HOOFDSTUK 2 : PROTEINS
1. Entering the world of nature’s little robots
1.1. Nature’s Beautiful Design : DNA Gently Whispers…To Produce
Nature’s Robots
DNA : de bibliotheek van de cel
DNA gecodeerde informatie functioneel maken 1) transcriptie van DNA tot RNA
2) translatatie van RNA tot eiwit
Eiwitten zijn de kleine machines van de natuur
1.2. ‘Study Structure , Study Function’
2. Amino acids are the building blocks of proteins
2.1 All Amino Acids Share Common Structural Features
1953 : Frederick Sanger bepaalde AZ sequentie van insuline (nobelprijs chemie 1958)
belangrijk : toonde voor het eerst aan dat een proteïne een precies gedefinieerde
aminozuursequentie had dat enkel uit L aminozuren bestond gelinkt door
peptidebindingen(verder werk : elk proteïne precies gedefinieerde aminozuurseq)
20 vss aminozuren worden het meest gevonden in proteïnen en zijn allemaal α - aminozuren
α – aminozuur : centraal koolstofatoom (C α) gelinkt aan aminogroep (NH2/NH3+) ,
carboxylgroep (COOH/COO-) and een R groep (zijketen)
Aminozuren zijn chirale moleculen met de Cα als chiraal centrum
stereoisomeren : L en D aminozuren (enkel de L aminzuren in proteïnen)
ENKEL L AMINOZUREN IN PROTEÏNEN
Voor de specifieke nomenclatuur zie dia 17-19
Naast de zijketen hebben aminozuren twee belangrijke functionele groepen : primair amine
& carboxyl groep
KU allebei geprotoneerd worden
pH waarbij dit gebeurd is afh van de pKa
neutrale pH : bestaat vooral als dipolaire ionen (zwitterionen)
, Amino groep van een aminozuur is minder basisch vergeleken met gemiddelde amino groep
veroorzaakt door elektron wegnemen van de EN zuurstof in carboxylgroep
Carboxylgroep van een aminozuur is minder zuur vergeleken met gemiddelde carboxylgroep
veroorzaakt door elektron wegnemen door elektrofiele, positieve amine groep
Titratiecurves
isoelectric point (pI) = pH waarbij er geen NETTO elektrische lading is
2.2 The 20 Common Amino Acids Can be Classified Based on the
Physicochemical Properties of Their Side Chains
Geel = AZ met hydrofobe
zijketen
Groen = aromatische ZK
Oranje = polaire ZK
Blauw = ZK die bij pH 7 +
geladen zijn
Rood = ZK die bij pH 7 –
geladen zijn
,
1. Entering the world of nature’s little robots
1.1. Nature’s Beautiful Design : DNA Gently Whispers…To Produce
Nature’s Robots
DNA : de bibliotheek van de cel
DNA gecodeerde informatie functioneel maken 1) transcriptie van DNA tot RNA
2) translatatie van RNA tot eiwit
Eiwitten zijn de kleine machines van de natuur
1.2. ‘Study Structure , Study Function’
2. Amino acids are the building blocks of proteins
2.1 All Amino Acids Share Common Structural Features
1953 : Frederick Sanger bepaalde AZ sequentie van insuline (nobelprijs chemie 1958)
belangrijk : toonde voor het eerst aan dat een proteïne een precies gedefinieerde
aminozuursequentie had dat enkel uit L aminozuren bestond gelinkt door
peptidebindingen(verder werk : elk proteïne precies gedefinieerde aminozuurseq)
20 vss aminozuren worden het meest gevonden in proteïnen en zijn allemaal α - aminozuren
α – aminozuur : centraal koolstofatoom (C α) gelinkt aan aminogroep (NH2/NH3+) ,
carboxylgroep (COOH/COO-) and een R groep (zijketen)
Aminozuren zijn chirale moleculen met de Cα als chiraal centrum
stereoisomeren : L en D aminozuren (enkel de L aminzuren in proteïnen)
ENKEL L AMINOZUREN IN PROTEÏNEN
Voor de specifieke nomenclatuur zie dia 17-19
Naast de zijketen hebben aminozuren twee belangrijke functionele groepen : primair amine
& carboxyl groep
KU allebei geprotoneerd worden
pH waarbij dit gebeurd is afh van de pKa
neutrale pH : bestaat vooral als dipolaire ionen (zwitterionen)
, Amino groep van een aminozuur is minder basisch vergeleken met gemiddelde amino groep
veroorzaakt door elektron wegnemen van de EN zuurstof in carboxylgroep
Carboxylgroep van een aminozuur is minder zuur vergeleken met gemiddelde carboxylgroep
veroorzaakt door elektron wegnemen door elektrofiele, positieve amine groep
Titratiecurves
isoelectric point (pI) = pH waarbij er geen NETTO elektrische lading is
2.2 The 20 Common Amino Acids Can be Classified Based on the
Physicochemical Properties of Their Side Chains
Geel = AZ met hydrofobe
zijketen
Groen = aromatische ZK
Oranje = polaire ZK
Blauw = ZK die bij pH 7 +
geladen zijn
Rood = ZK die bij pH 7 –
geladen zijn
,
