PCR: 3 opeenvolgende stappen + uitleg:
-denaturatie: ds dna naar enkelstrengig dna
-annealing: primers binden
-elongatie: verlengen en maken van 2 strengen => 2x ds dna
Benodigdheden PCR:
-template dna
-dntp
-taq polymerase
-primers
Supersecundaire structuur:
-motieven in iets uitgebreidere gebieden van ruiltelijke conformatie
Secundaire structuur:
-volledige ew structuur over korte afstand
Primaire structuur:
- Az sequenties, zwavelbruggen
Tertiaire structuur:
- Volledige ruimtelijke structuur van 1 polypeptideketen
Quaternaire structuur:
-volledige ruimtelijke structuur van 1 ew uit verschillende polypeptideketens
Mitochondriaal DNA:
- Circulair, in elke cel: meerdere mitochondrien: maken hun zelf aan: gezond of ziek, 16000bp,
synthetiseerd 2rrna, 22trna en 13 ew
cfDNA: cell free DNA
cffDNA: cell free foetaal DNA
ctDNA:circulair tumor DNA
solitaire genen: genen op hun zelf, geen ander gen te bekennen in de omgeving
cluster genen: een cluster van genen
unieke genen: zeldzaam
genenfamilie: met ongeveer dezelfde functie bv 6 genen in de buurt van elkaar me dezelfde functie
pseudogenen: geen actief mrna
tandem repeats: gelijkaardige sequentie terug te vinden en in dezelfde richting
,extragenisch DNA:
-<DNA tussen genen
-laag of uniek repetitief
-matig of hoog repeptitief:
Tandem repeats, micro en minisatelliet
Verspreid repetitief: line en sine
LINE= long intersperced nucleic enteties
SINE= short intersperced nucleic enteties
Dosiscompensatie:
- Regulatorisch mechanisme dat ervoor zorgt dat expressieniveau ’s gelijk blijven op x-
chromosoom in mannen en vrouwen
Doel koppelingsanalyse:
- Opsporen van ziektegen in een humane karyogram/ genenkaart
Proef van Griffith:
- staphylococcus pneumoniae
- 2 varianten: r stam/ruige stam of s stam/ gladde stam
- gladde stam heeft polysacharide kapsel dat voorkomt fagocytose
S stam is virulent
R stam is niet virulent
Genenkaart fruitvlieg:
400 genen
4 koppelingsgroepen:
-2 grote
-1 middelmatige
-1 kleine
Recombinatiefrequentie:
- Is recht evenredig met de afstand tussen 2 genen
, X-inactivatie:
-Xist-gen zorgt voor een laagje op 1 x-chromosoom => inactivatie en condensatie barr lichaampje
DNA ligase:
- Verbindt vrije 5’ uiteinde met vrije 3’ uiteinde
Helicase:
- Enzym dat dsDNA ssDNA maakt helix breekt
RNA primase:
- RNA primer voegt dit enzym toe
Topoïsomerase:
- Zorgt ervoor dat het aantal windingen niet te hoog of niet te laag is, houd aantal windingen
gelijk
Telomerase:
- Verlengt 3’ uiteinde, dit enzym het RNA primer in zich
Huishoudgen + functie:
- Blijft altijd stabiel, zorgt ervoor dat de synthese over hetzelfde verloopt en op hetzelfde
tempo
ORI:
- Initiatieplaats voor de replicatie
EST:
- expressed sequenced taq
- specifieke korte sequentie van een transcript van een gen
Genetische code:
- Universeel, oud en perfect
-denaturatie: ds dna naar enkelstrengig dna
-annealing: primers binden
-elongatie: verlengen en maken van 2 strengen => 2x ds dna
Benodigdheden PCR:
-template dna
-dntp
-taq polymerase
-primers
Supersecundaire structuur:
-motieven in iets uitgebreidere gebieden van ruiltelijke conformatie
Secundaire structuur:
-volledige ew structuur over korte afstand
Primaire structuur:
- Az sequenties, zwavelbruggen
Tertiaire structuur:
- Volledige ruimtelijke structuur van 1 polypeptideketen
Quaternaire structuur:
-volledige ruimtelijke structuur van 1 ew uit verschillende polypeptideketens
Mitochondriaal DNA:
- Circulair, in elke cel: meerdere mitochondrien: maken hun zelf aan: gezond of ziek, 16000bp,
synthetiseerd 2rrna, 22trna en 13 ew
cfDNA: cell free DNA
cffDNA: cell free foetaal DNA
ctDNA:circulair tumor DNA
solitaire genen: genen op hun zelf, geen ander gen te bekennen in de omgeving
cluster genen: een cluster van genen
unieke genen: zeldzaam
genenfamilie: met ongeveer dezelfde functie bv 6 genen in de buurt van elkaar me dezelfde functie
pseudogenen: geen actief mrna
tandem repeats: gelijkaardige sequentie terug te vinden en in dezelfde richting
,extragenisch DNA:
-<DNA tussen genen
-laag of uniek repetitief
-matig of hoog repeptitief:
Tandem repeats, micro en minisatelliet
Verspreid repetitief: line en sine
LINE= long intersperced nucleic enteties
SINE= short intersperced nucleic enteties
Dosiscompensatie:
- Regulatorisch mechanisme dat ervoor zorgt dat expressieniveau ’s gelijk blijven op x-
chromosoom in mannen en vrouwen
Doel koppelingsanalyse:
- Opsporen van ziektegen in een humane karyogram/ genenkaart
Proef van Griffith:
- staphylococcus pneumoniae
- 2 varianten: r stam/ruige stam of s stam/ gladde stam
- gladde stam heeft polysacharide kapsel dat voorkomt fagocytose
S stam is virulent
R stam is niet virulent
Genenkaart fruitvlieg:
400 genen
4 koppelingsgroepen:
-2 grote
-1 middelmatige
-1 kleine
Recombinatiefrequentie:
- Is recht evenredig met de afstand tussen 2 genen
, X-inactivatie:
-Xist-gen zorgt voor een laagje op 1 x-chromosoom => inactivatie en condensatie barr lichaampje
DNA ligase:
- Verbindt vrije 5’ uiteinde met vrije 3’ uiteinde
Helicase:
- Enzym dat dsDNA ssDNA maakt helix breekt
RNA primase:
- RNA primer voegt dit enzym toe
Topoïsomerase:
- Zorgt ervoor dat het aantal windingen niet te hoog of niet te laag is, houd aantal windingen
gelijk
Telomerase:
- Verlengt 3’ uiteinde, dit enzym het RNA primer in zich
Huishoudgen + functie:
- Blijft altijd stabiel, zorgt ervoor dat de synthese over hetzelfde verloopt en op hetzelfde
tempo
ORI:
- Initiatieplaats voor de replicatie
EST:
- expressed sequenced taq
- specifieke korte sequentie van een transcript van een gen
Genetische code:
- Universeel, oud en perfect