ZELFSTUDIE 3: RNA PROCESSING DOELSTELLINGEN IN ROOD AANGEDUID
Algemene opdrachten
Geef de definitie van RNA-processing
RNA processing is de modificatie die tRNA omzetten naar matuur RNA.
Beschrijf het proces van mRNA splicing (+ gebruikte eiwitten)
Eerste twee subeenheden binden aan 5’ splice site en branch punt. Hierna zullen
bijkomende subeenheden binden (ook aan 3’ splice site) en vormen zo een lus. De 5’
splice site wordt geknipt en verbonden met het branch punt. De twee subunits zullen
verdwijnen. De 3’ splice site wordt geknipt en exon 1 wordt verbonden aan exon 2.
Hierdoor zal het intron worden vrijgesteld en zo ook de subeenheden. Het intron zal later
gedegradeerd worden.
In het kort intronen worden verwijderd dankzij spliceosomen en de exonen blijven
achter. Deze zullen aan elkaar vastgemaakt worden ook door de spliceosomen.
Leg uit: Alternatieve splicing en self-splicing.
Bij alternatieve splicing zal een gen kunnen coderen voor meerdere polypeptiden met
verschillende AZ sequentie. Bij self-splicing echter gaat het om intronen in rRNA en
tRNA. Deze intronen worden niet verwijderd door spliceosomen maar door het RNA zelf.
Dit soort RNA dat een chemische reactie kan katalyseren, wordt ook wel ribozyme
genoemd.
Leg het proces van capping uit (+ gebruikte eiwitten) en verklaar de functie van de 5’
cap.
De 5’ cap wordt gesynthetiseerd reeds tijdens transcriptie na synthese 20-25 N. Deze
bestaat uit een 7-methylguenosine structuur. De 5’ cap wordt herkend door 5’ cap
bindende eiwitten, dit is nodig zodat de mRNa de kern deftig kunnen verlaten. Nadat de
mRNA in het cytosol terechtkomt, zal de 5’ cap door andere cap bindende eiwitten
herkend worden. Zo zal het mogelijk zijn dat mRNA kan binden op een ribosoom voor
translatie.
Beschrijf de functie van de poly-A staart en leg uit hoe deze gevormd wordt.
De poly-A staart zorgt voor hogere stabiliteit van mRNA zodat deze langer in het cytosol
kan blijven. De poly-A staart wordt toegevoegd aan het 3’ uiteinde na transcriptie en
bestaat uit zo’n 100 à 200 adenine nucleotiden.
Specifieke opdrachten
1.Duid aan met juist of fout: De niet-vertaalde sequenties die verwijderd worden tijdens
de eukaryote RNA processing, heten...
a. exonen
=> FOUT
b. intronen
=> JUIST
c. promotors
=> FOUT
d. codons
=> FOUT
e. ribozymen
=> FOUT
, 2. Duid aan met juist of fout: Wat gebeurt er uiteindelijk met een intronsequentie nadat
deze uit het mRNA werd geknipt?
a. Het wordt vertaald in een proteïne
=> FOUT, dit gebeurt bij exonen
b. Het is lineair RNA dat wordt gedegradeerd door ribonucleases
=> JUIST
c. Het wordt getransporteerd naar het cytoplasma met behulp van het spliceosoom
=> FOUT
3. Duid aan met juist of fout: Welk van onderstaande moleculen bevat een sequentie die
complementair is aan de consensussequentie van de donor splice-site van de intronen?
a. microRNA
=> FOUT, microRNA is tranlsationele regulatie door binding aan 3’
b. snRNP subeenheden
=> JUIST, zijn eenheden die heel belangrijke rol spelen en spiceosomen opmaken
c. Exonische splicing enhancers
=> FOUT
4. Duid aan met juist of fout: Welk van onderstaande beweringen omtrent de poly-A
staart is/zijn correct?
a. De poly-A staart bevindt zich aan het 3’-uiteinde van het RNA
=> JUIST
b. De poly-A staart wordt overgeschreven van de DNA-template
=> FOUT, wordt enzymatisch toegevoegd
c. Een poly-A staart treft men aan bij transcripten voortgebracht door RNA polymerase
=> JUIST, alle transcripten worden voortgebracht door RNA polymerase
d. De poly-A staart in bacteriën heeft een tegengesteld effect
=> JUIST
5. Duid aan met juist of fout: Welk van onderstaande RNA-modificaties kan je het best
beschrijven als ‘het verwijderen van tussenliggende sequenties’?
a. Trimmen
=> FOUT
b. 5’ capping
=> FOUT
c. Polyadenylatie
=> FOUT
d. Splicing
=> JUIST
e. RNA-processing of base-modificatie
=> FOUT
6. Duid aan met juist of fout: Welk van de onderstaande moleculen zou je verwachten te
vinden wanneer je een spliceosoom zou isoleren?
a. Enkel RNA
=> FOUT
b. Enkel Proteïnen
=> FOUT
c. Zowel RNA als proteïnen
=> JUIST, spliceosoom bestaat uit RNA en proteïnen
d. Noch RNA noch proteïnen
=> FOUT
Algemene opdrachten
Geef de definitie van RNA-processing
RNA processing is de modificatie die tRNA omzetten naar matuur RNA.
Beschrijf het proces van mRNA splicing (+ gebruikte eiwitten)
Eerste twee subeenheden binden aan 5’ splice site en branch punt. Hierna zullen
bijkomende subeenheden binden (ook aan 3’ splice site) en vormen zo een lus. De 5’
splice site wordt geknipt en verbonden met het branch punt. De twee subunits zullen
verdwijnen. De 3’ splice site wordt geknipt en exon 1 wordt verbonden aan exon 2.
Hierdoor zal het intron worden vrijgesteld en zo ook de subeenheden. Het intron zal later
gedegradeerd worden.
In het kort intronen worden verwijderd dankzij spliceosomen en de exonen blijven
achter. Deze zullen aan elkaar vastgemaakt worden ook door de spliceosomen.
Leg uit: Alternatieve splicing en self-splicing.
Bij alternatieve splicing zal een gen kunnen coderen voor meerdere polypeptiden met
verschillende AZ sequentie. Bij self-splicing echter gaat het om intronen in rRNA en
tRNA. Deze intronen worden niet verwijderd door spliceosomen maar door het RNA zelf.
Dit soort RNA dat een chemische reactie kan katalyseren, wordt ook wel ribozyme
genoemd.
Leg het proces van capping uit (+ gebruikte eiwitten) en verklaar de functie van de 5’
cap.
De 5’ cap wordt gesynthetiseerd reeds tijdens transcriptie na synthese 20-25 N. Deze
bestaat uit een 7-methylguenosine structuur. De 5’ cap wordt herkend door 5’ cap
bindende eiwitten, dit is nodig zodat de mRNa de kern deftig kunnen verlaten. Nadat de
mRNA in het cytosol terechtkomt, zal de 5’ cap door andere cap bindende eiwitten
herkend worden. Zo zal het mogelijk zijn dat mRNA kan binden op een ribosoom voor
translatie.
Beschrijf de functie van de poly-A staart en leg uit hoe deze gevormd wordt.
De poly-A staart zorgt voor hogere stabiliteit van mRNA zodat deze langer in het cytosol
kan blijven. De poly-A staart wordt toegevoegd aan het 3’ uiteinde na transcriptie en
bestaat uit zo’n 100 à 200 adenine nucleotiden.
Specifieke opdrachten
1.Duid aan met juist of fout: De niet-vertaalde sequenties die verwijderd worden tijdens
de eukaryote RNA processing, heten...
a. exonen
=> FOUT
b. intronen
=> JUIST
c. promotors
=> FOUT
d. codons
=> FOUT
e. ribozymen
=> FOUT
, 2. Duid aan met juist of fout: Wat gebeurt er uiteindelijk met een intronsequentie nadat
deze uit het mRNA werd geknipt?
a. Het wordt vertaald in een proteïne
=> FOUT, dit gebeurt bij exonen
b. Het is lineair RNA dat wordt gedegradeerd door ribonucleases
=> JUIST
c. Het wordt getransporteerd naar het cytoplasma met behulp van het spliceosoom
=> FOUT
3. Duid aan met juist of fout: Welk van onderstaande moleculen bevat een sequentie die
complementair is aan de consensussequentie van de donor splice-site van de intronen?
a. microRNA
=> FOUT, microRNA is tranlsationele regulatie door binding aan 3’
b. snRNP subeenheden
=> JUIST, zijn eenheden die heel belangrijke rol spelen en spiceosomen opmaken
c. Exonische splicing enhancers
=> FOUT
4. Duid aan met juist of fout: Welk van onderstaande beweringen omtrent de poly-A
staart is/zijn correct?
a. De poly-A staart bevindt zich aan het 3’-uiteinde van het RNA
=> JUIST
b. De poly-A staart wordt overgeschreven van de DNA-template
=> FOUT, wordt enzymatisch toegevoegd
c. Een poly-A staart treft men aan bij transcripten voortgebracht door RNA polymerase
=> JUIST, alle transcripten worden voortgebracht door RNA polymerase
d. De poly-A staart in bacteriën heeft een tegengesteld effect
=> JUIST
5. Duid aan met juist of fout: Welk van onderstaande RNA-modificaties kan je het best
beschrijven als ‘het verwijderen van tussenliggende sequenties’?
a. Trimmen
=> FOUT
b. 5’ capping
=> FOUT
c. Polyadenylatie
=> FOUT
d. Splicing
=> JUIST
e. RNA-processing of base-modificatie
=> FOUT
6. Duid aan met juist of fout: Welk van de onderstaande moleculen zou je verwachten te
vinden wanneer je een spliceosoom zou isoleren?
a. Enkel RNA
=> FOUT
b. Enkel Proteïnen
=> FOUT
c. Zowel RNA als proteïnen
=> JUIST, spliceosoom bestaat uit RNA en proteïnen
d. Noch RNA noch proteïnen
=> FOUT
