Hoofdstuk 12 Gentechnologie komt na microbiologie
Biotechnologie maakt gebruik van micro-organismen in een zeer ruime
context.
Dit laat toe om op industriële schaal een aantal producten te produceren
zoals:
o Antibiotica (penicilline, tetracycline, …)
o Enzymen (glucose isomerasen, proteasen, lipasen, …)
o Voedseladditieven (vitaminen, aminozuren, …)
o Chemicaliën (bioethanol, biodiesel, citroenzuur, aspartaam, …)
Onderdeel: moleculaire biologie
Genetische manipulatie mogelijk in MO en in planten
12.1 Restrictie-enzymen
Cruciale ontdekken in jaren 70
Restrictie-enzym / restrictie endonuclease = eiwit geproduceerd door
bacteriën
Eiwit is in staat bepaalde korte sequentie van 4-6 basen te herkennen in DNA-
molecule daarbinnen op specifieke manier knippen DNA in kleinere
fragmenten opgesplitst
Namen verwijzen naar bacterie waarvan afkomstig : bv ECO R1 E. coli , Taq I
1e RE geïsoleerd uit Thermus aquaticus
Gevonden in bacteriën + verdedigingsfunctie tegen
bacteriofagen
Na injectie viraal DNA direct in stukken geknipt door
bacterieel RE
Bacterieel genoom wordt beschermd (op bepaalde plaatsen
gemethyleerd), zodat knipenzymen daar werkzaam zijn.
Voordeel : men weet exact wat de uiteinden van de DNA-fragmenten zijn
Vaak enkelstrengige overhangen die complementair zijn aan elkaar = sticky
ends
Onmisbaar voor moleculaire biologie
Van verschillende bronnen met hetzelfde RE geknipt DNA fragmenten met
complementaire sticky ends aan elkaar kleven = recombinante DNA-
molecule
DNA mens knippen met ER (gem lengte =3000 bp) milioen fragmenten
Aantal/groote verschild per individu door mutaties knipplaatsen
wegvallen/bijkomen
RFLP’s = restrictie-fragment-lengte polymorfismen = de individuele
verschillen in aantal en plaats van de kinpplaatsen
Toepassingen :
o DNA-fingerprinting
o Kloneren
1
, 12.2 TAQ DNA-polymerase
Taq-polymerase = ander belangrijk enzym dat in bacterie zit
Thermostabiel enzym
DNA-polymerase uit thermofieke bacterie Thermus aquaticus leeft in
warmwaterbronnen + overleeft in kokend water
Sleutelrol bij : PCR-techniek = ploymerase chain reaction + DNA-synthese
Exponentieel vermenigvuldigen van één specifiek DNA -fragment (= target
sequence)
PCR-techniek :
Verschillende cycli na elkaar
Tijdens elke cyclus 3 fasen:
1. Denaturatie dsDNA: stijgen temperatuur dsDNA wordt ssDNA
2. Annealing: dalen temperatuur vasthechten primers aan complementaire
sequenties
3. Extension: stijgen temperatuur aanmaak complementaire DNA-strengen
door Taqpolymerase
DNA-polymerase : eigenschap activiteit start pas als er al een begin is
gemaakt
Aan DNA-polymerase wordt stukje ssDNA gebonden in buurt DNA-gedeelte dat
men wilt vermenigvuldigen
Eerst sequentie kennen van ongeveer 20 basen aan beide kanten DNA stukje
Chemische weg maken stukjes ss DNA die op korte basesequenties passen
= primers
Primers in overmaat toegevoegd aan mengsel A, C, G, T bouwstenen + DNA-
fragment
Primers binden aan ds DNA dsDNA gedenatureerd tot 2 enkelvoudige
strengen t = +90°C
Proces in cycli van verwarmen en afkoelen elke cyclus nieuw DNA-
polymerase toegevoegd
Taq DNA polymerase - stabiel tot boven 90 °C volstaat 1 keer enzym
toevoegen
Hoge kostprijs enzyme groot verschil practische bruikbaarheid
Genetisch gemanipuleerd E. coli-stam in staat recombinant Taq DNA-
polymerase produceren
2
Biotechnologie maakt gebruik van micro-organismen in een zeer ruime
context.
Dit laat toe om op industriële schaal een aantal producten te produceren
zoals:
o Antibiotica (penicilline, tetracycline, …)
o Enzymen (glucose isomerasen, proteasen, lipasen, …)
o Voedseladditieven (vitaminen, aminozuren, …)
o Chemicaliën (bioethanol, biodiesel, citroenzuur, aspartaam, …)
Onderdeel: moleculaire biologie
Genetische manipulatie mogelijk in MO en in planten
12.1 Restrictie-enzymen
Cruciale ontdekken in jaren 70
Restrictie-enzym / restrictie endonuclease = eiwit geproduceerd door
bacteriën
Eiwit is in staat bepaalde korte sequentie van 4-6 basen te herkennen in DNA-
molecule daarbinnen op specifieke manier knippen DNA in kleinere
fragmenten opgesplitst
Namen verwijzen naar bacterie waarvan afkomstig : bv ECO R1 E. coli , Taq I
1e RE geïsoleerd uit Thermus aquaticus
Gevonden in bacteriën + verdedigingsfunctie tegen
bacteriofagen
Na injectie viraal DNA direct in stukken geknipt door
bacterieel RE
Bacterieel genoom wordt beschermd (op bepaalde plaatsen
gemethyleerd), zodat knipenzymen daar werkzaam zijn.
Voordeel : men weet exact wat de uiteinden van de DNA-fragmenten zijn
Vaak enkelstrengige overhangen die complementair zijn aan elkaar = sticky
ends
Onmisbaar voor moleculaire biologie
Van verschillende bronnen met hetzelfde RE geknipt DNA fragmenten met
complementaire sticky ends aan elkaar kleven = recombinante DNA-
molecule
DNA mens knippen met ER (gem lengte =3000 bp) milioen fragmenten
Aantal/groote verschild per individu door mutaties knipplaatsen
wegvallen/bijkomen
RFLP’s = restrictie-fragment-lengte polymorfismen = de individuele
verschillen in aantal en plaats van de kinpplaatsen
Toepassingen :
o DNA-fingerprinting
o Kloneren
1
, 12.2 TAQ DNA-polymerase
Taq-polymerase = ander belangrijk enzym dat in bacterie zit
Thermostabiel enzym
DNA-polymerase uit thermofieke bacterie Thermus aquaticus leeft in
warmwaterbronnen + overleeft in kokend water
Sleutelrol bij : PCR-techniek = ploymerase chain reaction + DNA-synthese
Exponentieel vermenigvuldigen van één specifiek DNA -fragment (= target
sequence)
PCR-techniek :
Verschillende cycli na elkaar
Tijdens elke cyclus 3 fasen:
1. Denaturatie dsDNA: stijgen temperatuur dsDNA wordt ssDNA
2. Annealing: dalen temperatuur vasthechten primers aan complementaire
sequenties
3. Extension: stijgen temperatuur aanmaak complementaire DNA-strengen
door Taqpolymerase
DNA-polymerase : eigenschap activiteit start pas als er al een begin is
gemaakt
Aan DNA-polymerase wordt stukje ssDNA gebonden in buurt DNA-gedeelte dat
men wilt vermenigvuldigen
Eerst sequentie kennen van ongeveer 20 basen aan beide kanten DNA stukje
Chemische weg maken stukjes ss DNA die op korte basesequenties passen
= primers
Primers in overmaat toegevoegd aan mengsel A, C, G, T bouwstenen + DNA-
fragment
Primers binden aan ds DNA dsDNA gedenatureerd tot 2 enkelvoudige
strengen t = +90°C
Proces in cycli van verwarmen en afkoelen elke cyclus nieuw DNA-
polymerase toegevoegd
Taq DNA polymerase - stabiel tot boven 90 °C volstaat 1 keer enzym
toevoegen
Hoge kostprijs enzyme groot verschil practische bruikbaarheid
Genetisch gemanipuleerd E. coli-stam in staat recombinant Taq DNA-
polymerase produceren
2