Samenvatting Biochemie En Moleculaire Biologie: deel Biochemie

BIOCHEMIE
SAMENVATTING

H1
AMINOZUREN
Soorten
- Niet-polaire, alifatische R-groep1
- Aromatische R-groepen2
- Polaire, ongeladen R-groep3
- Positief geladen R-groep4
- Negatief geladen R-groep5
1
Niet-polaire, alifatische R-groep
Aminozuur Eigenschappen Structuur
Glycine - Niet-asymmetrisch (enige)
- Zeer klein
- Grote conformationele flexibiliteit
- Sterke rotaties (in zijketen)
- Weinig hydrofobe reacties




Alanine - Non-polair en hydrofoob
- Geen functionele groepen
- Inert en alifatisch
- zijketens willen samen clusteren in
eiwitten " hydrofobe reacties " stabiele
structuur
- Neemt ruimte in




Valine ‘’ ‘’




Leucine ‘’ ‘’



1

, Isoleucine ‘’ ‘’
- Extra assymetrisch centrum




Methionine ‘’ ‘’
- Thioether (S)




2
Aromatische R-groepen
Aminozuur Eigenschappen Structuur
Fenylalanine - Zeer hydrofoob
- Zijring lijkt op benzeenring
- Weinig reactief
- Apolair




2

, Tyrosine - Intermediair polair
- Deelname aan H-bruggen
- Fosforylatieplaats
- pKR: 10




Tryptofaan - Intermediair polair
- Grootste zijketen (van alle 20)
- Zeldzaam




Absorberen Uv-licht
- M.n. tyrosine en tryptofan
- Door aromatische r-groep
- Hierdoor
• Bepalen van eiwitconcentratie
- Detector
• Meet intensiteit licht
3
polaire, ongeladen R-groepen
Aminozuur Eigenschappen Structuur
Cysteïne - Sulfhydryle R-groep
- Polair
- pKR: 8

Oxidatie
- Vorming cystine
- Vorming disulfide(brug)




Ionisatie
- SH " S- + H+
" Ontstaan van nucleofiele zwavelgroep


3

, " Belangrijk voor katalytisch centrum
enzymen




Serine - Polair
- H-brug (als acceptor en donor)
- Fosforylatie mogelijk voor cellulaire
signaaltransductie




Threonine ‘’ ‘’




Asparagine - Amide van asparaginezuur
- Polair
- H-brug (als acceptor en donor)




Glutamine - Amide van glutaminezuur
- Polair
- H-brug (als acceptor en donor)




4