1000den liters per uur
Nadelen:
Grote krachten: warmte-ontwikkeling eiwitdenaturatie
Systeem adequaat koelen
Schudden in aanwezigheid v inerte parels (bv. glas):
Mengen met parels
Intens schudden/draaien
Bacteriën breken door botsen of geplet te worden
Optimale verhouding parels/bacteriën & schud-/draaisnelheid
noodzakelijk + afh v type bacterie
Voordeel:
Capaciteit: 1000den liters per uur
Nadelen:
Grote krachten: warmte-ontwikkeling eiwitdenaturatie
Systeem adequaat koelen
Sonicatie:
Pulsen hoog frequente geluidsgolven
Probe onderdompelen doorheen vloeibaar milieu sturen
Ontstaan microscopische luchtbelletjes
Imploderen
Ontstaan schokgolfjes openbreken cellen
Nadelen:
Warmte-ontwikkeling eiwitdenaturatie: opl systeem
adequaat koelen en korte implusen ipv langdurige
Enkel kleinere volumes (< 100 ml) + laboratoiumschaal
o Toevoegen detergenten: