1. Biomoleculen
De belangrijkste klassen
1. Koolhydraten (suikers)
2. Lipiden (vetten) vetzuren en glycerol
3. Proteïnen (eiwitten) aminozuren en peptiden
4. Nucleïnezuren (DNA en RNA) nucleotiden (ATP) en basen
Zelfde bouwstenen, zelfde bindingen
Variaties in de details; heel veel soorten
Opgelost in waterig milieu Water is het meest voorkomend biomolecule in ons lichaam
(70% van de lichaamsmassa & 99% van alle moleculen)
Concentratie is 50 mol/liter
• Meeste biomoleculen interageren met water (sterk of zwak)
• Sterk; oplossen in water
• Zwak; bijeendrijven weg van water vetdruppels & biologische membranen
1. Koolhydraten
• Bouwstenen: monosachariden
• Bindingen: glycosidebindingen (=> disachariden, oligosachariden, polysachariden)
• Belang stereochemie
o Kan verschillende naam hebben indien in een andere conformatie, maar
evenveel atomen
• Niet gecodeerd in het genoom (wel de enzymen die de suikers aanmaken)
• Polymeren geen unieke grootte, dus molecuulmassa variabel getal
o Glycogeen of zetmeel
o Niet altijd exact evenveel glucose aanwezig bv
• Meest abundante biomoleculen op Aarde
o Cellulose (celwand) en chitine skelet
• Belang: voeding, metabolisme, biomedische toepassingen
Cardiovasculaire ziekten, aantasten tandglazuur
O H H O
C C H O H O H O
C C C
HO C HH C OH HO C H H C OH H C OH
HOCH2 H2COH HO C H HO C H HO C H
L-isomeer D-isomeer
H O H O H C OH H C OH HO C H
C C
H C OH H C OH H C OH
OH C H H C OH
H2COH H2COH H2COH
HOCH2 H2COH Emil Fischer
glyceraldehyde (1852-1919) D-mannose D-glucose D-galactose
L en D isomeer want rotaties rond de koolstoffen + andere namen want anders
gemetaboliseerd Fischer projectie
1
, CH2OH
O HOCH2
Sucrose O
glucose fructose OH HO
alfa-1 ® 2 O
Disachariden; belang in voeding en spijsvertering HO CH2OH
• Sucroseverbruik: relatie met caries en diabetes/obesitas OH HO
• Suiker in onze voeding CH2OH CH2OH
Lactose
HO O O OH
• Suiker in moedermelk en koemelk galactose glucose OH O OH
• Uitvinding van zoogdieren bèta-1 ® 4
OH OH
• Alfa 1-4 binding CH2OH CH2OH
• Afbraakproduct; spijsvertering van zetmeel O OH
O
• Bierproductie (mouten) Maltose
OH OH
glucose glucose
alfa-1 ® 4 O
HO
Oligosachariden: belang voor structuur van membranen OH
OH
Koolhydraten verbonden aan elkaar Siaalzuur Siaalzuur Siaalzuur
• Glycolipiden; membranen (bedekking en Galactose Galactose Galactose
structuur) GlcNAc GlcNAc GlcNAc
• Glycoproteïnen; suikerstruiken op de eiwitten Mannose Mannose
Mannose
o O (ser en thr) of N linked (asp, Fucose GlcNAc
celmembraan transport) Galactose GlcNAc Fucose
N
GalNAc Siaalzuur
Zeer veel mogelijkheden C O
O
1° soorten bouwstenen CH2
serine- CH
2° soorten glycosidebinding residu
2
asparagine-
residu
CH2 polypeptideketen
van glycoproteïne
Ingewikkelde informatica + belangrijk voor cel-cel interacties
Polysachariden
100 tot 1000 in een keten
Belangrijkste structuur polymeer in planten
- Celwanden
OH CH2OH OH
- Houtvezels CH2OH HO
O O HO O O O
Cellulose; glucose molecule met beta O O
O O
1-4 en waterstofbrug = stevig HO OH CH2OH HO OH CH2OH
glucose glucose cellulose
bèta-1 ® 4
GlcNac GlcNac chitine
N-acetyl CH2OH N-acetyl
Belangrijkste structuur polymeer in CH2OH
HO O O HO O
O O
ongewervelde dieren O O O
O
- Insecten (exoskelet) HO N-acetyl CH2OH HO N-acetyl CH2OH
- Schaaldier (pantser)
Chitine; N-acetylglycosamine
2
, glucosamineglycanen
• Bouwstenen afgeleiden van reguliere suikers (carboxylgroepen, amino groepen,
sulfaatgroepen)
• Sterk polair, negatieve ladingen
o => binden veel water (geladen)
o Meer waterige mengsels
• Repeterende disaccharide-eenheid, zeer lange strengen
• Sommige zijn covalent verbonden aan eiwit => proteoglycanen
• Functies in de extracellulaire ruimte (bindweefsel, bloedbaan, kraakbeen, gewrichten)
Belangrijkste structuurpolymeer in bèta-
CH2OH CH2OH CH2OH
• Glasachtig lichaam (oog) O COO-
HO O
1 4
O COO-
HO O
O COO -
HO O
• Navelstreng
O bèta- O O
O CHN-
2OH CH2OH
N- CH2OH
HO O 1 4 O
HO O HOO N-
bèta- acetyl O
acetyl
• Gewrichtsvloeistof (smerend acetyl
COO - -
HOO OHO O
HO COOOH O
HO COO- OH
1 3 O O
glucuronzuur O N-
N-acetylglucosamine Hyaluronzuur
O N- O N-
effect) HO OH
bèta- acetyl
HO OH
acetyl
HO acetyl
1 3
S
OH S
glucuronzuur S alfa-1 4
N-acetylglucosamine COO- Hyaluronzuur
CH2 COO- CH2
COO- CH2 O O O O
O O O O O O
S
O
S
O
S alfa-1 4
COO- CH2 COO- CH2
CH2 N
Belangrijkste structuurpolymeer HO
COO-
S O HO O N O HO O S O HO O NO HO
O SO HOO O
S
S
O
S
bloedvaatwand (bekleding) alfa-1 4
glucuronzuur- N
glucosamine- HO N HO
S HO N
HO
S HO S
Heparine
HO
S
• Natuurlijke antistolling 2-O-sulfaat S
2,6-disulfaat
alfa-1 4
S
• Medische toepassing antistolling
glucuronzuur- glucosamine-
2-O-sulfaat 2,6-disulfaat Heparine
Energieopslag
glucose alfa- glucose
1® 4 CH OH CH2OH
CH2OH CH2OH 2
O
O O O glucose
O O O O
OH OH OH alfa-1®6
HO OH HO HO HO O
glucose
CH2OH CH2OH CH2
CH2OH CH2OH O O O
O O O O
O O O O
OH OH OH
OH OH HO HO HO
HO HO
zetmeel
Zetmeel
• Onvertakt = amylose
• Vertakt = amylopectine
D-glucose polymeer, belangrijkste energiereserve in planten (knollen, zaden)
Glycogeen
Functioneel in belangrijke (mineur) energiereserve in lever en spieren
Vertakt
in centrum een klein eiwit = glycogenine
dextranen
Energiereserve en “schuilhol” van bacterien in mondholte spelen rol in ontstaan van
tandplaque en tandsteen
3
, 2. Lipiden
• Bouwstenen: vetzuren + alkoholdrager (glycerol, cholesterol)
• Bindingen: ester en etherbindingen
• Chemisch zeer divers; maar altijd hydrofoob effect
o Samenklitten en afstoten van water
• Niet gecodeerd in het genoom (wel de enzymen die de lipiden aanmaken)
• Belang: voeding, metabolisme, membranen, biomedische toepassingen
Energie + atherosclerose + gezonde en minder gezonde vetten
Vetzuren
• Lengte: even aantal C-atomen (verklaring: mechanisme van synthese); onvertakte
koolwaterstofstaarten
• Bindingen:
o Alleen enkelvoudige C-C bindingen (=> verzadigde vetzuren)
o Ook cis- C=C bindingen (=> onverzadigde vetzuren)
• Mens of dier
• Transvetten: ongezond en bijdrage aan slagaderwandverkalking
• Vrije vetzuren zijn belangrijke metabolieten
• Vetzuren veresteren aan een alkoholgroep (stockage) lipiden
• Indien 3VZ staarten triglyceriden
4
De belangrijkste klassen
1. Koolhydraten (suikers)
2. Lipiden (vetten) vetzuren en glycerol
3. Proteïnen (eiwitten) aminozuren en peptiden
4. Nucleïnezuren (DNA en RNA) nucleotiden (ATP) en basen
Zelfde bouwstenen, zelfde bindingen
Variaties in de details; heel veel soorten
Opgelost in waterig milieu Water is het meest voorkomend biomolecule in ons lichaam
(70% van de lichaamsmassa & 99% van alle moleculen)
Concentratie is 50 mol/liter
• Meeste biomoleculen interageren met water (sterk of zwak)
• Sterk; oplossen in water
• Zwak; bijeendrijven weg van water vetdruppels & biologische membranen
1. Koolhydraten
• Bouwstenen: monosachariden
• Bindingen: glycosidebindingen (=> disachariden, oligosachariden, polysachariden)
• Belang stereochemie
o Kan verschillende naam hebben indien in een andere conformatie, maar
evenveel atomen
• Niet gecodeerd in het genoom (wel de enzymen die de suikers aanmaken)
• Polymeren geen unieke grootte, dus molecuulmassa variabel getal
o Glycogeen of zetmeel
o Niet altijd exact evenveel glucose aanwezig bv
• Meest abundante biomoleculen op Aarde
o Cellulose (celwand) en chitine skelet
• Belang: voeding, metabolisme, biomedische toepassingen
Cardiovasculaire ziekten, aantasten tandglazuur
O H H O
C C H O H O H O
C C C
HO C HH C OH HO C H H C OH H C OH
HOCH2 H2COH HO C H HO C H HO C H
L-isomeer D-isomeer
H O H O H C OH H C OH HO C H
C C
H C OH H C OH H C OH
OH C H H C OH
H2COH H2COH H2COH
HOCH2 H2COH Emil Fischer
glyceraldehyde (1852-1919) D-mannose D-glucose D-galactose
L en D isomeer want rotaties rond de koolstoffen + andere namen want anders
gemetaboliseerd Fischer projectie
1
, CH2OH
O HOCH2
Sucrose O
glucose fructose OH HO
alfa-1 ® 2 O
Disachariden; belang in voeding en spijsvertering HO CH2OH
• Sucroseverbruik: relatie met caries en diabetes/obesitas OH HO
• Suiker in onze voeding CH2OH CH2OH
Lactose
HO O O OH
• Suiker in moedermelk en koemelk galactose glucose OH O OH
• Uitvinding van zoogdieren bèta-1 ® 4
OH OH
• Alfa 1-4 binding CH2OH CH2OH
• Afbraakproduct; spijsvertering van zetmeel O OH
O
• Bierproductie (mouten) Maltose
OH OH
glucose glucose
alfa-1 ® 4 O
HO
Oligosachariden: belang voor structuur van membranen OH
OH
Koolhydraten verbonden aan elkaar Siaalzuur Siaalzuur Siaalzuur
• Glycolipiden; membranen (bedekking en Galactose Galactose Galactose
structuur) GlcNAc GlcNAc GlcNAc
• Glycoproteïnen; suikerstruiken op de eiwitten Mannose Mannose
Mannose
o O (ser en thr) of N linked (asp, Fucose GlcNAc
celmembraan transport) Galactose GlcNAc Fucose
N
GalNAc Siaalzuur
Zeer veel mogelijkheden C O
O
1° soorten bouwstenen CH2
serine- CH
2° soorten glycosidebinding residu
2
asparagine-
residu
CH2 polypeptideketen
van glycoproteïne
Ingewikkelde informatica + belangrijk voor cel-cel interacties
Polysachariden
100 tot 1000 in een keten
Belangrijkste structuur polymeer in planten
- Celwanden
OH CH2OH OH
- Houtvezels CH2OH HO
O O HO O O O
Cellulose; glucose molecule met beta O O
O O
1-4 en waterstofbrug = stevig HO OH CH2OH HO OH CH2OH
glucose glucose cellulose
bèta-1 ® 4
GlcNac GlcNac chitine
N-acetyl CH2OH N-acetyl
Belangrijkste structuur polymeer in CH2OH
HO O O HO O
O O
ongewervelde dieren O O O
O
- Insecten (exoskelet) HO N-acetyl CH2OH HO N-acetyl CH2OH
- Schaaldier (pantser)
Chitine; N-acetylglycosamine
2
, glucosamineglycanen
• Bouwstenen afgeleiden van reguliere suikers (carboxylgroepen, amino groepen,
sulfaatgroepen)
• Sterk polair, negatieve ladingen
o => binden veel water (geladen)
o Meer waterige mengsels
• Repeterende disaccharide-eenheid, zeer lange strengen
• Sommige zijn covalent verbonden aan eiwit => proteoglycanen
• Functies in de extracellulaire ruimte (bindweefsel, bloedbaan, kraakbeen, gewrichten)
Belangrijkste structuurpolymeer in bèta-
CH2OH CH2OH CH2OH
• Glasachtig lichaam (oog) O COO-
HO O
1 4
O COO-
HO O
O COO -
HO O
• Navelstreng
O bèta- O O
O CHN-
2OH CH2OH
N- CH2OH
HO O 1 4 O
HO O HOO N-
bèta- acetyl O
acetyl
• Gewrichtsvloeistof (smerend acetyl
COO - -
HOO OHO O
HO COOOH O
HO COO- OH
1 3 O O
glucuronzuur O N-
N-acetylglucosamine Hyaluronzuur
O N- O N-
effect) HO OH
bèta- acetyl
HO OH
acetyl
HO acetyl
1 3
S
OH S
glucuronzuur S alfa-1 4
N-acetylglucosamine COO- Hyaluronzuur
CH2 COO- CH2
COO- CH2 O O O O
O O O O O O
S
O
S
O
S alfa-1 4
COO- CH2 COO- CH2
CH2 N
Belangrijkste structuurpolymeer HO
COO-
S O HO O N O HO O S O HO O NO HO
O SO HOO O
S
S
O
S
bloedvaatwand (bekleding) alfa-1 4
glucuronzuur- N
glucosamine- HO N HO
S HO N
HO
S HO S
Heparine
HO
S
• Natuurlijke antistolling 2-O-sulfaat S
2,6-disulfaat
alfa-1 4
S
• Medische toepassing antistolling
glucuronzuur- glucosamine-
2-O-sulfaat 2,6-disulfaat Heparine
Energieopslag
glucose alfa- glucose
1® 4 CH OH CH2OH
CH2OH CH2OH 2
O
O O O glucose
O O O O
OH OH OH alfa-1®6
HO OH HO HO HO O
glucose
CH2OH CH2OH CH2
CH2OH CH2OH O O O
O O O O
O O O O
OH OH OH
OH OH HO HO HO
HO HO
zetmeel
Zetmeel
• Onvertakt = amylose
• Vertakt = amylopectine
D-glucose polymeer, belangrijkste energiereserve in planten (knollen, zaden)
Glycogeen
Functioneel in belangrijke (mineur) energiereserve in lever en spieren
Vertakt
in centrum een klein eiwit = glycogenine
dextranen
Energiereserve en “schuilhol” van bacterien in mondholte spelen rol in ontstaan van
tandplaque en tandsteen
3
, 2. Lipiden
• Bouwstenen: vetzuren + alkoholdrager (glycerol, cholesterol)
• Bindingen: ester en etherbindingen
• Chemisch zeer divers; maar altijd hydrofoob effect
o Samenklitten en afstoten van water
• Niet gecodeerd in het genoom (wel de enzymen die de lipiden aanmaken)
• Belang: voeding, metabolisme, membranen, biomedische toepassingen
Energie + atherosclerose + gezonde en minder gezonde vetten
Vetzuren
• Lengte: even aantal C-atomen (verklaring: mechanisme van synthese); onvertakte
koolwaterstofstaarten
• Bindingen:
o Alleen enkelvoudige C-C bindingen (=> verzadigde vetzuren)
o Ook cis- C=C bindingen (=> onverzadigde vetzuren)
• Mens of dier
• Transvetten: ongezond en bijdrage aan slagaderwandverkalking
• Vrije vetzuren zijn belangrijke metabolieten
• Vetzuren veresteren aan een alkoholgroep (stockage) lipiden
• Indien 3VZ staarten triglyceriden
4