Microbiologie en infectieziekten
HF1 : introductie tot klinische microbiologie
Medische microbiologie bestudeert:
o Bacterien
o Virussen
o Parasiet
o Schimmel
Eukaryote vs prokaryote cel
o Eukaryote cel (menselijk)
Celkern met DNA
Organellen
Ribosomen
o Prokaryote cel (bacterie)
Geen celkern
DNA vrij
Geen organellen
Wel ribosomen (doel van antibiotica)
Menselijk microbioom = gemeenschap van micro-organismen
o Dysbiose = verstoorde bacteriebalans
Ziekteverwekkend vermogen bacterie
o Obligate pathogenen (ALTIJD ziekte)
o Opportunistische pathogen (ziekte indien
immuungecompromitteerd)
o Niet-pathogene bacterien (meestal onschadelijk)
Fagocytose bij bacterie infectie
o Herkenning (binding via receptoren)
o Opname (vorming fagosoom)
o Afbraak (fagosoom fuseert met lysosoom)
o Overlevingsstrategie van bacterie
Intracellulair leven (in fagocyt leven)
Antigenetische variatie (verandering in antigenen)
Immunomodulatie (producten die immuunrespons
moduleren)
Toxines
o Endotoxinen (vrij gegeven door LPS van gram negatieve
bacterien)
o Exotoxinen (door eiwitten van bacterien)
Diagnose van infecties
o Klinisch onderzoek (anamnese en lichamelijk)
o Empirische behandeling (op basis van meest wss
ziekteverwekker)
1
, o Diagnostische tests
o Gerichte therapie
o Antibiotic stewardship (gericht antibiotica gebruik)
Diagnostisch stewardship (gericht testen)
Infectieverloop in 3 fasen:
o Kolonisatie en incubatie
o Symptomatische fase
o Herstelfase
Antimicrobiele resistentie (AMR)
o Ontstaan door spontane mutaties
o Antibiotica gebruikt selecteert resistentie bacterien
o Verspreiding via horizontale genoverdracht:
Conjugatie (via pilus)
Transformatie (vrij DNA uit omgeving opnemen)
Transductie (bacteriofaag)
Bacteriële biofilm = beschermende extracellulaire polymere matrix
Endogene vs exogene pathogenen
o Endogene pathogeen (afkomstig uit eigen flora)
o Exogene pathogenen (afkomstig uit externe bronnen)
Mensen
Directe overdracht
o Fysiek contact
o Druppelinfectie
Indirect contact
o Fomieten (bv deurklink)
o Aerosolen
Dieren
Voedselgerelateerd
Direct contact
Luchtgedragen
Omgeving
Vectoren
Lichaamsluizen
Teken
Vlooien
SIR-model
o 3 groepen
S: vatbaar
I: besmet
R: hersteld
o Belangrijke parameters
Beta = transmissiesnelheid (snelheid van verspreiding)
2
, Gamma = herstelsnelheid
Verschillende niveau’s van ziekteverspreiding
o Uitbraak (plotselinge, lokale toename)
o Epidemie (snelle verspreiding)
o Pandemie (wereldwijde verspreiding)
o Endemie (cte aanwezigheid van ziekte)
One health = gezondheid van mensen, dieren en milieu is
onlosmakelijk verbonden (probleem in ene domein beinvloed het
andere domein)
Proces bacteriele infectie:
o Kolonisatie en binnendringen
Luchtwegen
Maag-darm kanaal
Huidwonden
o Hechtingsmechanismen
Fimbriae en pili
Adhesin
Capsules
o Verspreiding en immuunontwijking
Intracellulair leven
Barriere afbraak
Ontstekingen bij infectie
o Lokale ontsteking (vasodilatie roodheid, warmte, zwelling,
pijn)
o Systemische reactie
Cytokinen koorts
Leukocytose (toename WBC)
Immunoglobuline A (IgA)
o Beschermt slijmvliezen (bindt bacterie en neutraliseert)
o Sommige bacterien produceren IgA proteasen
HF2 : bacteriologie
Endosymbiose (prokaryoten opgenomen door cel)
o Genoverdracht naar celkern (endosymbionten evolueerden
naar organellen)
Celwand samenstelling
o Peptidoglycaan (polymeer van suikers)
Synthese:
Precursor in cytoplasma
Flippase
Inbouw in celwand
PBP = penicilline bindende eiwitten
3
HF1 : introductie tot klinische microbiologie
Medische microbiologie bestudeert:
o Bacterien
o Virussen
o Parasiet
o Schimmel
Eukaryote vs prokaryote cel
o Eukaryote cel (menselijk)
Celkern met DNA
Organellen
Ribosomen
o Prokaryote cel (bacterie)
Geen celkern
DNA vrij
Geen organellen
Wel ribosomen (doel van antibiotica)
Menselijk microbioom = gemeenschap van micro-organismen
o Dysbiose = verstoorde bacteriebalans
Ziekteverwekkend vermogen bacterie
o Obligate pathogenen (ALTIJD ziekte)
o Opportunistische pathogen (ziekte indien
immuungecompromitteerd)
o Niet-pathogene bacterien (meestal onschadelijk)
Fagocytose bij bacterie infectie
o Herkenning (binding via receptoren)
o Opname (vorming fagosoom)
o Afbraak (fagosoom fuseert met lysosoom)
o Overlevingsstrategie van bacterie
Intracellulair leven (in fagocyt leven)
Antigenetische variatie (verandering in antigenen)
Immunomodulatie (producten die immuunrespons
moduleren)
Toxines
o Endotoxinen (vrij gegeven door LPS van gram negatieve
bacterien)
o Exotoxinen (door eiwitten van bacterien)
Diagnose van infecties
o Klinisch onderzoek (anamnese en lichamelijk)
o Empirische behandeling (op basis van meest wss
ziekteverwekker)
1
, o Diagnostische tests
o Gerichte therapie
o Antibiotic stewardship (gericht antibiotica gebruik)
Diagnostisch stewardship (gericht testen)
Infectieverloop in 3 fasen:
o Kolonisatie en incubatie
o Symptomatische fase
o Herstelfase
Antimicrobiele resistentie (AMR)
o Ontstaan door spontane mutaties
o Antibiotica gebruikt selecteert resistentie bacterien
o Verspreiding via horizontale genoverdracht:
Conjugatie (via pilus)
Transformatie (vrij DNA uit omgeving opnemen)
Transductie (bacteriofaag)
Bacteriële biofilm = beschermende extracellulaire polymere matrix
Endogene vs exogene pathogenen
o Endogene pathogeen (afkomstig uit eigen flora)
o Exogene pathogenen (afkomstig uit externe bronnen)
Mensen
Directe overdracht
o Fysiek contact
o Druppelinfectie
Indirect contact
o Fomieten (bv deurklink)
o Aerosolen
Dieren
Voedselgerelateerd
Direct contact
Luchtgedragen
Omgeving
Vectoren
Lichaamsluizen
Teken
Vlooien
SIR-model
o 3 groepen
S: vatbaar
I: besmet
R: hersteld
o Belangrijke parameters
Beta = transmissiesnelheid (snelheid van verspreiding)
2
, Gamma = herstelsnelheid
Verschillende niveau’s van ziekteverspreiding
o Uitbraak (plotselinge, lokale toename)
o Epidemie (snelle verspreiding)
o Pandemie (wereldwijde verspreiding)
o Endemie (cte aanwezigheid van ziekte)
One health = gezondheid van mensen, dieren en milieu is
onlosmakelijk verbonden (probleem in ene domein beinvloed het
andere domein)
Proces bacteriele infectie:
o Kolonisatie en binnendringen
Luchtwegen
Maag-darm kanaal
Huidwonden
o Hechtingsmechanismen
Fimbriae en pili
Adhesin
Capsules
o Verspreiding en immuunontwijking
Intracellulair leven
Barriere afbraak
Ontstekingen bij infectie
o Lokale ontsteking (vasodilatie roodheid, warmte, zwelling,
pijn)
o Systemische reactie
Cytokinen koorts
Leukocytose (toename WBC)
Immunoglobuline A (IgA)
o Beschermt slijmvliezen (bindt bacterie en neutraliseert)
o Sommige bacterien produceren IgA proteasen
HF2 : bacteriologie
Endosymbiose (prokaryoten opgenomen door cel)
o Genoverdracht naar celkern (endosymbionten evolueerden
naar organellen)
Celwand samenstelling
o Peptidoglycaan (polymeer van suikers)
Synthese:
Precursor in cytoplasma
Flippase
Inbouw in celwand
PBP = penicilline bindende eiwitten
3