Samenvatting Biochemie van de huisdieren II (prof. Knapen) (H10-24)

Biochemie van de huisdieren I
Inleiding
1. Biochemische reacties
 BIO – chemie
leven  reproductie + uitvoeren chemische reacties
 A B
 A B+C
- Bv. sucrose CO2 + H2O
- Eigenlijk staat de pijl hier voor meerdere tussenstapjes, het is dus een
veralgemeende vergelijking
- Het proces gebeurt niet spontaan (in vitro), maar cellulair (in vivo) wel
- In de cel zijn enzymen die de reactie laten doorgaan
 A B C D E
intermedaire biomoleculen




2. Enzymen




 Enzymen zijn eiwitten
 Ze katalyseren biochemische reacties
- Komen zelf ongewijzigd uit het proces
- Verhogen de snelheid van een reactie
- Beïnvloeden het chemisch evenwicht niet
 Eenvoudige reactie:
E = enzym
S = substraat
P = product




Emily Janssens Biochemie van de huisdieren II 1

,3. Pathways



 Pathway = aaneenschakeling van biochemische processen/reacties
 Synoniemen:
- Pathway
- Metabole route
- Metabole baan
- Biochemische pathway
- Metabole pathway
 Letters: stellen metabole intermediairen/ metabolieten voor
cijfers: stellen enzymen voor
 Wat moet je kennen van pathways?
- Namen van de metabole intermediairen/metabolieten
- Namen van de enzymen
- Context
- Eventueel structuren (zie lijstje op BB)
 Pathways zijn vaak vertakt
- Regulatie is belangrijk en naar gelang wat de cel nodig heeft
- De regulatie is vaak weefselspecifiek




Emily Janssens Biochemie van de huisdieren II 2

,4. Classificatie van pathways
 Anabool = biosynthese processen
- eenvoudig  complex
- kost energie
 katabool = afbraakprocessen
- complex  eenvoudig
- energie produceren
 anabool en katabool zijn beide metabool




 Er zijn 7 soorten pathways (in het energiemetabolisme)

katabolisme anabolisme
koolhydraten Glycolyse Gluconeogenese
Vetten (lipiden) Vetzuuroxidatie Vetzuursynthese
Aminozuren (eiwitten) Ureumcyclus aminozuursynthese
+ CITROENZUURCYCLUS = combinatie van alle vorige
 Andere soorten pathways:
- Hormonen
- Neurotransmitters
- Zintuigen
- Celdeling en groei
- Embryonale ontwikkeling
- …




Emily Janssens Biochemie van de huisdieren II 3

,Enzymen
1. Inleiding
 Sucrose  CO2 + H2O
Geen spontane afbraak
lipiden  CO2 + H2O
 In vitro oxidatie van vetten gaat enkel in extreme situatie:
- Extreme pH
- Hoge temperatuur
- Corrosieve chemicaliën
 In vivo oxidatie van vetten:
- Snel
- Binnen nauw pH-bereik
- Binnen nauw temperatuurbereik
- Gecontroleerd!
 Sommige enzymen functioneren als eenvoudig eiwit
 Andere enzymen hebben een bijkomende chemische component nodig
= Cofactor = bijkomend element dat soms nodig is om reactie te laten doorgaan
= bijkomend mechanisme voor controle van de reactie
 Apo-enzym = enzym + substraat
Holo-enzym = enzym + substraat + cofactor
 apo-enzym + cofactor = holo-enzym
 Soorten cofactoren
1) Metaalion
2) Co-enzym
- Grote organische structuur
- Vaak vitaminederivaten
3) Prosthetische groep
- Grote organische structuur
- Permanent covalent (sterk) gebonden aan eiwit
 Naamgeving enzymen
- Vaak het suffix –ase
- Woord of woorden die de activiteit beschrijven
- Naar de ontdekkers
- Grieks of Latijn

2. Werkingsmechanisme van enzymen




= katalytische site
= plaats waarom substraat bindt




 Enzymen zijn katalysatoren
- Verhogen de snelheid van de reactie
- Beïnvloeden het chemisch evenwicht niet


Emily Janssens Biochemie van de huisdieren II 4

,  Reacties beschrijven in termen van vrije energie (G)




 Standaard vrije energie:
- In de chemie
 ΔG°
 Temperatuur 298K
 Partiële gasdruk van de gassen 1 atm
 Concentratie opgeloste stoffen 1M
- In de biochemie
 ΔG’°
 Temperatuur 298K
 Partiële gasdruk van de gassen 1 atm
 Concentratie opgeloste stoffen 1M
 [H+] = 10-7 M  pH 7
 Activatie-energie moet overwonnen worden om S  P




 Enzymen verlagen de activatie-energie




Emily Janssens Biochemie van de huisdieren II 5