Bacteriofagen
Inleiding
Bacteriofagen
-virussen die bacteriën infecteren
-rol in: horizontale genenoverdracht tussen bacteriën
-zorgen ervoor dat:
gastheren nieuwe eigenschappen verwerven
hele bacteriële populatie verzwakt/vernietigd wordt
-zijn zeer klein + opgebouwd uit:
eiwitmantel/capside
nucleïnezuur: DNA of RNA (-> nooit tesamen voor in 1 virus)
=de basis voor indeling van fagen
-kunnen lytische of lysogene cyclys volgen
Lytische cyclus
-massale productie + vrijkomen van nieuwe fagen -> dood van de gastheercel
-virussen die deze cyclus volgen = virulent
Lysogene cyclus
-NIET in onmiddellijke reproductie + celdood
-WEL integratie v/h faag-genoom i/h bacteriële chromosoom
-profaag = geïntegreerde faag-genoom
kan doorgegeven worden aan alle dochtercellen v/d gastheerbacterie
op een bepaald moment: profaag ‘wakker schieten’
WEL nieuwe fagen aangemaakt= inductie
Door: UV-straling/hitte-shock/…
-lysogene bacterie = bacterie die een profaag draagt
verwerven vaak nieuw genen + eigenschappen = lysogene convertie
-gematigde fagen = fagen die een lysogene cyclus volgen
, Virulente dsDNA-fagen
-bekendste voorbeeld: T-even fagen (van E.coli)
-volgen altijd de lytische cyclus
One-step-growth-experiment
-onderzoek naar de reproductie van fagen
-hoe?
bacteriën + fagen mengen -> fagen hadden tijd om zich vast te hechten aan een bacterie
(tijdens incubatie) => elke faag: infecteert 1 bacterie
mengsel verdunnen: voorkomen dat vrijgekomen dochtercellen -> nieuwe bacteriën zouden
infecteren + binnendringen
op geregelde tijdstippen: staal afnemen + aantal bacteriofagen tellen
-resultaten/conclusie
reproductie van fagen: stapsgewijs
1) Latente fase: geen fagen aanwezig i/h milieu -> zitten allemaal in hun bacteriële
gastheercel
2) Stijgende fase: exponentiële toename v/h aantal vrije fagen -> gastheercellen
barsten open + dochterfagen komen massaal vrij
3) Plateau-fase
4) Afstervingsfase
rode curve: aantal extracellulaire/vrije fagen
blauwe curve: intracellulair
In de latente fase: een eclips fase onderscheiden
Alle fagen verdwenen -> zitten allemaal in hun gastheerbacterie + zijn
ontmanteld => geen volledige fagen terug te vinden
2de helft van latente fase: terug volledige fagen in cytoplasma v/d bacterie
burst size: dochtervirussen aantonen
-Levenscyclus v/d T-even faag
1. Adsorptie
Faag aan een specifieke gastheerreceptor
Gastheerreceptor= molecule dat aanwezig MOET zijn
op bacteriële celwand -> anders kan het virus niet
vinden + is de bacterie ongevoelig voor infectie
Receptoren= eiwitten / koolhydraten / vetten
2. Binnendringen
Doorheen bacteriële celwand
Faag injecteert zijn DNA in het cytoplasma v/d
bacterie -> capside blijft meestal aan buitenzijde
3. Transcriptie van virale DNA
Inleiding
Bacteriofagen
-virussen die bacteriën infecteren
-rol in: horizontale genenoverdracht tussen bacteriën
-zorgen ervoor dat:
gastheren nieuwe eigenschappen verwerven
hele bacteriële populatie verzwakt/vernietigd wordt
-zijn zeer klein + opgebouwd uit:
eiwitmantel/capside
nucleïnezuur: DNA of RNA (-> nooit tesamen voor in 1 virus)
=de basis voor indeling van fagen
-kunnen lytische of lysogene cyclys volgen
Lytische cyclus
-massale productie + vrijkomen van nieuwe fagen -> dood van de gastheercel
-virussen die deze cyclus volgen = virulent
Lysogene cyclus
-NIET in onmiddellijke reproductie + celdood
-WEL integratie v/h faag-genoom i/h bacteriële chromosoom
-profaag = geïntegreerde faag-genoom
kan doorgegeven worden aan alle dochtercellen v/d gastheerbacterie
op een bepaald moment: profaag ‘wakker schieten’
WEL nieuwe fagen aangemaakt= inductie
Door: UV-straling/hitte-shock/…
-lysogene bacterie = bacterie die een profaag draagt
verwerven vaak nieuw genen + eigenschappen = lysogene convertie
-gematigde fagen = fagen die een lysogene cyclus volgen
, Virulente dsDNA-fagen
-bekendste voorbeeld: T-even fagen (van E.coli)
-volgen altijd de lytische cyclus
One-step-growth-experiment
-onderzoek naar de reproductie van fagen
-hoe?
bacteriën + fagen mengen -> fagen hadden tijd om zich vast te hechten aan een bacterie
(tijdens incubatie) => elke faag: infecteert 1 bacterie
mengsel verdunnen: voorkomen dat vrijgekomen dochtercellen -> nieuwe bacteriën zouden
infecteren + binnendringen
op geregelde tijdstippen: staal afnemen + aantal bacteriofagen tellen
-resultaten/conclusie
reproductie van fagen: stapsgewijs
1) Latente fase: geen fagen aanwezig i/h milieu -> zitten allemaal in hun bacteriële
gastheercel
2) Stijgende fase: exponentiële toename v/h aantal vrije fagen -> gastheercellen
barsten open + dochterfagen komen massaal vrij
3) Plateau-fase
4) Afstervingsfase
rode curve: aantal extracellulaire/vrije fagen
blauwe curve: intracellulair
In de latente fase: een eclips fase onderscheiden
Alle fagen verdwenen -> zitten allemaal in hun gastheerbacterie + zijn
ontmanteld => geen volledige fagen terug te vinden
2de helft van latente fase: terug volledige fagen in cytoplasma v/d bacterie
burst size: dochtervirussen aantonen
-Levenscyclus v/d T-even faag
1. Adsorptie
Faag aan een specifieke gastheerreceptor
Gastheerreceptor= molecule dat aanwezig MOET zijn
op bacteriële celwand -> anders kan het virus niet
vinden + is de bacterie ongevoelig voor infectie
Receptoren= eiwitten / koolhydraten / vetten
2. Binnendringen
Doorheen bacteriële celwand
Faag injecteert zijn DNA in het cytoplasma v/d
bacterie -> capside blijft meestal aan buitenzijde
3. Transcriptie van virale DNA
