Biochemie 2
,Biochemie semester 2
1. inleiding
2. functionele groepen in de bio organische chemie
• Organische verbindingen: verbinden met koolstofketens (koolstofchemie)
• Families: org. moleculen = onderverdeeld in versch. Families, gekenmerkt dr functionele groepen ( =
groepen atomen) Zelfde familie = gelijkaardige chemische eigenschappen
2.1 herhaling biochemie 1
• Voorstellingen vr alle bindingen
o Molecuulformule
o Bol-staafmodel
o Van der Waals- model
• Voorstellingen specifiek voor organische bindingen
benaming weergave voorbeeld
brutoformule molecuulformule voor organische C6H12O6
verbindingen
structuurformule 2D weergave van de structuur van
een molecuul.
Alle atomen + manier waarop ze
gekoppeld zijn.
Lewis-structuur versie v structuurformule +
weergave van vrije
elektronenparen
Beknopte structuurformule vereenvoudiging v CHO-CHOH-CHOH-CHOH-CHOH -
structuurformule CH2-OH
atomen gegroepeerd per C-at,
geen vrije EP.
skeletnotatie eenvoudigste en snelste manier .
2.1.2Klassering van organische moleculen:
Naam definitief uitgang Verzadigd / onverzadigd
Alkanen Ketens van C-atomen -aan verzadigd
waarbij C-atomen
enkelvoudig gebonden
worden aan elkaar of
aan H-atomen.
alkenen Ketens waar een paar C- -een onverzadigd
atomen een dubbele
binding aangaan met
elkaar.
alkynen Ketens waar een paar C- -yn onverzadigd
atomen een drievoudige
binding met elkaar
aangaat
cycloalkanen Keten waarbij Prefix cyclo - verzadigd
tenminsten 1 c-atoom
1
,Biochemie semester 2
terug gebonden is met
de eigen keten
• Vertakte KWS : C-atoom = verbonden met 2 , 3 of 4 andere c-atomen
o C-at kan primair, secundair, tertair of quaternair zijn = 1, 2, 3 of 4 andere atomen of groepen
verschillend van waterstof die gebonden zijn op dat c-atoom.
2.1.3 functionele groepen in de bio-organische chemie
• Functionele groepen: C bindt niet enkel aan C en H maar aan alle Heteroatomen
o O, N, S
o Halogenen F, Cl, Br
• Benoeming functionele groepen: met prefix en suffix
• 1 molecule kan meerdere functionele groepen bevatten.
• Soms voorgesteld als -R
Functionele groepen:
2
, Biochemie semester 2
2.1.4 vertakkingsgraad van functionele groepen
Namen uitleg weergave
alcoholen Primaire alcoholen: OH groep
gebonden op een koolstof
waarop nog 2 H-at gebonden
zijn.
Secundaire alcoholen: OH
gebonden op koolstof
waarop nog maar 1 H
gebonden is
Tertiaire: gebonden op
koolstof waarop geen H
gebonden is
Amines Afgeleiden van ammoniak
(NH3) waarbij 1 of meerdere
waterstoffen zijn vervangen
door alkylgroepen.
Primaire, secundaire,
tertiaire: = afh v aantal
alkylgroepen (CH) gebonden
op N atoom
• Binding N bij Ammoniak: N heeft nog een vrij EP : kan een 4 binding aangaan:
o Met waterstof → positief geladen ammoniumion
3
,Biochemie semester 2
1. inleiding
2. functionele groepen in de bio organische chemie
• Organische verbindingen: verbinden met koolstofketens (koolstofchemie)
• Families: org. moleculen = onderverdeeld in versch. Families, gekenmerkt dr functionele groepen ( =
groepen atomen) Zelfde familie = gelijkaardige chemische eigenschappen
2.1 herhaling biochemie 1
• Voorstellingen vr alle bindingen
o Molecuulformule
o Bol-staafmodel
o Van der Waals- model
• Voorstellingen specifiek voor organische bindingen
benaming weergave voorbeeld
brutoformule molecuulformule voor organische C6H12O6
verbindingen
structuurformule 2D weergave van de structuur van
een molecuul.
Alle atomen + manier waarop ze
gekoppeld zijn.
Lewis-structuur versie v structuurformule +
weergave van vrije
elektronenparen
Beknopte structuurformule vereenvoudiging v CHO-CHOH-CHOH-CHOH-CHOH -
structuurformule CH2-OH
atomen gegroepeerd per C-at,
geen vrije EP.
skeletnotatie eenvoudigste en snelste manier .
2.1.2Klassering van organische moleculen:
Naam definitief uitgang Verzadigd / onverzadigd
Alkanen Ketens van C-atomen -aan verzadigd
waarbij C-atomen
enkelvoudig gebonden
worden aan elkaar of
aan H-atomen.
alkenen Ketens waar een paar C- -een onverzadigd
atomen een dubbele
binding aangaan met
elkaar.
alkynen Ketens waar een paar C- -yn onverzadigd
atomen een drievoudige
binding met elkaar
aangaat
cycloalkanen Keten waarbij Prefix cyclo - verzadigd
tenminsten 1 c-atoom
1
,Biochemie semester 2
terug gebonden is met
de eigen keten
• Vertakte KWS : C-atoom = verbonden met 2 , 3 of 4 andere c-atomen
o C-at kan primair, secundair, tertair of quaternair zijn = 1, 2, 3 of 4 andere atomen of groepen
verschillend van waterstof die gebonden zijn op dat c-atoom.
2.1.3 functionele groepen in de bio-organische chemie
• Functionele groepen: C bindt niet enkel aan C en H maar aan alle Heteroatomen
o O, N, S
o Halogenen F, Cl, Br
• Benoeming functionele groepen: met prefix en suffix
• 1 molecule kan meerdere functionele groepen bevatten.
• Soms voorgesteld als -R
Functionele groepen:
2
, Biochemie semester 2
2.1.4 vertakkingsgraad van functionele groepen
Namen uitleg weergave
alcoholen Primaire alcoholen: OH groep
gebonden op een koolstof
waarop nog 2 H-at gebonden
zijn.
Secundaire alcoholen: OH
gebonden op koolstof
waarop nog maar 1 H
gebonden is
Tertiaire: gebonden op
koolstof waarop geen H
gebonden is
Amines Afgeleiden van ammoniak
(NH3) waarbij 1 of meerdere
waterstoffen zijn vervangen
door alkylgroepen.
Primaire, secundaire,
tertiaire: = afh v aantal
alkylgroepen (CH) gebonden
op N atoom
• Binding N bij Ammoniak: N heeft nog een vrij EP : kan een 4 binding aangaan:
o Met waterstof → positief geladen ammoniumion
3
