Meet the professor (B-B1MB05) – Suzan Ruijtenberg – Ontwikkelingsbiologie
Translatie regulatie in multicellulaire organismen
eiwit niveaus bepalen celfunctie en gedrag
● transcriptie DNA → mRNA
● translatie mRNA → eiwit (bepaalt hoe cellen en weefsels zich gedragen)
○ voornamelijk belangrijk tijdens de ontwikkeling
○ in het vroege stadium van embry is geen transcriptie
○ al het mRNA wordt gegeven door de moeder aan de eicel
○ afhankelijk van de translatie welke mRNAs worden omgezet tot eiwitten
transcriptie en translatie zijn geen lineair process
● hoeveelheid mRNA is geen maat voor hoeveelheid eiwitten
Wat gebeurt er met het mRNA als het naar het cytoplasma gaat?
● ribosoom herkent het RNA
● ribosomen scannen 5’ van het RNA
● start met transleren bij AUG / ATG
○ 2 helften van het ribosoom komen samen (40S en 60S)
● stopt met transleren bij stopcodon
● 3’ UTR (untranslated region) codeert niet voor eiwit
○ achter het stopcodon
ribosoom: multisubunit complex dat mRNA vertaalt naar eiwit
● bestaan uit RNAs en (ruim 80) eiwitten
● plek waar eiwitten geproduceerd worden
● verreweg de meeste energie in de cel wordt gebruikt door ribosomen om mRNA om
te zetten in eiwitten
, Meet the professor (B-B1MB05) – Suzan Ruijtenberg – Ontwikkelingsbiologie
technieken om translatie te
bestuderen
1. ribosome profiling:
meten van translatie van
alle mRNAs in een cel
● meer ribosomen
op mRNA →
meer eiwitten
tegelijk
gemaakt →
translatie
efficiënter
● vaak hele
organismen
gebruikt voor
profiling
● mRNA heeft een
stukken die niet
getransleerd wordt
● ribosoom beweegt per 3 nucleotiden
● positieve correlatie tussen mRNA en RPFs
● sommige mRNAs worden efficienten getransleerd
2. SunTag systeem: zichtbaar maken en meten van translatie van individuele mRNAs
● normaliter fluorescerende eiwit aan binden
○ maar het duurt lang voordat het eiwit zichtbaar is – nog vouwen
○ translatie is alweer voorbij – ribosoom is al klaar
● SunTag inbouwen (groene sequentie)
● ribosoom transleert eerst het stuk eiwit van SunTag
● in de cellen zit een antilichaam waarvan het GFP al uren geleden gemaakt is
○ antilichaam (groen) bindt aan peptides
○ alle GFP in de cel gaat naar de plek waar getransleerd wordt
○ ophoping van GFP-moleculen op 1 plek (felle stip – kleur)
jj
Translatie regulatie in multicellulaire organismen
eiwit niveaus bepalen celfunctie en gedrag
● transcriptie DNA → mRNA
● translatie mRNA → eiwit (bepaalt hoe cellen en weefsels zich gedragen)
○ voornamelijk belangrijk tijdens de ontwikkeling
○ in het vroege stadium van embry is geen transcriptie
○ al het mRNA wordt gegeven door de moeder aan de eicel
○ afhankelijk van de translatie welke mRNAs worden omgezet tot eiwitten
transcriptie en translatie zijn geen lineair process
● hoeveelheid mRNA is geen maat voor hoeveelheid eiwitten
Wat gebeurt er met het mRNA als het naar het cytoplasma gaat?
● ribosoom herkent het RNA
● ribosomen scannen 5’ van het RNA
● start met transleren bij AUG / ATG
○ 2 helften van het ribosoom komen samen (40S en 60S)
● stopt met transleren bij stopcodon
● 3’ UTR (untranslated region) codeert niet voor eiwit
○ achter het stopcodon
ribosoom: multisubunit complex dat mRNA vertaalt naar eiwit
● bestaan uit RNAs en (ruim 80) eiwitten
● plek waar eiwitten geproduceerd worden
● verreweg de meeste energie in de cel wordt gebruikt door ribosomen om mRNA om
te zetten in eiwitten
, Meet the professor (B-B1MB05) – Suzan Ruijtenberg – Ontwikkelingsbiologie
technieken om translatie te
bestuderen
1. ribosome profiling:
meten van translatie van
alle mRNAs in een cel
● meer ribosomen
op mRNA →
meer eiwitten
tegelijk
gemaakt →
translatie
efficiënter
● vaak hele
organismen
gebruikt voor
profiling
● mRNA heeft een
stukken die niet
getransleerd wordt
● ribosoom beweegt per 3 nucleotiden
● positieve correlatie tussen mRNA en RPFs
● sommige mRNAs worden efficienten getransleerd
2. SunTag systeem: zichtbaar maken en meten van translatie van individuele mRNAs
● normaliter fluorescerende eiwit aan binden
○ maar het duurt lang voordat het eiwit zichtbaar is – nog vouwen
○ translatie is alweer voorbij – ribosoom is al klaar
● SunTag inbouwen (groene sequentie)
● ribosoom transleert eerst het stuk eiwit van SunTag
● in de cellen zit een antilichaam waarvan het GFP al uren geleden gemaakt is
○ antilichaam (groen) bindt aan peptides
○ alle GFP in de cel gaat naar de plek waar getransleerd wordt
○ ophoping van GFP-moleculen op 1 plek (felle stip – kleur)
jj
