VOLLEDIGE Samenvatting Moleculaire biologie: Transcriptie (1ste BMW, F. Claessens)

Transcriptie: Prokaryoten + Eukaryoten


Transcriptie bij Prokaryoten

Initiatie:
De startplaatsen (= PROMOTOR): zijn de plaatsen waar gestart wordt met de aanmaak
van RNA kopieën.
RNA polymerase bindt hieraan en zal naar rechts opschuiven


Consensus sequentie: Op bepaalde plaatsen is er een frequentie van basen die vaker
voorkomt.
-> Naarmate je verder gaat van de consensus, zal de promotor minder efficiënt worden
herkend door RNA polymerase




RNA polymerase kan zelf niet de promotor herkennen.
De Sigma Factor kan wel de sequentie herkennen.


De sigma factor bindt aan de promotor sequentie.
Daarna bindt de RNA polymerase eraan, vervolgens schuift die naar rechts op.




Terminatie:
Er zijn twee soorten signalen die de terminatie van transcriptie veroorzaken:
Eerste manier: Terminator loop
GC rijke haarspeld structuur in het RNA (Door zelf-complementariteit), die wordt gevolgd
door een aantal Uracils
Aan het einde van het gen: is er een sequentie die codeert voor een haarspeld.

, Het haarspeld zorgt voor een zwakke binding tussen RNA polymerase en DNA (Template).
Doordat het haarspeld gevolgd wordt door een aantal Uracils: is dit het signaal voor RNA
polymerase om de streng te verlaten.




Tweede manier: Eiwit Rho-factor
-​ Rho factor is een DNA-RNA helicase die bestaat uit 6 eenheden (Ring)
-​ Het schuift als een ring over het RNA in de 5’-3’ richting en zal het RNA polymerase
op een bepaald moment inhalen


-​ Als Rho factor de RNA polymerase bereikt heeft: zorgt dit voor een
conformatieverandering bij RNA poly.
-​ Hierdoor laat RNA polymerase los (Geen goede connectie meer tussen RNA
polymerase en DNA) en stopt de transcriptie