METHODEN: SYSTEEMBIOLOGIE EN SYNTHETISCHE BIOLOGIE
Systeembiologie
Systeembiologie = studie van de mechanismen die aan de basis liggen, van complexe biologisch
processen als geïntegreerde systemen van vele interagerende componenten.
Systeembiologie gebruiken om te bepalen hoe een organisme ontstaat en waar het fout loopt. Er
zijn verschillende manieren waarmee we kunnen kijken naar het organisme. Massa informatie
allemaal bij elkaar gaan proberen brengen. Nog een groot verschil tussen genetische info en dan
uiteindelijk het organisme.
We kunnen dit doen voor zowel normale fysiologie al ook pathologie. We willen de biologische
processen zo goed mogelijk begrijpen. Een organisme een bepaalde stimulus geven (groeifactor bv)
en dan kijken wat er gebeurt als deze bindt aan een receptor (hoe gebeurt de binding, wat gebeurt
er na de binding? Welke veranderingen krijgen we in transcripten die tot expressie komen? Deze
transcript veranderingen veranderen eiwitten in de cel (transcriptoom) en hun interacties)
Men gaat deze dingen bekijken en allemaal bij elkaar brengen om zo veel mogelijk informatie te
krijgen over het biologisch systeem als een respons op een verandering in het systeem.
Men gaat meer en meer gaan werken met persoonlijke geneeskunde. Door OMICS en andere
technologiën kan men nagaan waar er een fout zit en op welk niveau. En dan uiteindelijk zien of we
aan dit probleem iets kunnen doen. Dit wordt vooral in de oncologie gebruikt, meer en meer patiënt
specifieke therapie/geneesmiddelen gebruiken.
Men kan verschillende OMICsen bij elkaar doen. Het kan zijn dat we daar niks zinvol uit kunnen
halen. Er is nu een nieuwe vorm van wetenschappen om de systeem biologie hierin te integreren.
Men gaat verschillende programma’s en mathematische modellen gebruiken om dingen te
voorspellen en met verschillende dingen rekening te houden. Men kan zo bepaalde chemische
reacties laten doorgaan en andere niet. men kan dan grafische modellen maken om het allemaal wat
beter te proberen begrijpen. Hiermee kan men dan predicties en simualties maken en vergelijken
met experimentele gegevens.
Hoe langer hoe meer dat dit gebruikt wordt. meer en meer geïntegreerde OMICs systemen. Dit
heeft een enorm groot potentieel, kan gebruikt worden voor ziektes die door veel factoren
veroorzaakt worden. Er is een metaliteitswitch nodig van de wetenschappers, wetenschappers gaan
vaak focussen op 1 gen en zich daarop toespitsen, zo heeft bijna elk labo zijn eigen gen.
Bioinformatica: is heel belangrijk in de toekomst. Alles wordt zodanig gespecialiseerd dat het heel
ingewikkeld wordt, veel mensen nodig die interdisiplinair zijn.
Synthetische biologie
Vrij nieuwe wetenschappen. Men wilt nieuwe organismen ontwikkelen die eigenlijk niet bestaan, die
functies kunnen aannemen die wij willen gebruiken. Milieu gerelateerd of geneeskunde gerelateerd
om zo vorderingen te kunnen maken. lange oligo’s aanmalen, dat nieuwe genoom aanmaakt dat
men dan in een bestaand organisme inbrengt. → ethische aspecten komen hier ter sprake.
1
Systeembiologie
Systeembiologie = studie van de mechanismen die aan de basis liggen, van complexe biologisch
processen als geïntegreerde systemen van vele interagerende componenten.
Systeembiologie gebruiken om te bepalen hoe een organisme ontstaat en waar het fout loopt. Er
zijn verschillende manieren waarmee we kunnen kijken naar het organisme. Massa informatie
allemaal bij elkaar gaan proberen brengen. Nog een groot verschil tussen genetische info en dan
uiteindelijk het organisme.
We kunnen dit doen voor zowel normale fysiologie al ook pathologie. We willen de biologische
processen zo goed mogelijk begrijpen. Een organisme een bepaalde stimulus geven (groeifactor bv)
en dan kijken wat er gebeurt als deze bindt aan een receptor (hoe gebeurt de binding, wat gebeurt
er na de binding? Welke veranderingen krijgen we in transcripten die tot expressie komen? Deze
transcript veranderingen veranderen eiwitten in de cel (transcriptoom) en hun interacties)
Men gaat deze dingen bekijken en allemaal bij elkaar brengen om zo veel mogelijk informatie te
krijgen over het biologisch systeem als een respons op een verandering in het systeem.
Men gaat meer en meer gaan werken met persoonlijke geneeskunde. Door OMICS en andere
technologiën kan men nagaan waar er een fout zit en op welk niveau. En dan uiteindelijk zien of we
aan dit probleem iets kunnen doen. Dit wordt vooral in de oncologie gebruikt, meer en meer patiënt
specifieke therapie/geneesmiddelen gebruiken.
Men kan verschillende OMICsen bij elkaar doen. Het kan zijn dat we daar niks zinvol uit kunnen
halen. Er is nu een nieuwe vorm van wetenschappen om de systeem biologie hierin te integreren.
Men gaat verschillende programma’s en mathematische modellen gebruiken om dingen te
voorspellen en met verschillende dingen rekening te houden. Men kan zo bepaalde chemische
reacties laten doorgaan en andere niet. men kan dan grafische modellen maken om het allemaal wat
beter te proberen begrijpen. Hiermee kan men dan predicties en simualties maken en vergelijken
met experimentele gegevens.
Hoe langer hoe meer dat dit gebruikt wordt. meer en meer geïntegreerde OMICs systemen. Dit
heeft een enorm groot potentieel, kan gebruikt worden voor ziektes die door veel factoren
veroorzaakt worden. Er is een metaliteitswitch nodig van de wetenschappers, wetenschappers gaan
vaak focussen op 1 gen en zich daarop toespitsen, zo heeft bijna elk labo zijn eigen gen.
Bioinformatica: is heel belangrijk in de toekomst. Alles wordt zodanig gespecialiseerd dat het heel
ingewikkeld wordt, veel mensen nodig die interdisiplinair zijn.
Synthetische biologie
Vrij nieuwe wetenschappen. Men wilt nieuwe organismen ontwikkelen die eigenlijk niet bestaan, die
functies kunnen aannemen die wij willen gebruiken. Milieu gerelateerd of geneeskunde gerelateerd
om zo vorderingen te kunnen maken. lange oligo’s aanmalen, dat nieuwe genoom aanmaakt dat
men dan in een bestaand organisme inbrengt. → ethische aspecten komen hier ter sprake.
1
