samenvatting practica biostatistiek
Merel De Ridder
Inhoudstafel
practicum 2............................................................................................................ 2
video 1 – Ongepaarde T-test................................................................................ 2
video 2 – Gepaarde T-test.................................................................................... 3
video 3 – Mann-Whitney U test............................................................................3
video 4 – Wilcoxon Signed Rank Test...................................................................4
Video 5 – One-way ANOVA................................................................................... 4
Video 6 – Kruskal-Wallis Test................................................................................ 5
video 7 – Post hoc analyse.................................................................................. 6
practicum 3............................................................................................................ 9
video 1 – Chi-kwadraat en Fisher’s exact............................................................9
video 2 – Odds Ratio.......................................................................................... 10
practicum 4.......................................................................................................... 11
video 1 – correlatie of regressie........................................................................11
video 2 – Pearson en Spearman correlatie........................................................11
Pearson.......................................................................................................... 12
Spearman....................................................................................................... 12
video 3 – Simple linear regession......................................................................13
video 4 – Multiple linear regression...................................................................14
practicum 5.......................................................................................................... 16
video 1 – 2 Way ANOVA..................................................................................... 16
Video 2 – ANCOVA............................................................................................. 18
Video 3 - Parameterschattingen 1 (hoofdeffecten)............................................19
Video 4 – Parameterschattingen 2 (interacties).................................................20
1
, samenvatting practica biostatistiek
Merel De Ridder
practicum 2
video 1 – Ongepaarde T-test
- gaat na of er een significant verschil is tussen de gemiddelden van exact 2
groepen
- de data is ongepaard
- parametrische test: data is bij benadering normaal verdeeld
- bv: zijn mannen gemiddeld groter dan vrouwen
variabelen:
- 1 categorische variabele van 2 niveaus (bv. geslacht: man – vrouw)
- 1 continue variabele (bv. lengte)
nulhypothese:
- geen verschil tussen de gemiddelden van 2 groepen
- als p-waarde kleiner is dan 0,05 is er wél een verschil tussen de
gemiddelde van beide groepen
varianten:
1. voor gelijke variantie
2. voor ongelijke vanriantie
- Levene’s test om te weten welke je moet kiezen: test om na te gaan of de
varianties van de groepen gelijk zijn of niet
- hypothesetest
- heeft ook een nulhypothese: geen verschil tussen de varianties
- kleiner dan 0,05 ongelijke variantie
- groter dan 0,05 gelijke variantie
- outcome van Levene’s test bepaalt welke van de 2 p-waarde voor de
T-test je moet bekijken
beslissingsboom:
1. verschil tussen onafhankelijke metingen (ongepaard)
2. 1 continue en 1 categorische variabele
3. parametrisch
4. niet >2 groepen
5. ongepaarde student T-test
6. check gelijkheid van varianties
SPSS:
- analyse/CompareMeans/Independent Sample T-test
- bij Test Variable: continue variabele
- bij Grouping Variable : categorische variabele
- define groups: bv ‘1’ en ‘2’
2
, samenvatting practica biostatistiek
Merel De Ridder
- in output : ‘sig’ staat voor de p-waarde (is er zowel voor de Levene’s test
als 2 voor de T-test)
video 2 – Gepaarde T-test
nulhypothese:
- gemiddelde van het verschil van twee verdelingen is gelijk aan 0
- bv: is er een verschil tussen het BMI voor en het BMI na het volgen van een
dieet?
- gepaarde data (metingen 1 aan 1 gelinkt)
- parametrisch: data is normaal verdeeld: kijk naar het verschil tussen beide
distributies, groepen apart hoeven niet normaal verdeeld te zijn
variabelen:
- 1 variabele die we kunnen opdelen in 2 groepen waarbij de metingen 1 aan
1 gelinkt kunnen worden (bv. variabele BMI opgedeeld in voor en na het
dieet – proefpersoon is de link tussen de 2 metingen)
beslissingsboom:
1. verschil tussen afhankelijke metingen bepalen (gepaard)
2. parametrisch
3. gepaarde student T-test
SPSS:
- Analyse/CompareMeans/Paired Samples T-test
- variabele 1 = meting op tijdstip 1
- variabele 2 = meting op tijdstip 2
- in output : paired samples Test
- p-waarde bij sig (2-tailed)
video 3 – Mann-Whitney U test
- niet parametrische tegenhanger van de ongepaarde T-test
- bv. Is er een verschil in leeftijd tussen Japanners en Somaliërs?
nulhypothese:
- er is geen verschil in mediaan tussen twee verdelingen
variabelen:
- 1 categorische variabele van 2 niveaus, ongepaard (bv. nationaliteit)
- 1 continue variabele (bv. leeftijd)
beslissingsboom:
1. verschil tussen onafhankelijke metingen (ongepaard)
2. 1 continue en 1 categorische variabele
3. niet parametrisch
4. niet >2 groepen
5. Mann-Withney
SPSS:
3
Merel De Ridder
Inhoudstafel
practicum 2............................................................................................................ 2
video 1 – Ongepaarde T-test................................................................................ 2
video 2 – Gepaarde T-test.................................................................................... 3
video 3 – Mann-Whitney U test............................................................................3
video 4 – Wilcoxon Signed Rank Test...................................................................4
Video 5 – One-way ANOVA................................................................................... 4
Video 6 – Kruskal-Wallis Test................................................................................ 5
video 7 – Post hoc analyse.................................................................................. 6
practicum 3............................................................................................................ 9
video 1 – Chi-kwadraat en Fisher’s exact............................................................9
video 2 – Odds Ratio.......................................................................................... 10
practicum 4.......................................................................................................... 11
video 1 – correlatie of regressie........................................................................11
video 2 – Pearson en Spearman correlatie........................................................11
Pearson.......................................................................................................... 12
Spearman....................................................................................................... 12
video 3 – Simple linear regession......................................................................13
video 4 – Multiple linear regression...................................................................14
practicum 5.......................................................................................................... 16
video 1 – 2 Way ANOVA..................................................................................... 16
Video 2 – ANCOVA............................................................................................. 18
Video 3 - Parameterschattingen 1 (hoofdeffecten)............................................19
Video 4 – Parameterschattingen 2 (interacties).................................................20
1
, samenvatting practica biostatistiek
Merel De Ridder
practicum 2
video 1 – Ongepaarde T-test
- gaat na of er een significant verschil is tussen de gemiddelden van exact 2
groepen
- de data is ongepaard
- parametrische test: data is bij benadering normaal verdeeld
- bv: zijn mannen gemiddeld groter dan vrouwen
variabelen:
- 1 categorische variabele van 2 niveaus (bv. geslacht: man – vrouw)
- 1 continue variabele (bv. lengte)
nulhypothese:
- geen verschil tussen de gemiddelden van 2 groepen
- als p-waarde kleiner is dan 0,05 is er wél een verschil tussen de
gemiddelde van beide groepen
varianten:
1. voor gelijke variantie
2. voor ongelijke vanriantie
- Levene’s test om te weten welke je moet kiezen: test om na te gaan of de
varianties van de groepen gelijk zijn of niet
- hypothesetest
- heeft ook een nulhypothese: geen verschil tussen de varianties
- kleiner dan 0,05 ongelijke variantie
- groter dan 0,05 gelijke variantie
- outcome van Levene’s test bepaalt welke van de 2 p-waarde voor de
T-test je moet bekijken
beslissingsboom:
1. verschil tussen onafhankelijke metingen (ongepaard)
2. 1 continue en 1 categorische variabele
3. parametrisch
4. niet >2 groepen
5. ongepaarde student T-test
6. check gelijkheid van varianties
SPSS:
- analyse/CompareMeans/Independent Sample T-test
- bij Test Variable: continue variabele
- bij Grouping Variable : categorische variabele
- define groups: bv ‘1’ en ‘2’
2
, samenvatting practica biostatistiek
Merel De Ridder
- in output : ‘sig’ staat voor de p-waarde (is er zowel voor de Levene’s test
als 2 voor de T-test)
video 2 – Gepaarde T-test
nulhypothese:
- gemiddelde van het verschil van twee verdelingen is gelijk aan 0
- bv: is er een verschil tussen het BMI voor en het BMI na het volgen van een
dieet?
- gepaarde data (metingen 1 aan 1 gelinkt)
- parametrisch: data is normaal verdeeld: kijk naar het verschil tussen beide
distributies, groepen apart hoeven niet normaal verdeeld te zijn
variabelen:
- 1 variabele die we kunnen opdelen in 2 groepen waarbij de metingen 1 aan
1 gelinkt kunnen worden (bv. variabele BMI opgedeeld in voor en na het
dieet – proefpersoon is de link tussen de 2 metingen)
beslissingsboom:
1. verschil tussen afhankelijke metingen bepalen (gepaard)
2. parametrisch
3. gepaarde student T-test
SPSS:
- Analyse/CompareMeans/Paired Samples T-test
- variabele 1 = meting op tijdstip 1
- variabele 2 = meting op tijdstip 2
- in output : paired samples Test
- p-waarde bij sig (2-tailed)
video 3 – Mann-Whitney U test
- niet parametrische tegenhanger van de ongepaarde T-test
- bv. Is er een verschil in leeftijd tussen Japanners en Somaliërs?
nulhypothese:
- er is geen verschil in mediaan tussen twee verdelingen
variabelen:
- 1 categorische variabele van 2 niveaus, ongepaard (bv. nationaliteit)
- 1 continue variabele (bv. leeftijd)
beslissingsboom:
1. verschil tussen onafhankelijke metingen (ongepaard)
2. 1 continue en 1 categorische variabele
3. niet parametrisch
4. niet >2 groepen
5. Mann-Withney
SPSS:
3
