BIJZONDERE
BACTERIOLOGIE
ZELFSTUDIE Yasmina Jongbloet 3de bachelor 2023-2024
1. TAXONOMIE
Taxonomie is het indelen van bacterien in taxa. Hier worden er namen toegekend aan
de verschillende bacterien. Het gaat over de classificatie van bacterien en hoe ga je
1
,een naam toe kenne aan een bepaalde groep van bacterien. Maar natuurlijk is de ID
ook belangrijk. Als we een bacteie isoleren uit een dier hoe gaan we bepalen tot
welke TAXA deze behoort.
Basis taxonomische eenheid is het species. Vb: Escherichia coli. Een species is een
verzameling van allemaal evrschillende stammen en deze stammen hebben allemaal
hel veel gemeenschappelijke eigenschappen. Een stam =reincultuur van 1 isolaat, pe
species is er telkens 1 referentiestam. Dit is zo omdat de referentiestammen
opgeslagen worden in internationale bacterie collecties en het dient als een soort
vergelijkingstam —> indeling.
Nomenclatuur : we hebben verschillende indelingen
- Fylum : hoofdtaxa, heel veel taxa. Kan behoren tot verschillende klasses.
- Klasse
- Orde
- Familie
- Genus: binnen een genus zijn er subspecies en andere terminologien om
species nog verder onder te verdelen.
Serotypes : varianten van een bepaald species die andere
eigenschappen hebben van de celwand zodanig dat als er een dier
geinfecteerd word, het dier antilichamen produceert tegen een bepaald
serotype?
Biotypes
Genotypes
Faagtypes
Ecotypes
Pathotypes
- Species
- Subspecies
Fylogenie : verwantschaps onderzoek, hoe dichter bepaalde kiemen bij elkaar op zo
een boom liggen hoe meer verwant deze kiemen zijn. Methodes die heirgebruikt
worden :
- Polyfasische benadering:
kijken naar geno en
fenotype.
- Genoomsequenties
- 16S of 23S rRNA genen.
- Huishoudgenen
PROTEOBACTERIA : ANAEROOB
EN -
2
, 2. ENTEROBACTERIACEAE
Yersinia
Yersinia is een belangrijk genus in de DGK en twee species die we zullen berspreken
yersinia pseudotuberculosis en enterocolitica. Het zijn faculatities anaeroben en
kleine staafjes. Ze groeien iets trager op de klassieke voedingsbodems. We zien rode
staafjes met een negatieve gram kleuring.
Yersinia pestis was bealngrijk, of soms nog, het noemt ook wel de zwarte dood. Deze
komt nu niet meer voor maar in de middeleeuwen was er een hoge mortaliteit
erdoor. Dit is een obligaat pathogene kiem en obligaat symbiotisch. Het heeft een
gastheer nodig en verspreid via de vlooien en knaagdieren. Daarom at er hygiene
moet zijn. Kan in lymfeknopen vermenigvuldigen= builenpest.
Yersinia pseudotuberculosis is ook gram negatief, heeft meestal 2 dage om dezelfde
densiteit te bereiken dan andere e colis. Het groeit het best op 30 graden. Het is een
vrij kleine bacterie en heeft dus een moeilijkere groei dan de andere enterobacterien.
Het kan via muizen of knaagdieren ziekte veroorzaken bij vogels. Het kan ook naar de
mens overgedragen worden. Het is faculatatief intracellulair. Het is belangrijk om te
weten dat soms de cellulaire imuuniteit niet geneog is om deze kiem volledig weg te
krijgen uit cellen. Het zijn drager dieren die terug de kiem dus kunnen uitscheiden
( bv door stress).
- Pathogenese bij mens : kolonisatie in darm en lymfoid weefsle, via de mond
ingebracht in lichaam. Kan later leiden tot systemische verspreiding via de
bloedbaan —> shock. Vaak naar lever en milt, die dan vol gaan staan bij
necrose haarden is vaak ook bij vogels en cavias zo. Dit is een duidelijke
aanwijzing dat het over deze bacterie gaat.
- Symptomen en letsels. Na de verspreiding in de bloedbaan kan er een
chronsiche en endotocine shock vorm/acute vorm ( alleen als de kiem in hoge
concentraties aanwezig is) voorkomen. De chronische vorm is vaak dat de
dieren dik zitten, een sterke vergrtoign van lever en milt, ogen dicht.
Yersinia enterocolitica : een species dat Heel heterogeen is, er bestaan verschillende
serotypes. Wat kan gebueren is en soort koliek, diarree probleem bij de mens met
ook lymfeknopen die sterk zijn aangetast ( ook weer door
het facultatief intracellualir aanwezig blijven van de kiem).
Yersinia ruckeri = eentje die bij koudbloeddieren
voorkomen. Zal puntbloedingen zien in inwendige organen.
Escherichia coli ( zie pg 17 deel uit cursus)
Proteus
Kan ziekte veroorzaken maar kan ook interfereren met de diagnostiek. Het is een
kiem die heel beweeglijk is door peritrische flagellen. Het is een sterk uitzwermende
kiem op vasta agarbodoms/voedingsbodems. Het gaat heel de agarbodem op 1 nacht
3
BACTERIOLOGIE
ZELFSTUDIE Yasmina Jongbloet 3de bachelor 2023-2024
1. TAXONOMIE
Taxonomie is het indelen van bacterien in taxa. Hier worden er namen toegekend aan
de verschillende bacterien. Het gaat over de classificatie van bacterien en hoe ga je
1
,een naam toe kenne aan een bepaalde groep van bacterien. Maar natuurlijk is de ID
ook belangrijk. Als we een bacteie isoleren uit een dier hoe gaan we bepalen tot
welke TAXA deze behoort.
Basis taxonomische eenheid is het species. Vb: Escherichia coli. Een species is een
verzameling van allemaal evrschillende stammen en deze stammen hebben allemaal
hel veel gemeenschappelijke eigenschappen. Een stam =reincultuur van 1 isolaat, pe
species is er telkens 1 referentiestam. Dit is zo omdat de referentiestammen
opgeslagen worden in internationale bacterie collecties en het dient als een soort
vergelijkingstam —> indeling.
Nomenclatuur : we hebben verschillende indelingen
- Fylum : hoofdtaxa, heel veel taxa. Kan behoren tot verschillende klasses.
- Klasse
- Orde
- Familie
- Genus: binnen een genus zijn er subspecies en andere terminologien om
species nog verder onder te verdelen.
Serotypes : varianten van een bepaald species die andere
eigenschappen hebben van de celwand zodanig dat als er een dier
geinfecteerd word, het dier antilichamen produceert tegen een bepaald
serotype?
Biotypes
Genotypes
Faagtypes
Ecotypes
Pathotypes
- Species
- Subspecies
Fylogenie : verwantschaps onderzoek, hoe dichter bepaalde kiemen bij elkaar op zo
een boom liggen hoe meer verwant deze kiemen zijn. Methodes die heirgebruikt
worden :
- Polyfasische benadering:
kijken naar geno en
fenotype.
- Genoomsequenties
- 16S of 23S rRNA genen.
- Huishoudgenen
PROTEOBACTERIA : ANAEROOB
EN -
2
, 2. ENTEROBACTERIACEAE
Yersinia
Yersinia is een belangrijk genus in de DGK en twee species die we zullen berspreken
yersinia pseudotuberculosis en enterocolitica. Het zijn faculatities anaeroben en
kleine staafjes. Ze groeien iets trager op de klassieke voedingsbodems. We zien rode
staafjes met een negatieve gram kleuring.
Yersinia pestis was bealngrijk, of soms nog, het noemt ook wel de zwarte dood. Deze
komt nu niet meer voor maar in de middeleeuwen was er een hoge mortaliteit
erdoor. Dit is een obligaat pathogene kiem en obligaat symbiotisch. Het heeft een
gastheer nodig en verspreid via de vlooien en knaagdieren. Daarom at er hygiene
moet zijn. Kan in lymfeknopen vermenigvuldigen= builenpest.
Yersinia pseudotuberculosis is ook gram negatief, heeft meestal 2 dage om dezelfde
densiteit te bereiken dan andere e colis. Het groeit het best op 30 graden. Het is een
vrij kleine bacterie en heeft dus een moeilijkere groei dan de andere enterobacterien.
Het kan via muizen of knaagdieren ziekte veroorzaken bij vogels. Het kan ook naar de
mens overgedragen worden. Het is faculatatief intracellulair. Het is belangrijk om te
weten dat soms de cellulaire imuuniteit niet geneog is om deze kiem volledig weg te
krijgen uit cellen. Het zijn drager dieren die terug de kiem dus kunnen uitscheiden
( bv door stress).
- Pathogenese bij mens : kolonisatie in darm en lymfoid weefsle, via de mond
ingebracht in lichaam. Kan later leiden tot systemische verspreiding via de
bloedbaan —> shock. Vaak naar lever en milt, die dan vol gaan staan bij
necrose haarden is vaak ook bij vogels en cavias zo. Dit is een duidelijke
aanwijzing dat het over deze bacterie gaat.
- Symptomen en letsels. Na de verspreiding in de bloedbaan kan er een
chronsiche en endotocine shock vorm/acute vorm ( alleen als de kiem in hoge
concentraties aanwezig is) voorkomen. De chronische vorm is vaak dat de
dieren dik zitten, een sterke vergrtoign van lever en milt, ogen dicht.
Yersinia enterocolitica : een species dat Heel heterogeen is, er bestaan verschillende
serotypes. Wat kan gebueren is en soort koliek, diarree probleem bij de mens met
ook lymfeknopen die sterk zijn aangetast ( ook weer door
het facultatief intracellualir aanwezig blijven van de kiem).
Yersinia ruckeri = eentje die bij koudbloeddieren
voorkomen. Zal puntbloedingen zien in inwendige organen.
Escherichia coli ( zie pg 17 deel uit cursus)
Proteus
Kan ziekte veroorzaken maar kan ook interfereren met de diagnostiek. Het is een
kiem die heel beweeglijk is door peritrische flagellen. Het is een sterk uitzwermende
kiem op vasta agarbodoms/voedingsbodems. Het gaat heel de agarbodem op 1 nacht
3
